HI
Hiroki Ikeda
Author with expertise in Real-Time Polymerase Chain Reaction
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
1,033
h-index:
15
/
i10-index:
22
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Novel scoring system and algorithm for classifying chronic rhinosinusitis: the JESREC Study

Toshiteru Tokunaga et al.May 6, 2015
Abstract Background Chronic rhinosinusitis ( CRS ) can be classified into CRS with nasal polyps ( CRS w NP ) and CRS without nasal polyps ( CRS s NP ). CRS w NP displays more intense eosinophilic infiltration and the presence of Th2 cytokines. Mucosal eosinophilia is associated with more severe symptoms and often requires multiple surgeries because of recurrence; however, even in eosinophilic CRS ( ECRS ), clinical course is variable. In this study, we wanted to set objective clinical criteria for the diagnosis of refractory CRS . Methods This was a retrospective study conducted by 15 institutions participating in the Japanese Epidemiological Survey of Refractory Eosinophilic Chronic Rhinosinusitis ( JESREC ). We evaluated patients with CRS treated with endoscopic sinus surgery ( ESS ), and risk of recurrence was estimated using Cox proportional hazard models. Multiple logistic regression models and receiver operating characteristics curves were constructed to create the diagnostic criterion for ECRS . Results We analyzed 1716 patients treated with ESS . To diagnose ECRS , the JESREC scoring system assessed unilateral or bilateral disease, the presence of nasal polyps, blood eosinophilia, and dominant shadow of ethmoid sinuses in computed tomography ( CT ) scans. The cutoff value of the score was 11 points (sensitivity: 83%, specificity: 66%). Blood eosinophilia (>5%), ethmoid sinus disease detected by CT scan, bronchial asthma, aspirin, and nonsteroidal anti‐inflammatory drugs intolerance were associated significantly with recurrence. Conclusion We subdivided CRS w NP in non‐ ECRS , mild, moderate, and severe ECRS according to our algorithm. This classification was significantly correlated with prognosis. It is notable that this algorithm may give useful information to clinicians in the refractoriness of CRS before ESS or biopsy.
0

Hyperglycemia causes oxidative stress in pancreatic beta-cells of GK rats, a model of type 2 diabetes.

Yu Ihara et al.Apr 1, 1999
Reactive oxygen species are involved in a diversity of biological phenomena such as inflammation, carcinogenesis, aging, and atherosclerosis. We and other investigators have shown that the level of 8-hydroxy-2'-deoxyguanosine (8-OHdG), a marker for oxidative stress, is increased in either the urine or the mononuclear cells of the blood of type 2 diabetic patients. However, the association between type 2 diabetes and oxidative stress in the pancreatic beta-cells has not been previously described. We measured the levels of 8-OHdG and 4-hydroxy-2-nonenal (HNE)-modified proteins in the pancreatic beta-cells of GK rats, a model of nonobese type 2 diabetes. Quantitative immunohistochemical analyses with specific antibodies revealed higher levels of 8-OHdG and HNE-modified proteins in the pancreatic beta-cells of GK rats than in the control Wistar rats, with the levels increasing proportionally with age and fibrosis of the pancreatic islets. We further investigated whether the levels of 8-OHdG and HNE-modified proteins would be modified in the pancreatic beta-cells of GK rats fed with 30% sucrose solution or 50 ppm of voglibose (alpha-glucosidase inhibitor). In the GK rats, the levels of 8-OHdG and HNE-modified proteins, as well as islet fibrosis, were increased by sucrose treatment but reduced by voglibose treatment. These results indicate that the pancreatic beta-cells of GK rats are oxidatively stressed, and that chronic hyperglycemia might be responsible for the oxidative stress observed in the pancreatic beta-cells.
0
Citation502
0
Save
1

Histology-associated transcriptomic heterogeneity in ovarian folliculogenesis revealed by quantitative single-cell RNA-sequencing for tissue sections with DRaqL

Hiroki Ikeda et al.Dec 16, 2022
ABSTRACT High-quality single-cell RNA-sequencing (RNA-seq) with spatial resolution remains challenging. Laser capture microdissection (LCM) is a widely used, potent approach to isolate arbitrarily targeted cells from tissue sections for comprehensive transcriptomics. Here, we developed DRaqL (direct RNA recovery and quenching for LCM), an experimental approach for efficient lysis of single cells isolated by LCM from alcohol- and formalin-fixed sections without RNA purification. Single-cell RNA-seq combined with DRaqL allowed transcriptomic profiling from alcohol-fixed sections with efficiency comparable to that of profiling from freshly dissociated cells, together with effective exon– exon junction profiling. Furthermore, the combination of DRaqL and protease treatment enabled robust and efficient single-cell transcriptome analysis from tissue sections strongly fixed with formalin. Applying this method to mouse ovarian sections, we revealed a transcriptomic continuum of growing oocytes quantitatively associated with oocyte size, and detected oocyte-specific splice isoforms. In addition, our statistical model revealed heterogeneity of the relationship between the transcriptome of oocytes and their size, resulting in identification of a size–transcriptome relationship anomaly in a subset of oocytes. Finally, we identified genes that were differentially expressed in granulosa cells in association with the histological affiliations of granulosa cells to the oocytes, suggesting distinct epigenetic regulations and cell-cycle activities governing the germ–soma relationship. Thus, we developed a versatile, efficient approach for robust single-cell cDNA amplification from tissue sections and provided an experimental platform conducive to high-quality transcriptomics, thereby revealing histology-associated transcriptomic heterogeneity in folliculogenesis in ovarian tissues.
1
Citation1
0
Save