YC
Yinghua Chen
Author with expertise in Mass Spectrometry Techniques
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(29% Open Access)
Cited by:
779
h-index:
22
/
i10-index:
48
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
15

Discriminative Accuracy of Plasma Phospho-tau217 for Alzheimer Disease vs Other Neurodegenerative Disorders

Sebastian Palmqvist et al.Jul 28, 2020
There are limitations in current diagnostic testing approaches for Alzheimer disease (AD).To examine plasma tau phosphorylated at threonine 217 (P-tau217) as a diagnostic biomarker for AD.Three cross-sectional cohorts: an Arizona-based neuropathology cohort (cohort 1), including 34 participants with AD and 47 without AD (dates of enrollment, May 2007-January 2019); the Swedish BioFINDER-2 cohort (cohort 2), including cognitively unimpaired participants (n = 301) and clinically diagnosed patients with mild cognitive impairment (MCI) (n = 178), AD dementia (n = 121), and other neurodegenerative diseases (n = 99) (April 2017-September 2019); and a Colombian autosomal-dominant AD kindred (cohort 3), including 365 PSEN1 E280A mutation carriers and 257 mutation noncarriers (December 2013-February 2017).Plasma P-tau217.Primary outcome was the discriminative accuracy of plasma P-tau217 for AD (clinical or neuropathological diagnosis). Secondary outcome was the association with tau pathology (determined using neuropathology or positron emission tomography [PET]).Mean age was 83.5 (SD, 8.5) years in cohort 1, 69.1 (SD, 10.3) years in cohort 2, and 35.8 (SD, 10.7) years in cohort 3; 38% were women in cohort 1, 51% in cohort 2, and 57% in cohort 3. In cohort 1, antemortem plasma P-tau217 differentiated neuropathologically defined AD from non-AD (area under the curve [AUC], 0.89 [95% CI, 0.81-0.97]) with significantly higher accuracy than plasma P-tau181 and neurofilament light chain (NfL) (AUC range, 0.50-0.72; P < .05). The discriminative accuracy of plasma P-tau217 in cohort 2 for clinical AD dementia vs other neurodegenerative diseases (AUC, 0.96 [95% CI, 0.93-0.98]) was significantly higher than plasma P-tau181, plasma NfL, and MRI measures (AUC range, 0.50-0.81; P < .001) but not significantly different compared with cerebrospinal fluid (CSF) P-tau217, CSF P-tau181, and tau-PET (AUC range, 0.90-0.99; P > .15). In cohort 3, plasma P-tau217 levels were significantly greater among PSEN1 mutation carriers, compared with noncarriers, from approximately 25 years and older, which is 20 years prior to estimated onset of MCI among mutation carriers. Plasma P-tau217 levels correlated with tau tangles in participants with (Spearman ρ = 0.64; P < .001), but not without (Spearman ρ = 0.15; P = .33), β-amyloid plaques in cohort 1. In cohort 2, plasma P-tau217 discriminated abnormal vs normal tau-PET scans (AUC, 0.93 [95% CI, 0.91-0.96]) with significantly higher accuracy than plasma P-tau181, plasma NfL, CSF P-tau181, CSF Aβ42:Aβ40 ratio, and MRI measures (AUC range, 0.67-0.90; P < .05), but its performance was not significantly different compared with CSF P-tau217 (AUC, 0.96; P = .22).Among 1402 participants from 3 selected cohorts, plasma P-tau217 discriminated AD from other neurodegenerative diseases, with significantly higher accuracy than established plasma- and MRI-based biomarkers, and its performance was not significantly different from key CSF- or PET-based measures. Further research is needed to optimize the assay, validate the findings in unselected and diverse populations, and determine its potential role in clinical care.
15
Citation777
3
Save
0

A metastable contact and structural disorder in the estrogen receptor transactivation domain

Yi Peng et al.May 28, 2018
The N-terminal transactivation domain (NTD) of estrogen receptor alpha, a well-known member of the family of intrinsically disordered proteins (IDPs), mediates the receptor's transactivation function to regulate gene expression. However, an accurate molecular dissection of NTD's structure-function relationships remains elusive. Here, using small-angle X-ray scattering (SAXS), nuclear magnetic resonance, circular dichroism, and hydrogen exchange mass spectrometry, we show that NTD adopts an unexpectedly compact, mostly disordered conformation that undergoes structural expansion upon chemical denaturation. By combining SAXS and hydroxyl radical footprinting measurements, we derive ensemble-structures that represent the natively compact and disordered NTD. The resulting contact map for the ensemble reveals that the NTD features metastable regional and long-range contacts, including specific interactions between residues I33 and S118 that pervade the ensemble. Mutation at S118, a known regulatory site via phosphorylation, promotes conformational changes and increases coactivator binding, confirming its important structural contributions. These findings extend our understanding of IDPs' structure and function, and how specific metastable and/or transient structural interactions within an IDP can mediate critical regulatory functions of disordered proteins.
0

