CD8 + cytotoxic T lymphocytes (CTLs) are critical for protection against intracellular pathogens but often have been difficult to induce by subunit vaccines in animals. DNA vaccines elicit protective CD8 + T cell responses. Malaria-naı̈ve volunteers who were vaccinated with plasmid DNA encoding a malaria protein developed antigen-specific, genetically restricted, CD8 + T cell–dependent CTLs. Responses were directed against all 10 peptides tested and were restricted by six human lymphocyte antigen (HLA) class I alleles. This first demonstration in healthy naı̈ve humans of the induction of CD8 + CTLs by DNA vaccines, including CTLs that were restricted by multiple HLA alleles in the same individual, provides a foundation for further human testing of this potentially revolutionary vaccine technology.

Abstract Pseudomonas aeruginosa undergoes diversification during infection of the cystic fibrosis (CF) lung. Understanding these changes requires model systems that capture the complexity of the CF lung environment. We previously identified loss-of-function mutations in the two-component regulatory system sensor kinase gene pmrB , in P. aeruginosa from CF and from experimental infection of mice. Here, we demonstrate that whilst such mutations lower in vitro MICs for multiple antimicrobial classes, this is not reflected in increased antibiotic susceptibility in vivo . Loss of PmrB impairs aminoarabinose modification of lipopolysaccharide, increasing the negative charge of the outer membrane and promoting uptake of cationic antimicrobials. However, in vivo , this can be offset by increased membrane binding of other positively charged molecules present in lungs. The polyamine spermidine readily coats the surface of PmrB - deficient P. aeruginosa , reducing susceptibility to antibiotics that rely on charge differences to bind the outer membrane and increasing biofilm formation. Spermidine is elevated in lungs during P. aeruginosa infection in mice and during episodes of antimicrobial treatment in people with CF. These findings highlight the need to study antimicrobial resistance under clinically relevant environmental conditions. Microbial mutations carrying fitness costs in vitro may be advantageous during infection, where host resources can be utilised.