TF
Taibing Fan
Author with expertise in Role of Long Noncoding RNAs in Cancer and Development
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(60% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
11
/
i10-index:
12
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Knockdown of GAS5 restores ox-LDL-induced impaired autophagy flux via upregulating miR-26a in human endothelial cells

Weijie Liang et al.Apr 2, 2018
Background: Oxidized low-density lipoprotein (ox-LDL)-induced endothelial cell (EC) injury and autophagy dysfunction play a vital role in the development of atherosclerosis. LncRNAs have been identified to participate in the regulation of pathogenesis of atherosclerosis. However, it remains largely undefined whether growth-arrest specific transcript 5 (GAS5) could influence ox-LDL-induced autophagy dysfunction in ECs. Methods: The expressions of GAS5 and miR-26a in the plasma samples of patients with atherosclerosis and ox-LDL-treated human aortic endothelial cells (HAECs) were detected by qRT-PCR. Luciferase reporter assay, RNA immunoprecipitation (RIP), and RNA pull down were performed to validate whether GAS5 could directly interact with miR-26a. The effects of ox-LDL, GAS5 or combined with miR-26a on apoptosis and autophagy were evaluated by flow cytometry analysis and western blot, respectively. Results: GAS5 expression was upregulated and miR-26a was downregulated in the plasma samples of patients with atherosclerosis and ox-LDL-treated HAECs. There was reciprocal inhibition between GAS5 and miR-26a expressions in ox-LDL-treated HAECs. We further demonstrated that GAS5 directly interacted with miR-26a in ox-LDL-treated HAECs. Additionally, ox-LDL administration induced apoptosis and impaired autophagy flux in HAECs. Rescue experiments demonstrated that GAS5 knockdown restored ox-LDL-induced impaired autophagy flux by upregulating miR-26a in HAECs. Conclusion: Knockdown of GAS5 restores ox-LDL-induced impaired autophagy flux via upregulating miR-26a in human endothelial cells, revealing a novel regulatory mechanism for ox-LDL-induced impaired autophagy flux in ECs through ceRNA crosstalk.
0

Development and external validation of an artificial intelligence-based method for scalable chest radiograph diagnosis: a multi-country cross-sectional study

Zeye Liu et al.Jan 1, 2024
Problem: Chest radiography is a crucial tool for diagnosing thoracic disorders, but interpretation errors and a lack of qualified practitioners can cause delays in treatment. Aim: This study aimed to develop a reliable multi-classification artificial intelligence (AI) tool to improve the accuracy and efficiency of chest radiograph diagnosis. Methods: We developed a convolutional neural network (CNN) capable of distinguishing among 26 thoracic diagnoses. The model was trained and externally validated using 795,055 chest radiographs from 13 datasets across 4 countries. Results: The CNN model achieved an average area under the curve (AUC) of 0.961 across all 26 diagnoses in the testing set. COVID-19 detection achieved perfect accuracy (AUC 1.000, [95% confidence interval {CI}, 1.000 to 1.000]), while effusion or pleural effusion detection showed the lowest accuracy (AUC 0.8453, [95% CI, 0.8417 to 0.8489]). In external validation, the model demonstrated strong reproducibility and generalizability within the local dataset, achieving an AUC of 0.9634 for lung opacity detection (95% CI, 0.9423 to 0.9702). The CNN outperformed both radiologists and nonradiological physicians, particularly in trans-device image recognition. Even for diseases not specifically trained on, such as aortic dissection, the AI model showed considerable scalability and enhanced diagnostic accuracy for physicians of varying experience levels (all P < 0.05). Additionally, our model exhibited no gender bias ( P > 0.05). Conclusion: The developed AI algorithm, now available as professional web-based software, substantively improves chest radiograph interpretation. This research advances medical imaging and offers substantial diagnostic support in clinical settings.
0

A Clinical Study on the Treatment of Adult Atrial Septal Defect Using Thoracoscopic-Assisted Right Vertical Infra-Axillary Thoracotomy, Total Thoracoscopic, and Median Sternotomy Approaches

Hongliang Zhang et al.Aug 8, 2024
Background: To compare the clinical outcomes of three surgical approaches for treating adult atrial septal defects (ASD): Thoracoscopic-assisted right vertical infra-axillary thoracotomy (TARVIAT) under central cardiopulmonary bypass (CPB), totally thoracoscopic (TT), and median sternotomy (MS) approaches, and to assess the feasibility and safety of the TARIAVT approach. Methods: This study reviewed 62 cases patients of repairing atrial septal defects via a TARVIAT and central extracorporeal circulation from 2019 to 2023. The patients included 22 males, aged between 18 and 59 years, with a mean age of 33.35 ± 10.97 years. The surgical indications were adult patients with moderate to severe tricuspid regurgitation and who were unsuitable for interventional closure of atrial septal defects. Exclusion criteria included patients diagnosed with severe pulmonary hypertension or Eisenmenger syndrome. Additionally, 67 patients who underwent TT approach repair of ASD and 72 patients who underwent MS approach repair of ASD were selected as the control groups. Operative time, CPB time, aortic clamping time, postoperative Intensive care unit (ICU) stay, postoperative mechanical ventilation time, 24-hour postoperative chest drainage, incision length, postoperative hospital stay, hospital costs, and postoperative complications were compared to assess statistical differences. Results: There were no deaths or major complications observed in any of the three groups. Statistically significant differences were found among the three groups in terms of extracorporeal circulation time, aortic clamping time, surgical time, 24-hour postoperative chest drainage, postoperative mechanical ventilation time, postoperative ICU stay, incision length, and postoperative hospital stay (p < 0.05). The TT group exhibited longer CPB and aortic clamping times compared to the TARVIAT and MS groups, while demonstrating lower 24-hour postoperative chest drainage volumes compared to the TARIAVT and MS groups. Both the TARVIAT and TT groups showed shorter surgical times, postoperative mechanical ventilation times, postoperative ICU stay, incision lengths, and postoperative hospital. However, there were no statistically significant differences among the three groups regarding hospital costs, postoperative left ventricular ejection fraction (LVEF) values, and the incidence of postoperative complications (p > 0.05). Conclusions: TARVIAT under central CPB is feasible and safe for adult patients. This approach presents lower invasiveness, shorter operative duration, and faster recovery compared to other methods. In conclusion, the TARVIAT approach for repairing adult ASD is both safe and effective, offering a viable surgical option for this condition.
0

Differential Expression and Interaction network construction of Noncoding RNA and mRNA in Heart Tissue associated with Tetralogy of Fallot

Hongdan Wang et al.Feb 19, 2020
Tetralogy of Fallot (TOF) is still the most common and complicated cyanotic congenital heart defect of all congenital heart diseases with a 10% incidence. Surgery repair is often necessary in infancy. The etiology of TOF is complex and genetic and epigenetic mechanisms such as chromosomal abnormalities, gene mutations, nucleic acid modifications, non-coding RNA, and circular RNA (circRNA) play an important role in its occurrence. RNA not only plays an auxiliary role of genetic information carrier, but also plays a more important role in various regulatory functions. There are few studies on the action mechanism of non-coding RNA. Aim to gain more in-depth knowledge of TOF, we collected tissue samples of the right ventricular outflow tract of 5 TOF children with no other intracardiac and extracardiac malformations and 5 normal fetuses. We systematically analyzed the specific long non-coding RNA (lncRNA), microRNA (miRNA), circRNA and messenger RNA (mRNA) profiles of TOF. To our knowledge, there are no reports of genome-wide study of transcriptome in TOF and we first obtained meaningful differentially expressed lncRNAs, miRNAs, circle RNA and mRNAs.