Purpose To assess the frequency and type of oncogenic BRAF mutations in metastatic melanoma and correlate BRAF status with clinicopathologic features and outcome. Patients and Methods Consecutive BRAF-tested Australian patients with metastatic melanoma (n = 197) were observed prospectively. A comprehensive range of clinicopathologic variables were correlated with BRAF mutation status, and a survival analysis was conducted. Results Forty-eight percent of patients had a BRAF mutation; 70 patients (74%) had V600E, 19 (20%) had V600K, and six (6%) had other genotypes. Other than age at diagnosis of distant metastasis (median age, 56 v 63 years for BRAF-mutant v BRAF wild-type patients, respectively; P < .001), there was no significant difference in clinical features of patients with metastatic melanoma by mutation status. Features of the antecedent primary melanoma significantly associated with a BRAF mutation (P < .05) were histopathologic subtype, presence of mitoses, single or occult primary melanoma, truncal location, and age at diagnosis of primary tumor ≤ 50 years. The interval from diagnosis of first-ever melanoma to distant metastasis was not significantly different between BRAF-mutant and BRAF wild-type patients; however, the median survival of patients with newly diagnosed metastatic melanoma was 5.7 months for BRAF-mutant patients not treated with a BRAF inhibitor, 8.5 months for BRAF wild-type patients, and not reached for BRAF-mutant patients treated with a BRAF inhibitor. Conclusion V600K mutations comprised 20% of BRAF mutations. Characteristics of the antecedent primary melanoma and age at diagnosis differed in BRAF-mutant and BRAF wild-type patients. The presence of mutant BRAF had no impact on the disease-free interval from diagnosis of first-ever melanoma to first distant metastasis; however, it may have impacted survival thereafter.

Purpose Pneumonitis is an uncommon but potentially fatal toxicity of anti–programmed death-1 (PD-1)/programmed death ligand 1 (PD-L1) monoclonal antibodies (mAbs). Clinical, radiologic, and pathologic features are poorly described. Methods Patients who received anti–PD-1/PD-L1 monotherapy or in combination with anti–cytotoxic T-cell lymphocyte associated antigen-4 mAb were identified at two institutions (Memorial Sloan Kettering Cancer Center: advanced solid cancers, 2009 to 2014, and Melanoma Institute of Australia: melanomas only, 2013 to 2015). Pneumonitis was diagnosed by the treating investigator; cases with confirmed malignant lung infiltration or infection were excluded. Clinical, radiologic, and pathologic features of pneumonitis were collected. Associations among pneumonitis incidence, therapy received, and underlying malignancy were examined with Fisher’s exact test as were associations between pneumonitis features and outcomes. Results Of 915 patients who received anti–PD-1/PD-L1 mAbs, pneumonitis developed in 43 (5%; 95% CI, 3% to 6%; Memorial Sloan Kettering Cancer Center, 27 of 578 [5%]; Melanoma Institute of Australia, 16 of 337 [5%]). Time to onset of pneumonitis ranged from 9 days to 19.2 months. The incidence of pneumonitis was higher with combination immunotherapy versus monotherapy (19 of 199 [10%] v 24 of 716 [3%]; P < .01). Incidence was similar in patients with melanoma and non–small-cell lung cancer (overall, 26 of 532 [5%] v nine of 209 [4%]; monotherapy, 15 of 417 v five of 152 [ P = 1.0]; combination, 11 of 115 v four of 57 [ P = .78]). Seventy-two percent (31 of 43) of cases were grade 1 to 2, and 86% (37 of 43) improved/resolved with drug holding/immunosuppression. Five patients worsened clinically and died during the course of pneumonitis treatment; proximal cause of death was pneumonitis (n = 1), infection related to immunosuppression (n = 3), or progressive cancer (n = 1). Radiologic and pathologic features of pneumonitis were diverse. Conclusion Pneumonitis associated with anti–PD-1/PD-L1 mAbs is a toxicity of variable onset and clinical, radiologic, and pathologic appearances. It is more common when anti–PD-1/PD-L1 mAbs are combined with anti–cytotoxic T-cell lymphocyte associated antigen-4 mAb. Most events are low grade and improve/resolve with drug holding/immunosuppression. Rarely, pneumonitis worsens despite immunosuppression, and may result in infection and/or death.

Summary

Background

 Nivolumab monotherapy and combination nivolumab plus ipilimumab increase proportions of patients achieving a response and survival versus ipilimumab in patients with metastatic melanoma; however, efficacy in active brain metastases is unknown. We aimed to establish the efficacy and safety of nivolumab alone or in combination with ipilimumab in patients with active melanoma brain metastases. 

