PR
Paula Reyes‐Pérez
Author with expertise in Challenges and Innovations in Bioinformatics Education
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
8
/
i10-index:
7
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
4

The IPDGC/GP2 Hackathon - an open science event for training in data science, genomics, and collaboration using Parkinson’s disease data

Hampton Leonard et al.May 10, 2022
Abstract Background Open science and collaboration are necessary to facilitate the advancement of Parkinson’s disease (PD) research. Hackathons are collaborative events that bring together people with different skill sets and backgrounds to generate resources and creative solutions to problems. These events can be used as training and networking opportunities. Objective To coordinate a virtual hackathon to develop novel PD research tools. Methods 49 early career scientists from 12 countries collaborated in a virtual 3-day hackathon event in May 2021, during which they built tools and pipelines with a focus on PD. Resources were created with the goal of helping scientists accelerate their own research by having access to the necessary code and tools. Results Each team was allocated one of nine different projects, each with a different goal. These included developing post-genome-wide association studies (GWAS) analysis pipelines, downstream analysis of genetic variation pipelines, and various visualization tools. Conclusion Hackathons are a valuable approach to inspire creative thinking, supplement training in data science, and foster collaborative scientific relationships, which are foundational practices for early career researchers. The resources generated can be used to accelerate research on the genetics of PD.
0

Building national patient registries in Mexico: insights from the MexOMICS Consortium

Paula Reyes‐Pérez et al.Jun 4, 2024
Objective To introduce MexOMICS, a Mexican Consortium focused on establishing electronic databases to collect, cross-reference, and share health-related and omics data on the Mexican population. Methods Since 2019, the MexOMICS Consortium has established three electronic-based registries: the Mexican Twin Registry (TwinsMX), Mexican Lupus Registry (LupusRGMX), and the Mexican Parkinson's Research Network (MEX-PD), designed and implemented using the Research Electronic Data Capture web-based application. Participants were enrolled through voluntary participation and on-site engagement with medical specialists. We also acquired DNA samples and Magnetic Resonance Imaging scans in subsets of participants. Results The registries have successfully enrolled a large number of participants from a variety of regions within Mexico: TwinsMX ( n = 2,915), LupusRGMX ( n = 1,761) and MEX-PD ( n = 750). In addition to sociodemographic, psychosocial, and clinical data, MexOMICS has collected DNA samples to study the genetic biomarkers across the three registries. Cognitive function has been assessed with the Montreal Cognitive Assessment in a subset of 376 MEX-PD participants. Furthermore, a subset of 267 twins have participated in cognitive evaluations with the Creyos platform and in MRI sessions acquiring structural, functional, and spectroscopy brain imaging; comparable evaluations are planned for LupusRGMX and MEX-PD. Conclusions The MexOMICS registries offer a valuable repository of information concerning the potential interplay of genetic and environmental factors in health conditions among the Mexican population.