HS
Hongqiang Sun
Author with expertise in Sleep and Insomnia
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(50% Open Access)
Cited by:
1
h-index:
24
/
i10-index:
48
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genome-wide association study identifies common genetic risk factors for alcohol, heroin and methamphetamine dependence

Yan Sun et al.Dec 26, 2018
Abstract Background Common molecular and cellular foundations underlie different types of substance dependence (SD). However direct evidence for common genetic factors of SD is lacking. Here we aimed to identify specific genetic variants that are shared between alcoholism, heroin and methamphetamine dependence. Methods We first conducted a combined case-control genome-wide association analysis (GWAS) of 521 alcoholic, 1,026 heroin and 1,749 methamphetamine patients and 2,859 healthy controls. We then replicated the significant loci using an independent cohort (146 alcoholic, 1,045 heroin, 763 methamphetamine and 1,904 controls). Second, we examined the genetic effects of these identified SNPs on gene expression, addiction characteristics and brain images (gray and white matter). Furthermore, we investigated the effects of these genetic variants on addiction behaviors using self-administration rat models. Results We identified and validated four genome-wide significant loci in the combined cohorts in the discovery stage: ADH1B rs1229984 (P=6.45×10 −10 ), ANKS1B rs2133896 (P=4.09×10 −8 ), AGBL4 rs147247472 (P=4.30×10 −8 ) and CTNNA2 rs10196867 (P=4.67×10 −8 ). Association results for each dependence group showed that ADH1B rs1229984 was only associated with alcoholism, while the other three loci were associated with heroin, methamphetamine addiction and alcoholism respectively. Variants that were strongly linked to rs2133896 affected ANKS1B gene expression, heroin use frequency and interacted with heroin dependence to affect gray matter of the left calcarine and white matter of the right superior longitudinal fasciculus. In addition, the reduced anks1b expression in the ventral tegmental area increased addiction vulnerability for heroin and methamphetamine in self-administration rat models. Conclusion Our findings revealed several novel genome-wide significant SNPs and genes that synchronously affected the vulnerability and phenotypes for alcoholism, heroin and MA dependence. These findings could shed light on the root cause and the generalized vulnerability for SD.
0
Citation1
0
Save
0

Mechanism of zju‐miR156c‐mediated network in regulating witches' broom symptom of Chinese jujube

Yunjie Wang et al.Nov 1, 2024
Abstract Jujube witches' broom, caused by phytoplasma, is a destructive disease of Chinese jujube. Studies have shown that zju‐miR156s play an important role in phytoplasma infection in jujube, but the regulatory mechanism between zju‐miR156c and witches' broom remains unexplored. In the current study, miRNA‐seq and gene expression analysis showed that zju‐miR156c was more highly induced in infected jujube plants than the other miRNAs and its target gene was ZjSPL3 . In addition, the expression levels of thymidylate kinase gene ( TMK JWB ) and secreted jujube protein (SJP1 JWB ) in diseased materials were higher than those in healthy controls. The expression level of zju‐miR156c was significantly upregulated, while ZjSPL3 was sharply downregulated and the content of cytokinin (CTK) significantly increased. Overexpression of zju‐miR156c in Arabidopsis significantly reduced the expression of AtSPL10 (homologous gene of ZjSPL3 ) but increased the content of CTK, and the transgenic plants exhibited witches' broom symptoms. In addition, yeast two‐hybrid and co‐immunoprecipitation assays confirmed that SJP1 JWB interacted with ZjERF18. Yeast one‐hybrid analysis showed that ZjERF18 could interact with the promoter of zju‐MIR156c. In conclusion, our results demonstrated a novel pathogenic module of ZjERF18‐zju‐miR156c‐ZjSPL3‐CTK has an important function in the formation of witches' broom caused by SJP1 JWB .
0

Exploring gut microbiota diurnal fluctuation in alcohol-dependent patients with sleep disturbance

Kangqing Zhao et al.Nov 19, 2024
Introduction. Alcohol dependence (AD) and sleep disturbance (SD) independently affect gut microbiota, potentially disrupting the circadian rhythm of the microbiota and the host. However, the impact of SD on the composition and rhythmicity of gut flora in AD patients remains poorly understood. Gap Statement. Characteristics of gut flora and diurnal oscillations in AD patients experiencing SD are unknown. Aim. This study aims to explore alterations in gut flora and diurnal oscillations in AD patients experiencing SD. Methodology. Thirty-two AD patients and 20 healthy subjects participated, providing faecal samples at 7 : 00 AM, 11 : 00 AM, 3 : 00 PM and 7 : 00 PM for gut microbiota analysis using 16S rDNA sequencing. AD patients were further categorized into those with poor sleep (ADwPS) and those with good sleep (ADwGS) for further analyses. Results. The ADwPS group demonstrated elevated levels of anxiety, depression and withdrawal severity compared to the ADwGS group (all P <0.05). The β-diversity of gut microbiota in the ADwPS group differed from that in the ADwGS group ( P <0.05). Bacterial abundances at various taxonomic levels, including Cyanobacteria and Pseudomonadales, differed between the ADwPS and ADwGS groups (all P <0.05). Utilizing unweighted UniFrac analysis, the β-diversity of gut microbiota in the ADwPS group demonstrated robust diurnal oscillation ( P <0.05), whereas this pattern was statistically insignificant in the ADwGS group. Notably, the abundance of pathogenic bacteria like Pseudomonadales and Pseudomonadaceae exhibited marked diurnal fluctuation in the ADwPS group (all P <0.05). Conclusion. SD in AD patients extends beyond alcohol-induced alterations, impacting gut microbiota composition, function and diurnal oscillation patterns. This highlights its add-on influence, supplementing AD-related changes.