Methods

 This multicentre open-label randomised phase 2 trial was done at four sites in Australia, in three cohorts of immunotherapy-naive patients aged 18 years or older with melanoma brain metastases. Patients with asymptomatic brain metastases with no previous local brain therapy were randomly assigned using the biased coin minimisation method, stratified by site, in a 30:24 ratio (after a safety run-in of six patients) to cohort A (nivolumab plus ipilimumab) or cohort B (nivolumab). Patients with brain metastases in whom local therapy had failed, or who had neurological symptoms, or leptomeningeal disease were enrolled in non-randomised cohort C (nivolumab). Patients in cohort A received intravenous nivolumab 1 mg/kg combined with ipilimumab 3 mg/kg every 3 weeks for four doses, then nivolumab 3 mg/kg every 2 weeks; patients in cohort B or cohort C received intravenous nivolumab 3 mg/kg every 2 weeks. The primary endpoint was intracranial response from week 12. Primary and safety analyses were done on an intention-to-treat basis in all patients who received at least one dose of the study drug. This trial is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT02374242, and is ongoing for the final survival analysis. 

Findings

 Between Nov 4, 2014, and April 21, 2017, 79 patients were enrolled; 36 in cohort A, 27 in cohort B, and 16 in cohort C. One patient in cohort A and two in cohort B were found to be ineligible and excluded from the study before receiving the study drug. At the data cutoff (Aug 28, 2017), with a median follow up of 17 months (IQR 8–25), intracranial responses were achieved by 16 (46%; 95% CI 29–63) of 35 patients in cohort A, five (20%; 7–41) of 25 in cohort B, and one (6%; 0–30) of 16 in cohort C. Intracranial complete responses occurred in six (17%) patients in cohort A, three (12%) in cohort B, and none in cohort C. Treatment-related adverse events occurred in 34 (97%) of 35 patients in cohort A, 17 (68%) of 25 in cohort B, and eight (50%) of 16 in cohort C. Grade 3 or 4 treatment-related adverse events occurred in 19 (54%) patients in cohort A, four (16%) in cohort B, and two (13%) in cohort C. No treatment-related deaths occurred. 

Interpretation

 Nivolumab combined with ipilimumab and nivolumab monotherapy are active in melanoma brain metastases. A high proportion of patients achieved an intracranial response with the combination. Thus, nivolumab combined with ipilimumab should be considered as a first-line therapy for patients with asymptomatic untreated brain metastases. 

Funding

 Melanoma Institute Australia and Bristol-Myers Squibb.

Anti-PD-1 antibodies (anti-PD-1) have clinical activity in a number of malignancies. All clinical trials have excluded patients with significant preexisting autoimmune disorders (ADs) and only one has included patients with immune-related adverse events (irAEs) with ipilimumab. We sought to explore the safety and efficacy of anti-PD-1 in such patients.Patients with advanced melanoma and preexisting ADs and/or major immune-related adverse events (irAEs) with ipilimumab (requiring systemic immunosuppression) that were treated with anti-PD-1 between 1 July 2012 and 30 September 2015 were retrospectively identified.One hundred and nineteen patients from 13 academic tertiary referral centers were treated with anti-PD-1. In patients with preexisting AD (N = 52), the response rate was 33%. 20 (38%) patients had a flare of AD requiring immunosuppression, including 7/13 with rheumatoid arthritis, 3/3 with polymyalgia rheumatica, 2/2 with Sjogren's syndrome, 2/2 with immune thrombocytopaenic purpura and 3/8 with psoriasis. No patients with gastrointestinal (N = 6) or neurological disorders (N = 5) flared. Only 2 (4%) patients discontinued treatment due to flare, but 15 (29%) developed other irAEs and 4 (8%) discontinued treatment. In patients with prior ipilimumab irAEs requiring immunosuppression (N = 67) the response rate was 40%. Two (3%) patients had a recurrence of the same ipilimumab irAEs, but 23 (34%) developed new irAEs (14, 21% grade 3-4) and 8 (12%) discontinued treatment. There were no treatment-related deaths.In melanoma patients with preexisting ADs or major irAEs with ipilimumab, anti-PD-1 induced relatively frequent immune toxicities, but these were often mild, easily managed and did not necessitate discontinuation of therapy, and a significant proportion of patients achieved clinical responses. The results support that anti-PD-1 can be administered safely and can achieve clinical benefit in patients with preexisting ADs or prior major irAEs with ipilimumab.

