Abstract How deadly fungal pathogens overcome mammalian innate immunity is largely unknown. Cryptococcus neoformans , the most common cause of fungal meningitis, induces a pathogenic type 2 response characterized by pulmonary eosinophilia and alternatively activated macrophages. Using forward genetics, we identified a fungal secreted protein, Cpl1, necessary and sufficient to enhance alternative activation of primary macrophages in vitro . Cpl1-enhanced polarization requires Toll-like receptor 4, a known mediator of allergen-induced type 2 responses. Cpl1 is essential for virulence, drives polarization of interstitial macrophages in vivo , and requires type 2 cytokine signaling for its impact on infectivity. C. neoformans selectively associates with polarized interstitial macrophages during infection, supporting a direct hostpathogen interaction. This work identifies a secreted effector produced by a human fungal pathogen that reprograms innate immunity to enable tissue infection. One sentence summary Identification of a secreted fungal effector that promotes virulence by enhancing type 2 inflammation

Hard ticks interface with diverse microbes while feeding on vertebrate hosts. We previously discovered that ticks horizontally acquired an antimicrobial toxin gene from bacteria known as domesticated amidase effector 2 ( dae2 ). Here we show that this effector from the tick disease vector Ixodes scapularis (Dae2 Is ) is delivered to the host bite site via saliva and that its structural and biochemical divergence from bacterial homologs results in an expanded targeting range to include host skin microbes. Upon disruption of dae2Is , we found higher loads of skin-associated staphylococci within ticks, adversely affecting their fitness. In contrast, Dae2 Is has no intrinsic lytic activity against Borrelia burgdorferi , the tick-borne pathogen of Lyme disease. Our observations suggest ticks have evolved to preferentially resist opportunistic pathogens, such as host skin commensals, while tolerating their own symbionts. These results highlight a unique interkingdom interface between blood-feeding vectors, hosts, and their associated microbes where incompatible host-microbe interactions lead to disease.### Competing Interest StatementThe authors have declared no competing interest.

ABSTRACT Borrelia burgdorferi ( Bb ), the causative agent of Lyme disease, adapts to vastly different environments as it cycles between tick vector and vertebrate host. During a tick bloodmeal, Bb alters its gene expression to prepare for vertebrate infection; however, the full range of transcriptional changes that occur over several days inside of the tick are technically challenging to capture. We developed an experimental approach to enrich Bb cells to longitudinally define their global transcriptomic landscape inside nymphal Ixodes scapularis ticks during a transmitting bloodmeal. We identified 192 Bb genes that substantially change expression over the course of the bloodmeal from one to four days after host attachment. The majority of upregulated genes encode proteins found at the cell envelope or proteins of unknown function, including 45 outer surface lipoproteins embedded in the unusual protein-rich coat of Bb . As these proteins may facilitate Bb interactions with the host, we utilized mass spectrometry to identify candidate tick proteins that physically associate with Bb . The Bb enrichment methodology along with the ex vivo Bb transcriptomes and candidate tick interacting proteins presented here provide a resource to facilitate investigations into key determinants of Bb priming and transmission during the tick stage of its unique transmission cycle.