Oilseed rape (Brassica napus L.) was formed ~7500 years ago by hybridization between B. rapa and B. oleracea, followed by chromosome doubling, a process known as allopolyploidy. Together with more ancient polyploidizations, this conferred an aggregate 72× genome multiplication since the origin of angiosperms and high gene content. We examined the B. napus genome and the consequences of its recent duplication. The constituent An and Cn subgenomes are engaged in subtle structural, functional, and epigenetic cross-talk, with abundant homeologous exchanges. Incipient gene loss and expression divergence have begun. Selection in B. napus oilseed types has accelerated the loss of glucosinolate genes, while preserving expansion of oil biosynthesis genes. These processes provide insights into allopolyploid evolution and its relationship with crop domestication and improvement.

Brassica napus (AACC, 2n=38), is an important oilseed crop grown worldwide. However, little is known about the population evolution of this species, the genomic difference between its major genetic clusters, such as European and Asian rapeseed, and impacts of historical large-sale introgression events in this young tetraploid. In this study, we reported the de novo assembly of the genome sequences of an Asian rapeseed (B. napus), Ningyou 7 and its four progenitors and carried out de novo assembly-based comparison, pedigree and population analysis with other available genomic data from diverse European and Asian cultivars. Our results showed that Asian rapeseed originally derived from European rapeseed, but it had subsequently significantly diverged, with rapid genome differentiation after intensive local breeding selection. The first historical introgression of B. rapa dramatically broadened the allelic pool of Asian B. napus, but decreased their deleterious variations. The secondary historical introgression of European rapeseed (canola-quality) has reshaped Asian rapeseed into two groups, accompanied by an increase in genetic load. This study demonstrates distinctive genomic footprints by recent intra- and inter-species introgression events for local adaptation, and provide novel insights for understanding the rapid genome evolution of a young allopolyploid crop.

Ultraviolet B (UV-B) is a significant environmental factor affecting insect development, survival, and reproduction. DNAJ proteins are molecular chaperones found ubiquitously in insects that are crucial for their adaptation to environmental stresses. This study aimed to elucidate the roles of DNAJ genes in the response of Myzus persicae to UV-B stress. Herein, we identified six DNAJ genes in the aphid M. persicae, a devastating agricultural pest. We analyzed their expression profiles at different stages of development, in different tissues and for various durations of UV-B exposure. The expression levels of MpDNAJC30, MpDNAJC11, MpDNAJC2, and MpDNAJC3 were highest in wingless adults, while MpDNAJC9 and MpDNAJC17 were highest in second- and third-instar nymphs, respectively. Six MpDNAJs had higher expression levels in the epidermis and embryos, and lower levels in the head. Additionally, the expression levels of all genes increased significantly under different durations of UV-B exposure. Knockout of the DNAJ genes using RNA interference caused a significant decline in the survival rate, weight, body length, and body width of M. persicae exposed to UV-B radiation. Our research provides valuable insights into the stress response mechanisms of M. persicae, highlighting the importance of DNAJ genes in mediating their adaptation to UV-B stress.