Cancer immunotherapies provide survival benefits in responding patients, but many patients fail to respond. Identifying the biology of treatment response and resistance are a priority to optimize drug selection and improve patient outcomes. We performed transcriptomic and immune profiling on 158 tumor biopsies from melanoma patients treated with anti-PD-1 monotherapy (n = 63) or combined anti-PD-1 and anti-CTLA-4 (n = 57). These data identified activated T cell signatures and T cell populations in responders to both treatments. Further mass cytometry analysis identified an EOMES+CD69+CD45RO+ effector memory T cell phenotype that was significantly more abundant in responders to combined immunotherapy compared with non-responders (n = 18). The gene expression profile of this population was associated with longer progression-free survival in patients treated with single agent and greater tumor shrinkage in both treatments.

Ipilimumab and other immune therapies are effective treatment options for patients with advanced melanoma but cause frequent immune-related toxic effects. Autoimmune diseases are common, and the safety and efficacy of ipilimumab therapy in patients with preexisting autoimmune disorders is not known.To determine the safety and efficacy of ipilimumab therapy in patients with advanced melanoma with preexisting autoimmune disorders.Retrospective review of patients with advanced melanoma and preexisting autoimmune disorders who received ipilimumab at 9 academic tertiary referral centers from January 1, 2012, through August 1, 2015. The data analysis was performed on August 24, 2015.Ipilimumab therapy.Safety, in terms of frequency of autoimmune flares and conventional immune-related adverse events (irAEs), and efficacy, in terms of response rates and overall survival, were evaluated descriptively.Of the 30 patients who received ipilimumab (17 [57%] male; median [range] age, 59.5 [30-80] y), 6 had rheumatoid arthritis, 5 had psoriasis, 6 had inflammatory bowel disease, 2 had systemic lupus erythematosus, 2 had multiple sclerosis, 2 had autoimmune thyroiditis, and 7 had other conditions. Thirteen patients (43%) were receiving immunosuppressive therapy at the time of initiation of ipilimumab therapy, most commonly low-dose prednisone or hydroxychloroquine. With ipilimumab treatment, 8 patients (27%) experienced exacerbations of their autoimmune condition necessitating systemic treatment; all were managed with corticosteroids. Conventional grade 3 to 5 irAEs occurred in 10 patients (33%) and were reversible with corticosteroids or with infliximab therapy in 2 cases. One patient with baseline psoriasis died of presumed immune-related colitis after a 1-week delay prior to reporting symptoms. Fifteen patients (50%) had neither autoimmune disease flares nor irAEs. Six patients experienced an objective response (20%), including 1 with a durable complete response.To our knowledge, this is the largest series of patients with preexisting autoimmune disease treated with immune checkpoint inhibitors. Ipilimumab was clinically active and was associated with exacerbations of autoimmune disease and conventional ipilimumab-induced irAEs that were readily manageable with standard therapies when started in a timely fashion. Ipilimumab therapy may be considered in this setting with vigilant clinical monitoring.

