Recent studies have indicated that serine phosphorylation regulates the activities of STAT1 and STAT3. However, the kinase(s) responsible and the role of serine phosphorylation in STAT function remain unresolved. In the present studies, we examined the growth factor-dependent serine phosphorylation of STAT1 and STAT3. We provide in vitro and in vivo evidence that the ERK family of mitogen-activated protein (MAP) kinases, but not JNK or p38, specifically phosphorylate STAT3 at serine 727 in response to growth factors. Evidence for additional mitogen-regulated serine phosphorylation is also provided. STAT1 is a relatively poor substrate for all MAP kinases tested both in vitro and in vivo. STAT3 serine phosphorylation, not its tyrosine phosphorylation, results in retarded mobility of the STAT3 protein on sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis. Importantly, serine 727 phosphorylation negatively modulates STAT3 tyrosine phosphorylation, which is required for dimer formation, nuclear translocation, and the DNA binding activity of this transcriptional regulator. Interestingly, the cytokine interleukin-6 also stimulates STAT3 serine phosphorylation, but in contrast to growth factors, this occurs by an ERK-independent process.

PTEN-induced putative kinase 1 (PINK1) and Parkin, encoded by their respective genes associated with Parkinson's disease (PD), are linked in a common pathway involved in the protection of mitochondrial integrity and function. However, the mechanism of their interaction at the biochemical level has not been investigated yet. Using both mammalian and Drosophila systems, we here demonstrate that the PINK1 kinase activity is required for its function in mitochondria. PINK1 regulates the localization of Parkin to the mitochondria in its kinase activity-dependent manner. In detail, Parkin phosphorylation by PINK1 on its linker region promotes its mitochondrial translocation, and the RING1 domain of Parkin is critical for this occurrence. These results demonstrate the biochemical relationship between PINK1, Parkin, and the mitochondria and thereby suggest the possible mechanism of PINK-Parkin-associated PD pathogenesis.

Glypican-3 (GPC3) is overexpressed in hepatocellular carcinomas and hepatoblastomas and represents an important therapeutic target but the biologic importance of GPC3 in liver cancer is unclear. To date, there are limited data characterizing the biological implications of GPC3 knockout (KO) in liver cancers that intrinsically express this target. Here, we report on the development and characterization of GPC3-KO liver cancer cell lines and compare to them to parental lines. GPC3-KO variants were established in HepG2 and Hep3B liver cancer cell lines using a lentivirus-mediated CRISPR/Cas9 system. We assessed the effects of GPC3 deficiency on oncogenic properties

Abstract Parkinson’s disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder. However, cell type-dependent transcriptional regulatory programs responsible for PD pathogenesis remain elusive. Here, we establish transcriptomic and epigenomic landscapes of the substantia nigra (SN) by profiling 87,733 nuclei obtained from healthy controls and PD patients. Our multi-omic data integration provides functional annotation of 128,724 cis -regulatory elements ( c REs) and uncovers cell-type specific dysregulated c REs with a strong transcriptional influence on genes implicated in PD. The establishment of high-resolution three-dimensional chromatin contact maps identifies 656 target genes of dysregulated c REs and genetic risk loci, including both novel candidates and known PD risk genes. Notably, these new PD candidate genes exhibit modular gene expression patterns with unique molecular signatures in distinct cell types. Thus, our single-cell transcriptome and epigenome uncover cell type-specific disrupted transcriptional regulations in PD. Teaser Single-cell transcriptome and epigenome uncover cell type-specific disrupted transcriptional regulations in Parkinson’s disease.