Abstract The rapid spread of new SARS-CoV-2 variants needs the development of rapid tools for predicting the affinity of the mutated proteins responsible for the infection, i.e., the SARS-CoV-2 spike protein, for the human ACE2 receptor, aiming to understand if a variant can be more efficient in invading host cells. Here we show how our computational pipeline, previously used for studying SARS-CoV-2 spike receptor binding domain (RBD)/ACE2 interactions and pre-/post-fusion conformational changes, can be used for predicting binding affinities of the human ACE2 receptor for the spike protein RBD of the characterized infectious variants of concern/interest B.1.1.7-UK (carrying the mutations N501Y, S494P, E484K at the RBD), P.1-Japan/Brazil (RBD mutations: K417N/T, E484K, N501Y), B.1.351-South Africa (RBD mutations: K417N, E484K, N501Y), B.1.427/B.1.429-California (RBD mutations: L452R), the B.1.141 variant (RBD mutations: N439K), and the recent B.1.617.1-India (RBD mutations: L452R; E484Q) and the B.1.620 (RBD mutations: S477N; E484K). Furthermore, we searched for ACE2 structurally related proteins that might be involved in interactions with the SARS-CoV-2 spike protein, in those tissues showing low ACE2 expression, revealing two new proteins, THOP1 and NLN, deserving to be investigated for their possible inclusion in the group of host-cell entry factors responsible for host-cell SARS-CoV-2 invasion and immunity response.

The metabolic interplay between macrophages and cancer cells mirrors the plasticity of both kinds of cells, which adapt to the microenvironment by sustaining cell growth and proliferation. In this way, cancer cells induce macrophage polarization, and, on the other hand, tumor-associated macrophages (TAMs) contribute to the survival of cancer cells. In a simplified manner, macrophages can assume two opposite subtypes: M1, pro-inflammatory and anti-tumor phenotype, and M2, anti-inflammatory and protumor phenotype. How do cancer cells induce macrophage polarization? Any actor involved in tumor growth, including the mitochondria, releases molecules into the tumor microenvironment (TME) that trigger a subtype transition. These metabolic changes are the primary cause of this polarization. Hepatocellular carcinoma (HCC), the prevalent type of liver primary tumor, is characterized by cells with extensive metabolic adaptions due to high flexibility in different environmental conditions. This review focuses on the main metabolic features of M1 and M2 macrophages and HCC cells underlying their metabolic behavior in response to TME.

Journal Article Functional coronary assessment in angina with intermediate coronary stenosis: the #FullPhysiology approach Get access Antonio Maria Leone, Antonio Maria Leone Center of Excellence of Cardiovascular Sciences, Ospedale Isola Tiberina—Gemelli Isola, Via di Ponte Quattro Capi 39, 00186 Rome, ItalyUniversità Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Corresponding author. Email: [email protected], [email protected], [email protected] https://orcid.org/0000-0002-1276-9883 Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Domenico Galante, Domenico Galante Center of Excellence of Cardiovascular Sciences, Ospedale Isola Tiberina—Gemelli Isola, Via di Ponte Quattro Capi 39, 00186 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Andrea Viceré, Andrea Viceré Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Andrea Marrone, Andrea Marrone Cardiology Unit, Azienda Ospedaliero Universitaria di Ferrara, Via Aldo Moro 8, 44124 Cona, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Filippo Maria Verardi, Filippo Maria Verardi Cardiology Unit, Azienda Ospedaliero Universitaria di Ferrara, Via Aldo Moro 8, 44124 Cona, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Chiara Giuliana, Chiara Giuliana Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Ciro Pollio Benvenuto, Ciro Pollio Benvenuto Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Vincenzo Viccaro, Vincenzo Viccaro Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Simona Todisco, Simona Todisco Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Andrea Erriquez, Andrea Erriquez Cardiology Unit, Azienda Ospedaliero Universitaria di Ferrara, Via Aldo Moro 8, 44124 Cona, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar ... Show more Simone Biscaglia, Simone Biscaglia Cardiology Unit, Azienda Ospedaliero Universitaria di Ferrara, Via Aldo Moro 8, 44124 Cona, Italy https://orcid.org/0000-0001-6074-2370 Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Cristina Aurigemma, Cristina Aurigemma Department of Cardiovascular Sciences, Fondazione Policlinico Agostino Gemelli IRCCS, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy https://orcid.org/0000-0001-6391-422X Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Enrico Romagnoli, Enrico Romagnoli Department of Cardiovascular Sciences, Fondazione Policlinico Agostino Gemelli IRCCS, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy https://orcid.org/0000-0003-1611-7708 Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Rocco Antonio Montone, Rocco Antonio Montone Department of Cardiovascular Sciences, Fondazione Policlinico Agostino Gemelli IRCCS, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Michele Basile, Michele Basile Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, ItalyAlta Scuola di Economia e Management dei Sistemi Sanitari, Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Eugenio Di Brino, Eugenio Di Brino Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, ItalyAlta Scuola di Economia e Management dei Sistemi Sanitari, Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Filippo Rumi, Filippo Rumi Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, ItalyAlta Scuola di Economia e Management dei Sistemi Sanitari, Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Gennaro Capalbo, Gennaro Capalbo Center of Excellence of Cardiovascular Sciences, Ospedale Isola Tiberina—Gemelli Isola, Via di Ponte Quattro Capi 39, 00186 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Carlo Trani, Carlo Trani Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, ItalyDepartment of Cardiovascular Sciences, Fondazione Policlinico Agostino Gemelli IRCCS, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Francesco Burzotta, Francesco Burzotta Università Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, ItalyDepartment of Cardiovascular Sciences, Fondazione Policlinico Agostino Gemelli IRCCS, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Filippo Crea, Filippo Crea Center of Excellence of Cardiovascular Sciences, Ospedale Isola Tiberina—Gemelli Isola, Via di Ponte Quattro Capi 39, 00186 Rome, ItalyUniversità Cattolica del Sacro Cuore, Largo Agostino Gemelli 1, 00168 Rome, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Italo Porto, Italo Porto Cardiovascular Disease Unit, IRCCS Policlinic Hospital San Martino, IRCCS Italian Cardiovascular Network, Largo Rosanna Benzi 10, 16132 Genoa, ItalyDepartment of Internal Medicine, University of Genoa, Largo Rosanna Benzi 10, 16132 Genoa, Italy https://orcid.org/0000-0002-9854-5046 Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar Gianluca Campo Gianluca Campo Cardiology Unit, Azienda Ospedaliero Universitaria di Ferrara, Via Aldo Moro 8, 44124 Cona, Italy Search for other works by this author on: Oxford Academic PubMed Google Scholar European Heart Journal, ehae926, https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehae926 Published: 10 January 2025 Article history Received: 11 July 2024 Revision received: 06 October 2024 Accepted: 17 December 2024 Published: 10 January 2025