HY
Hong You
Author with expertise in Epidemiology and Management of NAFLD
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(58% Open Access)
Cited by:
6
h-index:
36
/
i10-index:
118
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Long‐term antiviral therapy is associated with changes in the profile of transcriptionally active HBV integration in the livers of patients with CHB

Xiajie Wen et al.May 31, 2024
Abstract Hepatitis B virus (HBV) integration exists throughout the clinical course of chronic hepatitis B (CHB). This study investigated the effects of long‐term antiviral therapy on the level and profiles of transcriptionally active HBV integration. Serial liver biopsies and paired blood samples were obtained from 16, 16, and 22 patients with CHB at baseline, 78, and 260 weeks of entecavir monotherapy or combined with pegylated interferon alfa, respectively. Serum HBV biomarkers were longitudinally assessed. RNA‐seq and HIVID2 program was used to identify HBV‐host chimeric RNAs transcribed from integrated DNA. The counts of HBV integration reads were positively related to both serum HBV DNA levels ( r = 0.695, p = 0.004) and HBeAg titers ( r = 0.724, p = 0.021) at baseline, but the positive correlation exited only to the serum HBsAg levels after 260 weeks of antiviral therapy ( r = 0.662, p = 0.001). After 78 weeks of antiviral therapy, the levels of HBV integration expression decreased by 12.25 folds from baseline. The viral junction points were enriched at the S and HBx genes after the long‐term antiviral therapy. HBs‐FN1 became one of the main transcripts, with the mean proportion of HBs‐FN1 in all integrated expression increased from 2.79% at baseline to 10.54% at Week 260 of antiviral treatment. Antiviral therapy may reduce but not eliminate the HBV integration events and integration expression. Certain integration events, such as HBs‐FN1 can persist in long‐term antiviral treatment.
0
Citation2
0
Save
0

Atlas of mildly and highly insoluble matrisome driving liver fibrosis

Wen Zhang et al.Sep 2, 2024
The excessive deposition and cross-linking of core matrisome components typically result in abnormal remodeling of the extracellular matrix (ECM), leading to increased liver stiffness and worsening liver fibrosis. Exploring the biochemical properties of the ECM scaffold can deepen our understanding of the pathological mechanisms driving liver fibrosis and potentially facilitate the identification of therapeutic targets. While traditional sodium dodecyl sulfate (SDS)-based liver decellularization followed by proteomics can uncover the matrisome components within the ECM scaffold, it lacks the ability to reveal physicochemical characteristics like solubility. In our present study, using adult mouse liver as an example, we introduced a novel two-step workflow that combines our previously enhanced SDS (ESDS) decellularization with the conventional SDS method, enabling the identification of matrisome members with mild and/or high solubilities. Through this approach, we visualized the atlas of the mildly and highly insoluble matrisome contents in the adult mouse liver, as well as the regulatory network of highly insoluble matrisome that largely governs liver stiffness. Given the strong correlation between increased matrisome insolubility and heightened ECM stiffness, we believe that this methodology holds promise for future research focused on liver stiffness.
1

CryoFIB milling large tissue samples for cryo-electron tomography

Sihan Wang et al.Oct 5, 2022
Abstract Cryo-electron tomography (cryoET), a powerful tool for exploring the molecular structure of large organisms. However, technical challenges still limit cryoET applications on large samples. In particular, locating and cutting out objects of interest from a large tissue sample is an important but difficult step. In this study, we report a sample thinning strategy and workflow for tissue samples based on cryo-focused ion beam (cryoFIB) milling. This workflow provides a full solution for isolating objects of interest by starting from a millimeter-sized tissue sample and ending with hundred-nanometer thin lamellae. The workflow involves sample fixation, pre-sectioning, a two-step milling strategy, and locating the object of interest using cellular secondary electron imaging (CSEI). The two-step milling strategy introduces a coarse milling method to solve the milling efficiency problem for samples as thick as tens of microns, followed by a fine milling method to create a furrow-ridge structure. The furrow-ridge structure guarantees the generation of large, thin lamellae with enhanced mechanical stability and charge-reducing design. CSEI is highlighted in the workflow, which provides conventional, on-the-fly locating during cryoFIB milling. Tests of the complete workflow were conducted to demonstrate the high efficiency and high feasibility of the proposed method.
4

