Spinal muscular atrophy is a neurodegenerative disease that requires multidisciplinary medical care. Recent progress in the understanding of molecular pathogenesis of spinal muscular atrophy and advances in medical technology have not been matched by similar developments in the care for spinal muscular atrophy patients. Variations in medical practice coupled with differences in family resources and values have resulted in variable clinical outcomes that are likely to compromise valid measure of treatment effects during clinical trials. The International Standard of Care Committee for Spinal Muscular Atrophy was formed in 2005, with a goal of establishing practice guidelines for clinical care of these patients. The 12 core committee members worked with more than 60 spinal muscular atrophy experts in the field through conference calls, e-mail communications, a Delphi survey, and 2 in-person meetings to achieve consensus on 5 care areas: diagnostic/new interventions, pulmonary, gastrointestinal/nutrition, orthopedics/rehabilitation, and palliative care. Consensus was achieved on several topics related to common medical problems in spinal muscular atrophy, diagnostic strategies, recommendations for assessment and monitoring, and therapeutic interventions in each care area. A consensus statement was drafted to address the 5 care areas according to 3 functional levels of the patients: nonsitter, sitter, and walker. The committee also identified several medical practices lacking consensus and warranting further investigation. It is the authors' intention that this document be used as a guideline, not as a practice standard for their care. A practice standard for spinal muscular atrophy is urgently needed to help with the multidisciplinary care of these patients.

Yanick Crow and colleagues show that mutations in ADAR1 cause the autoimmune disorder Aicardi-Goutières syndrome, accompanied by upregulation of interferon-stimulated genes. ADAR1 encodes an enzyme that catalyzes the deamination of adeonosine to inosine in double-stranded RNA, and the findings suggest a possible role for RNA editing in limiting the accumulation of repeat-derived RNA species. Adenosine deaminases acting on RNA (ADARs) catalyze the hydrolytic deamination of adenosine to inosine in double-stranded RNA (dsRNA) and thereby potentially alter the information content and structure of cellular RNAs. Notably, although the overwhelming majority of such editing events occur in transcripts derived from Alu repeat elements, the biological function of non-coding RNA editing remains uncertain. Here, we show that mutations in ADAR1 (also known as ADAR) cause the autoimmune disorder Aicardi-Goutières syndrome (AGS). As in Adar1-null mice, the human disease state is associated with upregulation of interferon-stimulated genes, indicating a possible role for ADAR1 as a suppressor of type I interferon signaling. Considering recent insights derived from the study of other AGS-related proteins, we speculate that ADAR1 may limit the cytoplasmic accumulation of the dsRNA generated from genomic repetitive elements.

Aicardi-Goutieres syndrome is a genetically determined encephalopathy that is associated with an increased production of interferon alpha, which in turn is central to the pathogenesis of systemic lupus erythematosus. Yanick Crow and colleagues now identify homozygous mutations in an interferon-inducible nuclear gene encoding SAMHD1 in AGS-affected individuals across several pedigrees and characterize its function in modulating an innate immune response. Aicardi-Goutières syndrome is a mendelian mimic of congenital infection and also shows overlap with systemic lupus erythematosus at both a clinical and biochemical level. The recent identification of mutations in TREX1 and genes encoding the RNASEH2 complex and studies of the function of TREX1 in DNA metabolism have defined a previously unknown mechanism for the initiation of autoimmunity by interferon-stimulatory nucleic acid. Here we describe mutations in SAMHD1 as the cause of AGS at the AGS5 locus and present data to show that SAMHD1 may act as a negative regulator of the cell-intrinsic antiviral response.

We take a new, scenario-based look at evaluation in information visualization. Our seven scenarios, evaluating visual data analysis and reasoning, evaluating user performance, evaluating user experience, evaluating environments and work practices, evaluating communication through visualization, evaluating visualization algorithms, and evaluating collaborative data analysis were derived through an extensive literature review of over 800 visualization publications. These scenarios distinguish different study goals and types of research questions and are illustrated through example studies. Through this broad survey and the distillation of these scenarios, we make two contributions. One, we encapsulate the current practices in the information visualization research community and, two, we provide a different approach to reaching decisions about what might be the most effective evaluation of a given information visualization. Scenarios can be used to choose appropriate research questions and goals and the provided examples can be consulted for guidance on how to design one's own study.

