DB
Dhruba Bhattacharyya
Author with expertise in Network Intrusion Detection and Defense Mechanisms
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
15
(13% Open Access)
Cited by:
2,158
h-index:
37
/
i10-index:
98
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
2

Integrative analysis identified common and unique molecular signatures in hepatobiliary cancers

Nabanita Roy et al.Oct 7, 2021
Abstract Hepatobiliary cancers (HBCs) are the most aggressive and sixth most diagnosed cancers globally. Biomarkers for timely diagnosis and targeted therapy in HBCs are still limited. Considering the gap, our objective is to identify unique and overlapping molecular signatures associated with HBCs. We analyzed publicly available transcriptomic datasets on Gallbladder cancer (GBC), Hepatocellular carcinoma (HCC), and Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) to identify potential biomarkers using integrative systems approaches. An effective Common and Unique Molecular Signature Identification (CUMSI) approach has been developed, which contains analysis of differential gene expression (DEG), gene co-expression networks (GCN), and protein-protein interactions (PPIs) networks. Functional analysis of the DEGs unique for GBC, HCC, and ICC indicated that GBC is associated with cellular processes, HCC is associated with immune signaling pathways, and ICC is associated with lipid metabolic pathways. Our findings shows that the hub genes and pathways identified for each individual cancer type of the HBS are related with the primary function of each organ and each cancer exhibit unique expression patterns despite being part of the same organ system.
2
Citation1
0
Save
0

Designing efficient patient‐centric smart contracts for healthcare ecosystems with access control capabilities

Kausthav Kalita et al.Jun 7, 2024
Abstract Electronic medical records are a patient's digital asset that enhances the information available to doctors for tracking their patients' health. When this information is stored in a secure environment, health examination reports can serve as a dependable repository for thorough observation of a patient's well‐being. However, it is crucial for the owner to have control over access to these repositories. In this scenario, a blockchain ecosystem with appropriate access control mechanisms can help create a distributed and decentralized storage platform to ensure the safety and security of data. Developing cost‐effective smart contracts and creating clear design diagrams to represent them are essential for establishing such an ecosystem. This paper introduces a smart contract for the Ethereum blockchain that allows an owner to maintain control over their data. The paper presents a diagram for visually representing the modules within our smart contract, providing readers with a clearer understanding of the access control techniques utilized in implementing our strategies. Our smart contract offers clinicians a valuable means of accessing historical data to promptly evaluate a patient's health in emergency situations. We showcase its efficacy by illustrating how it streamlines insurance claims, where it verifies the patient's coverage and automatically authorizes medical expense payments. Lastly, a study is presented to showcase an effective method of storing the ingested data within the Ethereum network. The suggested approach allows restrictions on data visibility based on the viewer's accessibility through identity‐based access control achieved using additional structures in smart contracts. These structures store filtered records accessible to users based on their viewing privileges. The simulated test bed results support the efficiency of using smart contracts with additional structures in terms of gas consumption when compared to those that use a single structure for read and write operations.
0

Integrative ceRNA Network Analysis Identifies Unique and Shared Molecular Signatures of Bipolar Disorder and Schizophrenia

Rahul Bharadwaj et al.May 30, 2024
Bipolar Disorder (BPD) and Schizophrenia (SCZ) are complex psychiatric disorders with shared symptomatology and genetic risk factors. Understanding the molecular mechanisms underlying these disorders is crucial for refining diagnostic criteria and guiding targeted treatments. In this study, publicly available RNA-seq data from post-mortem samples of the basal ganglia's striatum were analyzed using an integrative computational approach to identify differentially expressed (DE) transcripts associated with SCZ and BPD. The analysis aimed to reveal both shared and distinct genes and long non-coding RNAs (lncRNAs) and to construct ceRNA networks within the striatum. Furthermore, the functional implications of these identified transcripts are explored, alongside their presence in established databases such as BipEx and SCHEMA. A significant outcome of our analysis was the identification of 21 DEmRNAs and 1 DElncRNA shared between BPD and SCZ across the Caudate, Putamen, and Nucleus Accumbens. Another noteworthy finding was the identification of Hub nodes within the ceRNA networks that were linked to major psychosis. Particularly, MED19, HNRNPC, MAGED4B, KDM5A, GOLGA7, CHASERR, hsa-miR-4778-3p, hsa-miR-4739, and hsa-miR-4685-5p emerged as potential biomarkers. These findings shed light on the common and unique molecular signatures underlying BPD and SCZ, offering significant potential for the advancement of diagnostic and therapeutic strategies tailored to these psychiatric disorders.
Load More