DS
Daqing Sun
Author with expertise in Exosome Biology and Function in Intercellular Communication
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(50% Open Access)
Cited by:
651
h-index:
23
/
i10-index:
42
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Mediation of tubuloglomerular feedback by adenosine: Evidence from mice lacking adenosine 1 receptors

Daqing Sun et al.Aug 14, 2001
Adenosine is a determinant of metabolic control of organ function increasing oxygen supply through the A2 class of adenosine receptors and reducing oxygen demand through A1 adenosine receptors (A1AR). In the kidney, activation of A1AR in afferent glomerular arterioles has been suggested to contribute to tubuloglomerular feedback (TGF), the vasoconstriction elicited by elevations in [NaCl] in the macula densa region of the nephron. To further elucidate the role of A1AR in TGF, we have generated mice in which the entire A1AR coding sequence was deleted by homologous recombination. Homozygous A1AR mutants that do not express A1AR mRNA transcripts and do not respond to A1AR agonists are viable and without gross anatomical abnormalities. Plasma and urinary electrolytes were not different between genotypes. Likewise, arterial blood pressure, heart rates, and glomerular filtration rates were indistinguishable between A1AR(+/+), A1AR(+/-), and A1AR(-/-) mice. TGF responses to an increase in loop of Henle flow rate from 0 to 30 nl/min, whether determined as change of stop flow pressure or early proximal flow rate, were completely abolished in A1AR(-/-) mice (stop flow pressure response, -6.8 +/- 0.55 mmHg and -0.4 +/- 0.2 in A1AR(+/+) and A1AR(-/-) mice; early proximal flow rate response, -3.4 +/- 0.4 nl/min and +0.02 +/- 0.3 nl/min in A1AR(+/+) and A1AR(-/-) mice). Absence of TGF responses in A1AR-deficient mice suggests that adenosine is a required constituent of the juxtaglomerular signaling pathway. A1AR null mutant mice are a promising tool to study the functional role of A1AR in different target tissues.
0
Citation401
0
Save
0

Precise annotation of human, chimpanzee, rhesus macaque and mouse mitochondrial genomes using 5′ and 3′ end small RNAs

Zhi Cheng et al.Jul 18, 2019
Using 5′ and 3′ end small RNAs, we annotated human, chimpanzee, rhesus macaque and mouse mitochondrial genomes at 1 base-pair (bp) resolution to cover both strands of the mammalian mitochondrial genome entirely without leaving any gaps or overlaps. The precise annotation of all coding and non-coding genes (e.g. ncMT1, MDL2 and MDL1AS) led to the discovery of novel functions and mechanisms of mitochondrion. In this study, we defined the conserved sequence block (CSB) region to span five CSBs (CSB1, CSB2, CSB3, LSP and HSP) and identified the motifs of five CSBs in the mitochondrial displacement loop (D-loop) regions of 52 mammals. The conserved arrangement of these five CSBs in 17 primates inspired us to investigate the function of the mtDNA D-loop, which has been puzzling scientists for more than 50 years. We found that 5′ sRNAs of MDL1AS control the expression levels of mitochondrial genes as a whole by a negative feedback mechanism. Thus, the precise annotations of three CSBs (CSB2, LSP and HSP) in more species will help to understand the function of the mtDNA D-loop. The precision annotation of animal mitochondrial genomes also provides abundant information for studying the molecular phylogenetics and evolution of animals.
1

Single-cell transcriptome analysis reveals mesenchymal stem cells in cavernous hemangioma

Fulong Ji et al.Sep 3, 2021
Abstract A cavernous hemangioma, well-known as vascular malformation, is present at birth, grows proportionately with the child, and does not undergo regression. Although a cavernous hemangioma has well-defined histopathological characteristics, its origin and formation remain unknown. In the present study, we characterized the cellular heterogeneity of cavernous hemangioma using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq). The main contribution of this study is the discovery of mesenchymal stem cells (MSCs) that cause tumour formation in cavernous hemangioma and we propose that these MSCs may be abnormally differentiated or incompletely differentiated from epiblast stem cells. Other new findings include the responsive ACKR1 positive endothelial cell (ACKR1+EC) and BTNL9 positive endothelial cell (BTNL9+EC) and the BTNL9-caused checkpoint blockade enhanced by the CXCL12-CXCR4 signalling. The activated CD8+T and NK cells may highly express CCL5 for their infiltration in cavernous hemangiomas, independent on the tumor cell-derived CCL5-IFNG - CXCL9 pathway. The highly co-expression of CXCR4 and GZMB suggested that plasmacytoid dendritic cells (pDCs) function for anti-tumour as CD8+T cells in cavernous hemangiomas. The oxidised low-density lipoprotein (oxLDL) in the TME of cavernous hemangiomas may play an important role as a signalling molecular in the immune responses. Notably, we propose that oxLDL induces the oxLDL-OLR1-NLRP3 pathway by over-expression of OLR1 in M1-like macrophages, whereas oxLDL induces the oxLDL-SRs-C1q (SRs are genes encoding scavenger receptors of oxLDL except OLR1 ) pathway by over-expression of other scavenger receptors in M2-like macrophages. The present study revealed the origin of cavernous hemangiomas and discovered marker genes, cell types and molecular mechanisms associated with the origin, formation, progression, diagnosis or therapy of cavernous hemangiomas. The information from the present study makes important contributions to the understanding of cavernous hemangioma formation and progression and facilitates the development of gold standard for molecular diagnosis and effective drugs for treatment.
0

Urinary exosomal microRNA-200 family: diagnostic biomarkers for Kawasaki disease and their link to inflammatory markers

Yuzhong Wang et al.Nov 29, 2024
Abstract Objective: The microRNA-200 family plays a key role in inflammatory and vascular processes, making it a relevant target for Kawasaki disease, a vasculitis with coronary complications. This study aimed to evaluate the diagnostic potential of urinary exosomal microRNA-200 family members in Kawasaki disease patients. Methods: Urine samples from 15 Kawasaki disease patients and 15 healthy controls underwent total exosome isolation and high-throughput sequencing. Differential expression of microRNA-200 family members was validated using quantitative real-time polymerase chain reaction. Diagnostic potential was assessed via receiver operating characteristic analysis, and correlations with clinical parameters were evaluated using Spearman correlation. Results: High-throughput sequencing identified upregulation of microRNA-429, microRNA-200b-3p/5p, microRNA-141-3p, microRNA-200a-3p/5p, and microRNA-200c-3p in Kawasaki disease patients. We confirmed significant upregulation of microRNA-200a-3p/5p, microRNA-200b-3p/5p, and microRNA-429, with receiver operating characteristic analysis showing high diagnostic potential for these microRNAs (area under the curves of 0.844, 0.791, 0.942, 0.842, and 0.898, respectively) and a combined analysis yielding a perfect area under the curve of 1.000. MicroRNA-141 and microRNA-200c-3p/5p, however, showed no significant diagnostic value. MicroRNA-200a-3p and microRNA-200a-5p were positively correlated with white blood cells, platelet counts, and C-reactive protein, while microRNA-200b-3p and microRNA-429 were positively correlated with white blood cells, platelet counts, erythrocyte sedimentation rate, and C-reactive protein. microRNA-200b-5p showed moderate correlations with platelet counts and erythrocyte sedimentation rate. Conclusion: Urinary exosomal microRNA-200 family members, especially microRNA-200a-3p/5p, microRNA-200b-3p/5p, and microRNA-429, demonstrate strong diagnostic potential for Kawasaki disease, correlating with key inflammatory markers. MicroRNA-141 and microRNA-200c did not demonstrate significant diagnostic utility.