Neurodegenerative disorders with high brain iron include Parkinson disease, Alzheimer disease and several childhood genetic disorders categorized as neuroaxonal dystrophies. We mapped a locus for infantile neuroaxonal dystrophy (INAD) and neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA) to chromosome 22q12-q13 and identified mutations in PLA2G6, encoding a calcium-independent group VI phospholipase A2, in NBIA, INAD and the related Karak syndrome. This discovery implicates phospholipases in the pathogenesis of neurodegenerative disorders with iron dyshomeostasis.

SummaryLeigh disease associated with cytochrome c oxidase deficiency (LD[COX−]) is one of the most common disorders of the mitochondrial respiratory chain, in infancy and childhood. No mutations in any of the genes encoding the COX-protein subunits have been identified in LD(COX−) patients. Using complementation assays based on the fusion of LD(COX−) cell lines with several rodent/human rho0 hybrids, we demonstrated that the COX phenotype was rescued by the presence of a normal human chromosome 9. Linkage analysis restricted the disease locus to the subtelomeric region of chromosome 9q, within the 7-cM interval between markers D9S1847 and D9S1826. Candidate genes within this region include SURF-1, the yeast homologue (SHY-1) of which encodes a mitochondrial protein necessary for the maintenance of COX activity and respiration. Sequence analysis of SURF-1 revealed mutations in numerous DNA samples from LD(COX−) patients, indicating that this gene is responsible for the major complementation group in this important mitochondrial disorder. Leigh disease associated with cytochrome c oxidase deficiency (LD[COX−]) is one of the most common disorders of the mitochondrial respiratory chain, in infancy and childhood. No mutations in any of the genes encoding the COX-protein subunits have been identified in LD(COX−) patients. Using complementation assays based on the fusion of LD(COX−) cell lines with several rodent/human rho0 hybrids, we demonstrated that the COX phenotype was rescued by the presence of a normal human chromosome 9. Linkage analysis restricted the disease locus to the subtelomeric region of chromosome 9q, within the 7-cM interval between markers D9S1847 and D9S1826. Candidate genes within this region include SURF-1, the yeast homologue (SHY-1) of which encodes a mitochondrial protein necessary for the maintenance of COX activity and respiration. Sequence analysis of SURF-1 revealed mutations in numerous DNA samples from LD(COX−) patients, indicating that this gene is responsible for the major complementation group in this important mitochondrial disorder.

This is the second half of a two-part document updating the standard of care recommendations for spinal muscular atrophy published in 2007. This part includes updated recommendations on pulmonary management and acute care issues, and topics that have emerged in the last few years such as other organ involvement in the severe forms of spinal muscular atrophy and the role of medications. Ethical issues and the choice of palliative versus supportive care are also addressed. These recommendations are becoming increasingly relevant given recent clinical trials and the prospect that commercially available therapies will likely change the survival and natural history of this disease.

Spinal muscular atrophy (SMA) is a neurodegenerative disease associated with severe muscle atrophy and weakness in the limbs and trunk. We report interim efficacy and safety outcomes as of March 29, 2019 in 25 children with genetically diagnosed SMA who first received nusinersen in infancy while presymptomatic in the ongoing Phase 2, multisite, open-label, single-arm NURTURE trial. Fifteen children have two SMN2 copies and 10 have three SMN2 copies. At last visit, children were median (range) 34.8 [25.7-45.4] months of age and past the expected age of symptom onset for SMA Types I or II; all were alive and none required tracheostomy or permanent ventilation. Four (16%) participants with two SMN2 copies utilized respiratory support for ≥6 h/day for ≥7 consecutive days that was initiated during acute, reversible illnesses. All 25 participants achieved the ability to sit without support, 23/25 (92%) achieved walking with assistance, and 22/25 (88%) achieved walking independently. Eight infants had adverse events considered possibly related to nusinersen by the study investigators. These results, representing a median 2.9 years of follow up, emphasize the importance of proactive treatment with nusinersen immediately after establishing the genetic diagnosis of SMA in presymptomatic infants and emerging newborn screening efforts.