1. Evidence-based management of natural populations under strong human influence frequently requires not only estimates of survival but also knowledge about how much mortality is due to anthropogenic versus natural causes. This is the case particularly when individuals vary in their vulnerability to different causes of mortality due to traits, life-history stages, or locations.2. Here, we estimated harvest and background (other cause) mortality of a landlocked migratory salmonid over half a century. In doing so, we quantified among-individual variation in vulnerability to cause-specific mortality resulting from differences in body size and spawning location relative to a hydropower dam.3. We constructed a multistate mark-recapture model to estimate harvest and background mortality hazard rates as functions of a discrete state (spawning location) and an individual time-varying covariate (body size). We further accounted for among-year variation in mortality and migratory behavior and fit the model to a unique 50-year time-series of mark-recapture-recovery data on brown trout ( Salmo trutta ) in Norway.4. Harvest mortality was highest for intermediate-sized trout, and outweighed background mortality for most of the observed size range. Background mortality decreased with body size for trout spawning below the dam and increased for those spawning above. All vital rates varied substantially over time, but a trend was evident only in estimates of fishers’ reporting rate, which decreased from over 50% to less than 10% throughout the study period.5. We highlight the importance of body size for cause-specific mortality and demonstrate how this can be estimated using a novel hazard rate parameterisation for mark-recapture models. Our approach allows estimating effects of individual traits and environment on cause-specific mortality without confounding, and provides an intuitive way to estimate temporal patterns within and correlation among different mortality sources.

Abstract Spawning locations of migratory fish influence the environmental and oceanographic fate of eggs and larvae. However, we have an incomplete understanding of how and why realized spawning locations vary. We quantified the yearly variation in spawning location for Barents Sea capelin ( Mallotus villosus ) within the recognized spawning areas along the coast of northern Norway and Murman. Furthermore, we tested whether water temperature, sea ice cover, predation and capelin fisheries are associated with spawning locations. Estimated spatial variation in spawning longitude used data from Soviet‐Russian ichthyoplankton surveys from 1959 to 1993 and a bootstrap procedure. The mean spawning area along the coast was then calculated by combining larvae observations with backtracking a larvae drift model from potential spawning areas. We fitted a generalized additive model (GAM) to assess the effects of environmental conditions on these drift‐corrected spawning longitudes. Capelin's mean yearly spawning location varied substantially across the study period. An increase in immature cod biomass, a major predator of capelin, during the spawning migration period in winter and early spring corresponds to more eastward capelin spawning. The eastward shift in mean spawning longitude seems to reach an eastern limit at high immature cod biomass. Sea temperature, sea ice cover and capelin fisheries were not associated with mean capelin spawning longitude. We show that the realized spawning areas for capelin are related to cod biomass, potentially through cod predation depleting and/or acting as a migration barrier for mature capelin.