Improper toy waste handling can harm human health via seafood consumption: A comprehensive risk assessment of heavy metals

Keqin Zhang et al.Aug 1, 2024
Toy production has been increasing over the last few decades to meet the growing demands for toys across the globe, which has inevitably worsened the problem of toy waste. Given the lack of modern waste disposal facilities, rural villagers in many developing countries often discard and incinerate toy waste in backyards or riverbanks, which may release the pollutants from toys (e.g., heavy metals), contaminate the surrounding areas, and eventually threaten the health of residents. As such, this study examined the impact of improper toy waste handling on the nearby aquaculture site by measuring the contamination level of heavy metals (As, Cd, Cu, Pb, and Zn) in the sediment and seafood (crabs, shrimps, and fish). The health risk of heavy metals via seafood consumption was assessed in different groups of people (males, females, teenagers, and seniors). Results showed that the sediment and seafood at the aquaculture site were generally not contaminated with heavy metals (contamination factor and bioaccumulation factor <1). However, consuming the seafood cultured at this site, especially for crabs, could pose a health risk to humans due to As and Cd (hazard quotient > 1), irrespective of their age and gender. This risk could not be lowered by cooking, except As by boiling. Overall, we revealed that improper toy waste handling did not cause severe heavy metal pollution in the surrounding environment, but the consumption of contaminated seafood could still threaten human health. To safeguard public health, we propose that toy waste should be appropriately treated by the authorities concerned. In addition, consuming seafood with long culture periods (e.g., crabs) should be reduced to minimize the dietary intake of heavy metals and their associated health risk.
0

Detection and segmentation of wire rope surface deficiency based on YOLOv8 and U-Net

Wang Zhen-bin et al.Jun 10, 2024
Abstract The presence of surface defects in wire ropes (WR) may lead to potential safety hazards and performance degradation, necessitating timely detection and repair. Hence, this paper proposes a method for detecting surface defects in WR based on the deep learning models YOLOv8s and U-Net, aiming to identify surface defects in real-time and extract defect data, thereby enhancing the efficiency of surface defect detection. Firstly, the ECA attention mechanism is incorporated into the YOLOv8 algorithm to enhance detection performance, achieving real-time localization and identification of surface defects in WR. Secondly, in order to obtain detailed defect data, the U-Net semantic segmentation algorithm is employed for morphological segmentation of defects, thereby obtaining the contour features of surface defects. Finally, in conjunction with OpenCV technology, the segmentation results of the defects are quantified to extract data, obtaining parameters such as the area and perimeter of the surface defects in the WR. Experimental results demonstrate that the improved YOLOv8-ECA model exhibits good accuracy and robustness, with the model’s mAP@0.5 reaching 84.78%, an increase of 1.13% compared to the base model, an accuracy rate of 90.70%, and an FPS of 65. The U-Net model can efficiently perform segmentation processing on surface defects of WR, with an mIOU of 83.54% and an mPA of 90.78%. This method can rapidly, accurately, and specifically detect surface defects in WR, which is of significant importance in preventing industrial production safety accidents.
2

Comparative proteomics analysis identifies L-FABP as a putative biomarker of graft injury during liver transplantation

Maogen Chen et al.Apr 24, 2020
Abstract Background To a large extent the success of liver transplantation depends on quality of allografts. The molecular basis of the susceptibility of different liver allografts to transplant injury remains undefined. Methods Transplanted liver samples were collected and divided into three groups: the optimal graft (OG) group, early allograft dysfunction (EAD) group, and primary nonfunction (PNF) group. iTRAQ comparative quantitative proteomic analysis and multiple reaction monitoring (MRM) verification was performed. Results More than 160 differentially expressed proteins were detected in the PNF group, compared to 54 and 36 proteins in the EAD and OG groups respectively. Liver-type fatty acid-binding protein (L-FABP) was found as differentially expressed in both cold preserved and reperfused liver. Serum L-FABP level in donors was higher in the PNF and EAD groups than in the OG group. A lower tissue expression of L-FABP was observed in the PNF groups than other groups after reperfusion, indicating incompetent liver donor quality. In mouse ischemia reperfusion injury (IRI) model, the serum levels and tissue expression of L-FABP corresponded to the ALT variation curve. Conclusions Suboptimal donor livers are more sensitive to ischemia reperfusion injury. L-FABP might be an effective biomarker for evaluating donor quality in liver transplantation.