Repopulating Kupffer Cells Originate Directly from Hematopoietic Stem Cells

Fan Xu et al.Jul 31, 2020
Abstract Kupffer cells (KCs) originate from yolk sac progenitors before birth. Throughout adulthood, they self-maintain independently from the input of circulating monocytes (MOs) at stead state, and are replenished within 2 weeks after having been depleted, but the origin of repopulating KCs in adult remains unclear. The current paradigm dictates that repopulating KCs originate from preexisting KCs or monocytes, but there remains a lack of fate-mapping evidence. In current study, we firstly traced the fate of preexisting KCs and that of monocytic cells with tissue-resident macrophage-specific and monocytic cell-specific fate mapping mouse models, respectively, and found no evidences that repopulating KCs originate from preexisting KCs or MOs. Secondly, we performed genetic lineage tracing to determine the type of progenitor cells involved in response to KC depletion in mice, and found that in response to KC depletion, hematopoietic stem cells (HSCs) proliferated in the bone marrow, mobilized into the blood, adoptively transferred into the liver and differentiated into KCs. Finally, we traced the fate of HSCs in a HSC-specific fate-mapping mouse model, in context of chronic liver inflammation induced by repeated carbon tetrachloride treatment, and confirmed that repopulating KCs originated directly from HSCs. Taken together, these findings provided strong in vivo fate-mapping evidences that repopulating KCs originate directly from Hematopoietic stem cells not from preexisting KCs or from MOs. Significance There is a standing controversy in the field regarding the cellular origin of repopulating macrophages. This paper provides strong in vivo fate-mapping evidences that repopulating KCs originate directly from hematopoietic stem cells not from preexisting KCs or from MOs, which presenting a completely novel understanding of the cellular origin of repopulating Kupffer Cells and shedding light on the divergent roles of KCs in liver homeostasis and diseases.
0

L-Theanine Inhibits Chemoresistance of Lung Cancer Cells to Cisplatin by Regulating STAT3/NOTCH1-BMAL1 Signaling

Wenjing Jin et al.Jun 21, 2024
Background: L-Theanine, a nonproteinogenic amino acid derived from green tea, is being recognized as an anti-cancer candidate. However, it's roles in the development of cancer chemoresistance is still unknown and the molecular mechanism is urgently to be explored. Methods: The effects of L-Theanine on lung cancer chemoresistance were validated by Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay, transwell assay, and in vitro tumor spheroid formation assay; the expression of proteins was detected by using polymerase chain reaction (PCR) and western blotting. RNA-sequencing (RNA-seq) and bioinformatics analysis were used to identify differentially expressed genes induced by L-Theanine. BMAL1 knockdown and overexpression were constructed by using a lentivirus-mediated transfection system. Results: L-Theanine improved the chemoresistance to cis-diamminedichloroplatinum (DDP) and inhibited stemness of DDP-resistant lung cancer cells but not non-resistant lung cancer cells. The results from RNA-seq analysis showed that STAT3/NOTCH1 pathway was a potential dominant signaling involved in L-Theanine improving the chemoresistance in DDP-resistant lung cancer. Mechanistically, L-Theanine impeded migration and stemness activation of DDP-resistant lung cancer cells via regulating the expression of STAT3/NOTCH1/BMAL1 signaling-induced stemness markers as well as inhibiting the expression levels of drug resistance-related genes. In addition, a combination of L-Theanine and Stat3 blockade synergistically improved the chemoresistance in DDP-resistant lung cancer. Conclusion: L-Theanine improves the chemoresistance by regulating STAT3/NOTCH1/BMAL1 signaling, reducing stemness, and inhibiting the migration of DDP-resistant lung cancer cells. The finding might provide some evidence for therapeutic options in overcoming the chemoresistance in cancers, including lung cancer.
Load More