Background Obesity has been linked to increased mortality in several cancer types; however, the relation between obesity and survival outcomes in metastatic melanoma is unknown. The aim of this study was to examine the association between body-mass index (BMI) and progression-free survival or overall survival in patients with metastatic melanoma who received targeted therapy, immunotherapy, or chemotherapy. Methods This retrospective study analysed independent cohorts of patients with metastatic melanoma assigned to treatment with targeted therapy, immunotherapy, or chemotherapy in randomised clinical trials and one retrospective study of patients treated with immunotherapy. Patients were classified according to BMI, following the WHO definitions, as underweight, normal, overweight, or obese. Patients without BMI and underweight patients were excluded. The primary outcomes were the associations between BMI and progression-free survival or overall survival, stratified by treatment type and sex. We did multivariable analyses in the independent cohorts, and combined adjusted hazard ratios in a mixed-effects meta-analysis to provide a precise estimate of the association between BMI and survival outcomes; heterogeneity was assessed with meta-regression analyses. Analyses were done on the predefined intention-to-treat population in the randomised controlled trials and on all patients included in the retrospective study. Findings The six cohorts consisted of a total of 2046 patients with metastatic melanoma treated with targeted therapy, immunotherapy, or chemotherapy between Aug 8, 2006, and Jan 15, 2016. 1918 patients were included in the analysis. Two cohorts containing patients from randomised controlled trials treated with targeted therapy (dabrafenib plus trametinib [n=599] and vemurafenib plus cobimetinib [n=240]), two cohorts containing patients treated with immunotherapy (one randomised controlled trial of ipilimumab plus dacarbazine [n=207] and a retrospective cohort treated with pembrolizumab, nivolumab, or atezolizumab [n=331]), and two cohorts containing patients treated with chemotherapy (two randomised controlled trials of dacarbazine [n=320 and n=221]) were classified according to BMI as normal (694 [36%] patients), overweight (711 [37%]), or obese (513 [27%]). In the pooled analysis, obesity, compared with normal BMI, was associated with improved survival in patients with metastatic melanoma (average adjusted hazard ratio [HR] 0·77 [95% CI 0·66–0·90] for progression-free survival and 0·74 [0·58–0·95] for overall survival). The survival benefit associated with obesity was restricted to patients treated with targeted therapy (HR 0·72 [0·57–0·91] for progression-free survival and 0·60 [0·45–0·79] for overall survival) and immunotherapy (HR 0·75 [0·56–1·00] and 0·64 [0·47–0·86]). No associations were observed with chemotherapy (HR 0·87 [0·65–1·17, pinteraction=0·61] for progression-free survival and 1·03 [0·80–1·34, pinteraction=0·01] for overall survival). The association of BMI with overall survival for patients treated with targeted and immune therapies differed by sex, with inverse associations in men (HR 0·53 [0·40–0·70]), but no associations observed in women (HR 0·85 [0·61–1·18, pinteraction=0·03]). Interpretation Our results suggest that in patients with metastatic melanoma, obesity is associated with improved progression-free survival and overall survival compared with those outcomes in patients with normal BMI, and that this association is mainly seen in male patients treated with targeted or immune therapy. These results have implications for the design of future clinical trials for patients with metastatic melanoma and the magnitude of the benefit found supports further investigation of the underlying mechanism of these associations. Funding ASCO/CCF Young Investigator Award, ASCO/CCF Career Development Award, MD Anderson Cancer Center (MDACC) Melanoma Moonshot Program, MDACC Melanoma SPORE, and the Dr Miriam and Sheldon G Adelson Medical Research Foundation.

Multiple BRAF inhibitor resistance mechanisms have been described, however, their relative frequency, clinical correlates, and effect on subsequent therapy have not been assessed in patients with metastatic melanoma.Fifty-nine BRAF(V600)-mutant melanoma metastases from patients treated with dabrafenib or vemurafenib were analyzed. The genetic profile of resistance mechanisms and tumor signaling pathway activity was correlated with clinicopathologic features and therapeutic outcomes.Resistance mechanisms were identified in 58% progressing tumors and BRAF alterations were common. Gene expression analysis revealed that mitogen-activated protein kinase (MAPK) activity remained inhibited in 21% of resistant tumors, and the outcomes of patients with these tumors were poor. Resistance mechanisms also occurred in pretreatment biopsies and heterogeneity of resistance mechanisms occurred within patients and within tumors. There were no responses to subsequent targeted therapy, even when a progressing tumor had a resistance mechanism predicted to be responsive.Selecting sequential drugs based on the molecular characteristics of a single progressing biopsy is unlikely to provide improved responses, and first-line therapies targeting multiple pathways will be required.

Abstract Purpose: Certain clinicopathologic features correlate with BRAF mutation status in melanoma including younger age and primary subtype. This study sought to determine the BRAF mutation status by age-decade and whether BRAF-mutant genotypes correlated with clinicopathologic features and outcome in patients with metastatic melanoma. Methods: A prospectively assembled cohort of Australian patients were followed from diagnosis of metastatic melanoma (N = 308). Clinicopathologic variables were correlated with BRAF mutational status, genotype, and survival. Results: Forty-six percent of patients had a BRAF mutation; 73% V600E, 19% V600K, and 8% other genotypes. An inverse relationship existed between BRAF mutation prevalence and age-decade (P &lt; 0.001). All patients &lt;30 years and only 25% ≥70 years had BRAF-mutant melanoma. Amongst BRAF-mutant melanoma, the frequency of non-V600E genotypes (including V600K) increased with increasing age. Non-V600E genotypes comprised &lt;20% in patients &lt;50 years and &gt;40% in those ≥70 years. A higher degree of cumulative sun-induced damage correlated with V600K but not V600E melanoma (P = 0.002). The disease-free interval from diagnosis of primary melanoma to first distant metastasis was shorter for patients with V600K compared with V600E melanoma (17.4 vs. 39.2 months, P = 0.048), with no difference in survival thereafter. In patients BRAF tested at diagnosis of metastatic melanoma, one year survival from diagnosis of metastasis was significantly longer for patients with BRAF-mutant melanoma treated with an inhibitor (83%), than those not treated with an inhibitor (29%, P &lt; 0.001), or patients with BRAF wild-type melanoma (37%, P &lt; 0.001). Conclusion: Different genotypes exist within BRAF-mutant metastatic melanoma, representing biologically and clinically discrete subtypes, suggesting distinct etiology and behavior. Clin Cancer Res; 18(12); 3242–9. ©2012 AACR.

