JY
Jian Yang
Author with expertise in RNA Sequencing Data Analysis
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(33% Open Access)
Cited by:
323
h-index:
25
/
i10-index:
59
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

MiR-21 protected human glioblastoma U87MG cells from chemotherapeutic drug temozolomide induced apoptosis by decreasing Bax/Bcl-2 ratio and caspase-3 activity

Lei Shi et al.Jul 14, 2010
MicroRNAs (miRNAs) are small noncoding RNA molecules that regulate protein expression by cleaving or repressing the translation of target mRNAs. In mammal animals, their function mainly represses the target mRNAs transcripts via imperfectly complementary to the 3′UTR of target mRNAs. Several miRNAs have been recently reported to be involved in modulation of glioma development, especially some up-regulated miRNAs, such as microRNA-21 (miR-21), which has been found to function as an oncogene in cultured glioblastoma multiforme cells. Temozolomide (TMZ), an alkylating agent, is a promising chemotherapeutic agent for treating glioblastoma. However, resistance develops quickly and with high frequency. To explore the mechanism of resistance, we found that miR-21 could protect human glioblastoma U87MG cells from TMZ induced apoptosis. Our studies showed that TMZ markedly enhanced apoptosis in U87MG cells compared with untreated cells (P < 0.05). However, over-express miR-21 in U87MG cells could significantly reduce TMZ-induced apoptosis (P < 0.05). Pro-apoptotic Bax and anti-apoptotic Bcl-2 proteins are known to regulate the apoptosis of glioma cells. Bcl-2, resistance to induction of apoptosis, constitutes one major obstacle to chemotherapy in many cancer cells. Bax is shown to correlate with an increased survival of glioblastoma multiforme patients. Further research demonstrated that the mechanism was associated with a shift in Bax/Bcl-2 ratio and change in caspase-3 activity. Compared to control cells, cells treated with TMZ showed a significant increase in the Bax/Bcl-2 ratio and caspase-3 activity (P < 0.01). However, such effect was partly prevented by treatment of cells with miR-21 overexpression before, which appeared to downregulate the Bax expression, upregulate the Bcl-2 expression and decrease caspase-3 activity. Taken together, these results suggested that over-express miR-21 could inhibit TMZ-induced apoptosis in U87MG cells, at least in part, by decreasing Bax/Bcl-2 ratio and caspase-3 activity, which highlighted the possibility of miR-21 overexpression in the clinical resistance to chemotherapeutic therapy of TMZ.
3

Comparative analysis of chloroplast genome between wild and cultivatedRehmannia glutinosa Libosch

Hao Yang et al.Dec 22, 2022
ABSTRACT Rehmanniae radix, as a tonic Chinese medicine, has a good therapeutic effect on cardiovascular and cerebrovascular diseases and central nervous system diseases, and has a good development prospect in the international market. R . glutinosa Libosch has a large number of source varieties, and the wild and cultivated varieties are different types of R . glutinosa Libosch. There has been a lot of controversy in the formulation of scientific names for wild and cultivated types of R . glutinosa Libosch. In order to learn more about the genetic information of wild R . glutinosa Libosch and explore the phylogenetic relationship between wild R . glutinosa Libosch and cultivated R . glutinosa Libosch. In the current study, we constructed and annotated a complete circular chloroplast genome of wild R . glutinosa Libosch. The chloroplast genome of wild R . glutinosa Libosch . is 153,678 bp in length, including two inverted repeat (IR) regions of 25,759 bp, separated by a large single copy (LSC) region of 84,544 bp and a small single copy (SSC) region of 17,616 bp. The GC content of whole chloroplast genome is 37.9%. The genome contains 133 different genes, including 88 protein-coding genes, 37 tRNA genes, and 8 rRNA genes. Among them, 23 genes contained introns, 50 SSR loci and 49 long repeats were found by Microsatellite scan, and codon use showed obvious A, T base preference. Nine variation regions were screened by mVISTA analysis and combined with DnaSP analysis, and psaJ-rpl33 was finally identified as a region with high variation, which could be used as a candidate DNA barcode for later interspecific identification of R . glutinosa Libosch.. Neighbor-joining method phylogenomic analysis showed that wild R . glutinosa Libosch . formed a monophyletic group, and was sister to other groups of R . glutinosa Libosch .The results of this study revealed the chloroplast genome information of wild R . glutinosa Libosch in detail, and found the genetic information difference between wild and cultivated R . glutinosa Libosch . which laid the foundation for the variety identification, genetic engineering, biosynthesis and other studies.
0

High-risk factors and predictive models for hemorrhagic chronic radiation proctitis

Zhongli Liao et al.Jan 10, 2025
Hemorrhagic chronic radiation proctitis (CRP) is a common and challenging complication after pelvic radiation therapy. Identifying high-risk factors, predicting its occurrence, and optimizing radiotherapy plans are key to preventing hemorrhagic CRP. This study retrospectively examined potential risk factors and developed a nomogram to predict its onset. This retrospective study included cervical carcinoma patients who received pelvic radiotherapy at Chongqing University Cancer Hospital from March 2014 to December 2021. Hemorrhagic CRP was diagnosed by colonoscopy. Logistic regression identified factors for a nomogram model, which was evaluated using ROC curve, calibration curve, and decision curve analysis. Among 221 patients, 125 were diagnosed with hemorrhagic CRP, occurring at a median of 14.45 months after pelvic radiotherapy. Age (≥ 54 years), weight (< 52 kg), and radiation dose (≥ 72 Gy) were identified as risk factors. A nomogram was developed, with AUC values of 0.741 and 0.74 in the training and validation cohorts. Decision and clinical impact curves showed the model's benefit over a probability range of 0.25 to 0.85 in both sets. In this study, we constructed and developed a nomogram for predicting hemorrhagic CRP risk. The good results in calibration curves, ROC curve analysis, and decision curves indicated that the nomogram had promise for clinical application. It may serve as a reference for radiologists in designing radiotherapy plan to help mitigate the risk of hemorrhagic CRP.