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Ratan Sarkar
Author with expertise in Stochasticity in Gene Regulatory Networks
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Reprogramming, oscillations and transdifferentiation in epigenetic landscapes

Bivash Kaity et al.Sep 25, 2017
Waddington's epigenetic landscape provides a phenomenological understanding of the cell differentiation pathways from the pluripotent to mature lineage-committed cell lines. In light of recent successes in the reverse programming process there has been significant interest in quantifying the underlying landscape picture through the mathematics of gene regulatory networks. We investigate the role of time delays arising from multistep chemical reactions and epigenetic rearrangement on the cell differentiation landscape for a realistic two-gene regulatory network, consisting of self-promoting and mutually inhibiting genes. Our work provides the first theoretical basis of the transdifferentiation process in the presence of delays, where one differentiated cell type can transition to another directly without passing through the undifferentiated state. Additionally, the interplay of time-delayed feedback and a time dependent chemical drive leads to long-lived oscillatory states in appropriate parameter regimes. This work emphasizes the important role played by time-delayed feedback loops in gene regulatory circuits and provides a framework for the characterization of epigenetic landscapes.
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Empowering learning: Augmented reality applications for students with intellectual disabilities

Ratan SarkarJan 1, 2024
This paper explores the transformative potential of augmented reality (AR) technology in empowering students with intellectual disabilities within educational settings. Understanding the challenges faced by these students and the limitations of traditional teaching methods, this study investigates the benefits and implications of integrating AR applications into special education. By examining the multifaceted advantages of AR, including enhanced engagement, personalized learning experiences, and the development of social and communication skills, this research highlights the positive impact of AR on the educational outcomes of students with intellectual disabilities. Additionally, the paper discusses the challenges associated with implementing AR, such as accessibility, ethical considerations, and educator training needs. Drawing upon case studies and practical strategies, it offers insights into the effective utilization of AR to create inclusive learning environments and emphasizes the necessity of collaboration among educators, technologists, and caregivers. Furthermore, this paper outlines future directions and policy recommendations to support the sustained integration of AR in special education, advocating for continued research and advancement in this field.