The outcome of patients with macroscopic stage III melanoma is poor. Neoadjuvant treatment with ipilimumab plus nivolumab at the standard dosing schedule induced pathological responses in a high proportion of patients in two small independent early-phase trials, and no patients with a pathological response have relapsed after a median follow up of 32 months. However, toxicity of the standard ipilimumab plus nivolumab dosing schedule was high, preventing its broader clinical use. The aim of the OpACIN-neo trial was to identify a dosing schedule of ipilimumab plus nivolumab that is less toxic but equally effective.OpACIN-neo is a multicentre, open-label, phase 2, randomised, controlled trial. Eligible patients were aged at least 18 years, had a WHO performance status of 0-1, had resectable stage III melanoma involving lymph nodes only, and measurable disease according to the Response Evaluation Criteria in Solid Tumors version 1.1. Patients were enrolled from three medical centres in Australia, Sweden, and the Netherlands, and were randomly assigned (1:1:1), stratified by site, to one of three neoadjuvant dosing schedules: group A, two cycles of ipilimumab 3 mg/kg plus nivolumab 1 mg/kg once every 3 weeks intravenously; group B, two cycles of ipilimumab 1 mg/kg plus nivolumab 3 mg/kg once every 3 weeks intravenously; or group C, two cycles of ipilimumab 3 mg/kg once every 3 weeks directly followed by two cycles of nivolumab 3 mg/kg once every 2 weeks intravenously. The investigators, site staff, and patients were aware of the treatment assignment during the study participation. Pathologists were masked to treatment allocation and all other data. The primary endpoints were the proportion of patients with grade 3-4 immune-related toxicity within the first 12 weeks and the proportion of patients achieving a radiological objective response and pathological response at 6 weeks. Analyses were done in all patients who received at least one dose of study drug. This trial is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT02977052, and is ongoing with an additional extension cohort and to complete survival analysis.Between Nov 24, 2016 and June 28, 2018, 105 patients were screened for eligibility, of whom 89 (85%) eligible patients were enrolled and randomly assigned to one of the three groups. Three patients were excluded after randomisation because they were found to be ineligible, and 86 received at least one dose of study drug; 30 patients in group A, 30 in group B, and 26 in group C (accrual to this group was closed early upon advice of the Data Safety Monitoring Board on June 4, 2018 because of severe adverse events). Within the first 12 weeks, grade 3-4 immune-related adverse events were observed in 12 (40%) of 30 patients in group A, six (20%) of 30 in group B, and 13 (50%) of 26 in group C. The difference in grade 3-4 toxicity between group B and A was -20% (95% CI -46 to 6; p=0·158) and between group C and group A was 10% (-20 to 40; p=0·591). The most common grade 3-4 adverse events were elevated liver enzymes in group A (six [20%)]) and colitis in group C (five [19%]); in group B, none of the grade 3-4 adverse events were seen in more than one patient. One patient (in group A) died 9·5 months after the start of treatment due to the consequences of late-onset immune-related encephalitis, which was possibly treatment-related. 19 (63% [95% CI 44-80]) of 30 patients in group A, 17 (57% [37-75]) of 30 in group B, and nine (35% [17-56]) of 26 in group C achieved a radiological objective response, while pathological responses occurred in 24 (80% [61-92]) patients in group A, 23 (77% [58-90]) in group B, and 17 (65% [44-83]) in group C.OpACIN-neo identified a tolerable neoadjuvant dosing schedule (group B: two cycles of ipilimumab 1 mg/kg plus nivolumab 3 mg/kg) that induces a pathological response in a high proportion of patients and might be suitable for broader clinical use. When more mature data confirm these early observations, this schedule should be tested in randomised phase 3 studies versus adjuvant therapies, which are the current standard-of-care systemic therapy for patients with stage III melanoma.Bristol-Myers Squibb.