YX
Yuewen Xu
Author with expertise in Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptomic Data
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
47
h-index:
17
/
i10-index:
20
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

PPAR-γ activation promotes xenogenic bioroot regeneration by attenuating the xenograft induced-oxidative stress

Tingting Lan et al.Mar 30, 2022
Objective xenogenic organ transplantation has been considered the most promising strategy in providing possible subtitutes with physiological function of the failing organs as well as solving the problem of insufficient donor sources. However, the xenograft, suffered from immune rejection and ischemia-reperfusion injury (IRI), causes massive ROS expression and the subsequent cell apoptosis, leading to the xenograft failure. Our previous study found a positive role of PPAR-γ in anti-inflammation through its immunomodulation effects, which inspires us to apply PPAR-γ agonist rosiglitazone (RSG) to address survival issue of xenograft with the potential to eliminate the excessive ROS. Methods X enogenic bioroot was constructed by wrapping the dental follicle cells (DFC) with porcine extracellular matrix (pECM). The hydrogen peroxide (H 2 O 2 )-induced DFC was pretreated with RSG to observe its protection on the damaged biological function. Immunoflourescence staining and transmission electron microscope were used to detect the intracellular ROS level. SD rat orthotopic transplantation model and SOD1 knockout mice subcutaneous transplantation model were applied to explore the regenerative outcome of the xenograft. Results RSG pretreatment significantly reduced the adverse effects of H 2 O 2 on DFC with decreased intracellular ROS expression and alleviated mitochondrial damage. In vivo results confirmed RSG administration substantially enhanced the host’s antioxidant capacity with reduced osteoclasts formation and increased periodontal ligament like tissue regeneration efficiency, maximumly maintaining the xenograft function. Conclusions RSG preconditioning could preserve the biological properties of the transplanted stem cells under OS microenvironment and promote organ regeneration by attenuating the inflammatory reaction and OS injury.
5

Identification of age and ethnicity specific gene expression biomarkers for immune aging

Yang Hu et al.Feb 22, 2021
ABSTRACT Human immune system functions over an entire lifetime, yet how and why the immune system becomes less effective with age are not well understood. Here, we characterize peripheral blood mononuclear cells transcriptome from 172 healthy adults with 21~90 years of age using RNA-seq and the weighted gene correlation network analyses (WGCNA). These data reveal a set of insightful gene expression modules and representative gene biomarkers for human immune system aging from Asian and Caucasian ancestry, respectively. Among them, the aging-specific modules show an age-related gene expression variation spike around early-seventies. In addition, it is not known whether Asian and Caucasian immune systems go through similar gene expression changes throughout their lifespan, and to what extent these aging-associated changes are shared among ethnicities. We find the top hub genes including NUDT7, CLPB, OXNAD1 and MLLT3 are shared between Asian and Caucasian aging related modules and further validated in human PBMCs from different age groups. Overall, the impact of age and race on transcriptional variation elucidated from this study provide insights into the transcriptional driver of immune aging.