HR
Hui Ruan
Author with expertise in Molecular Mechanisms of Photosynthesis and Photoprotection
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(50% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
25
/
i10-index:
46
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Exploration of miRNA-mediated fertility regulation network of cytoplasmic male sterility during flower bud development in soybean

Ding Xianlong et al.Jun 20, 2018
Cytoplasmic male sterility (CMS) plays an important role in the production of soybean hybrid seeds. MicroRNAs (miRNAs) are a class of non-coding endogenous ~21 nt small RNAs that play crucial roles in flower and pollen development by targeting genes in plants. Here, two small RNA libraries and two degradome libraries were constructed from the flower buds of the soybean CMS line NJCMS1A and its restorer (Rf) line NJCMS1C. Following high-throughput sequencing, 558 known miRNAs, 103 novel miRNAs on the other arm of known pre-miRNAs, 10 novel miRNAs, and a number of base-edited miRNAs were identified. Among the identified miRNAs, 76 differentially expressed miRNAs were discovered with greater than two-fold changes between NJCMS1A and NJCMS1C. By degradome analysis, a total of 466 distinct transcripts targeted by 200 miRNAs and 122 distinct transcripts targeted by 307 base-edited miRNAs were detected. Further integrated analysis of transcriptome and small RNA found some miRNAs and their targets’ expression patterns showing a negative correlation, such as miR156b-GmSPL and miR4413b-GmPPR. Previous reports showed that these targets might be related to flower bud development, suggesting that miRNAs might act as regulators of soybean CMS fertility. These findings may provide a better understanding of the miRNA-mediated regulatory networks in CMS mechanisms of soybean.
6

Determination of major chemical constituents and antimicrobial activities of essential oils extracted from Nonsaleable Grade (NSG) spices of Cymbopogon nardus, Rosmarinus officinalis, Thymus vulgaris and Coriandrum sativum seeds

Siying LIU et al.Sep 3, 2024
Four non-saleable grade (NSG) plant spices, including Cymbopogon nardus (citronella), Rosmarinus officinalis (rosemary), Thymus vulgaris (thyme), and Coriandrum sativum (coriander) seeds were extracted using hydro-distillation. The chemical compositions of essential oils were analyzed using gas chromatography coupled with mass spectrometry (GC-MS) and the antimicrobial activities were tested to against the microbes of Escherichia coli (E. coli), Staphylococcus aureus (S. aureus) and Candida albicans (C. albicans). Four essential oils are corresponding to the main functional substances of citronellal (29.562%), 1, 8- Cineole (62.267%), thymol (42.579%), and linalool (76.512%). Both the chemical constituents and antimicrobial activity of NSG essential oils were similar to both commercial products and those reported in previous studies, some of NSG essential oils even present better antimicrobial activity than commercial ones. This new approach of using NSG spices can help to reduce agricultural waste and increase the revenue of spice farmers.
1

The application ofNicotiana benthamianaas a Transient Expression Host to Clone the Coding Sequences of Plant Genes

Jianzhong Huang et al.Dec 11, 2022
Abstract Coding sequences (CDS) are commonly used for transient gene expression, in yeast two-hybrid screening, to verify protein interactions and in prokaryotic gene expression studies. CDS are most commonly obtained using complementary DNA (cDNA) derived from messenger RNA (mRNA) extracted from plant tissues and generated by reverse transcription. However, some CDS are difficult to acquire through this process as they are expressed at extremely low levels or have specific spatial and/or temporal expression patterns in vivo . These challenges require the development of alternative CDS cloning technologies. In this study, we found that the genomic intron-containing gene coding sequences (gDNA) from Arabidopsis thaliana, Oryza sativa, Brassica napus , and Glycine max can be correctly transcribed and spliced into mRNA in Nicotiana benthamiana . In contrast, gDNAs from Triticum aestivum and Sorghum bicolor did not function correctly. In transient expression experiments, the target DNA sequence is driven by a constitutive promoter. Theoretically, a sufficient amount of mRNA can be extracted from the N. benthamiana leaves, making it conducive to the cloning of CDS target genes. Our data demonstrate that N. benthamiana can be used as an effective host for the cloning CDS of plant genes.
0

The Relationship Between Motor Fitness, Fundamental Movement Skills, and Functional Movement Screen in Primary School Children

Hua Wu et al.Aug 4, 2020
Abstract This study investigates motor fitness (MF), fundamental movement skills (FMS), and functional movement screen (FMS™) in 7-10-year-old children, and evaluates the relationship between FMS , MF and FMS™ combination with Seefeldt’s model for empirical research, thus to present effective strategies of physical development in children. A class was randomly selected in four school grades (1-4) along with 30 students from each to take the Test of Gross Motor Development-2 (TGMD-2). A total of 117 children (42 girls, aged 7-10) participated in three tests: TGMD-2, MF tests, and FMS™. MF levels (good, fair, and poor) and FMS™ levels (high, moderate, and low) were classified according to specific percentile ranges. A multiple (R×C) chi-square test analysis of the relationship between MF, FMS, and FMS™ was applied and post hoc testing estimated the possibility of FMS and FMS™ predicting MF. The results showed that only 43% of children were rated “good” on MF. Most fourth-grade students exhibited a certain gap with mature FMS (TGMD-2 score 70.13±9.68< 96 full scores). Boys scored significantly higher on the object control subtest and the TGMD-2 total score compared to girls (p<0.001), while girls had a significantly greater score than boys on the FMS™ ( p =0.001). The results of multiple chi-square demonstrated FMS to be weakly correlated with MF, χ 2 (4,N=117) =14.605, p =0.006< 0.01, Cramer’s V = 0.25. Both 60.5% of “excellent” FMS and 59.6% of “high” FMS™ children were categorized as having a “good” MF level. On the other hand, only 23.1% of the “worst” FMS and 24.3% of “low” FMS™ individuals were classified as having a “good” MF level. Our results suggest that MF, FMS, FMS™ are relatively independent systems linking with each other, generating mutual interaction in children’s motor development. At different stages or different advantages of them motor development, we may emphasize training one or a few parts.