Abstract Chinese cherry (Prunus pseudocerasus) holds considerable importance as one of the primary stone fruit crops in China. However, artificially improving its traits and genetic analysis are challenging due to lack of high-quality genomic resources, which mainly result from difficulties associated with resolving its tetraploid and highly heterozygous genome. Herein, we assembled a chromosome-level, haplotype-resolved genome of the cultivar ‘Zhuji Duanbing’, comprising 993.69 Mb assembled into 32 pseudochromosomes using PacBio HiFi, Oxford Nanopore, and Hi-C. Intra-haplotype comparative analyses revealed extensive intra-genomic sequence and expression consistency. Phylogenetic and comparative genomic analyses demonstrated that P. pseudocerasus was a stable autotetraploid species, closely related to wild P. pusilliflora, with the two diverging ~18.34 million years ago. Similar to other Prunus species, P. pseudocerasus underwent a common whole-genome duplication event that occurred ~139.96 million years ago. Because of its low fruit firmness, P. pseudocerasus is unsuitable for long-distance transportation, thereby restricting its rapid development throughout China. At the ripe fruit stage, P. pseudocerasus cv. ‘Zhuji Duanbing’ was significantly less firm than P. avium cv. ‘Heizhenzhu’. The difference in firmness is attributed to the degree of alteration in pectin, cellulose, and hemicellulose contents. In addition, comparative transcriptomic analyses identified GalAK-like and Stv1, two genes involved in pectin biosynthesis, which potentially caused the difference in firmness between ‘Zhuji Duanbing’ and ‘Heizhenzhu’. Transient transformations of PpsGalAK-like and PpsStv1 increase protopectin content and thereby enhance fruit firmness. Our study lays a solid foundation for functional genomic studies and the enhancement of important horticultural traits in Chinese cherries.

Methods used to yield bio-methane with coal to increase coalbed methane reserves had researched, thus providing a means for improving gas drainage efficiency. One such method utilized to convert coal into gas involves coal biodegradation technology. In order to confirm the practical application of this technology, the experiments were conducted in wells, Z-159, Z-163, Z-167, and Z-7H, in the Qinshui Basin in China, and the duration of the experiments was 32 months. Cl- ion tracer, number changes of Methanogen sp., and coal bed biome evolution indicated that the culture medium diffused in the Z-159 and Z-7H wells. These wells resumed gas production separately. Gasification of coal lasted 635 and 799 days, and yielded 74817 m3 and 251754 m3 coalbed methane in Z-159 and Z-7H wells, respectively. Results demonstrate that coalbed methane enhancement with biogasification of coal is a potential technical to achieve the productivity improvement of coalbed methane wells.

Organic compounds fermentation of coal has been used to generate secondary biogenic gas and enhance gas reservoirs in coalbed. To enhance the bio-degradation process, culture nutrition plays an important role in remediating the nutritional deficiency of the coal seam. The influence of bio-methane yield with organic inputs and cations concentrations was examined. Research of organic matrix influence revealed that the traditional organic material except yeast extract should forbid, and the input of yeast extract should limit at 1.00g/L also. Further, the study demonstrated that the ion concentration of sodium, potassium, magnesium, calcium and ammonia nitrogen also influenced methane and carbon dioxide yields. And the optimize concentrations for Ca2+, K+, Na+, Mg2+ were 5.1, 1.7, 23 and 1.3 mmol/L. The Mg2+ was particularly sensitive in inhibiting CH4 metabolism processes largely for gas-coal methanogenic consortium.

Abstract Cerasus is a subgenus of Prunus in the family Rosaceae that is popular owing to its ornamental, edible, and medicinal properties. Understanding the evolution of the Cerasus subgenus and identifying selective trait loci in edible cherries are crucial for the improvement of cherry cultivars to meet producer and consumer demands. In this study, we performed a de novo assembly of a chromosome-scale genome for the sweet cherry ( Prunus avium L . ) cultivar ‘Burlat’, covering 297.55 Mb and consisting of eight chromosomes with 33,756 protein-coding genes. The resequencing and population structural analysis of 384 Cerasus representative accessions revealed that they could be divided into four groups (Group 1, Group 2, Group 3, and Group 4). We inferred that Group 1 was the oldest population and Groups 2, 3, and 4 were clades derived from it. In addition, we found selective sweeps for fruit flavor and improved stress resistance in different varieties of edible cherries ( P. avium , P. cerasus , and P. pseudocerasus ) . Transcriptome analysis revealed significant differential expression of genes associated with key pathways, such as sucrose starch and sucrose metabolism, fructose and mannose metabolism, and the pentose phosphate pathway, between the leaves and fruits of P. avium . This study enhances the understanding of the evolutionary processes of the Cerasus subgenus and provides resources for functional genomics research and the improvement of edible cherries.

Rice bran is an important byproduct of the rice polishing process, rich in nutrients, but it is underutilized and often used as feed or discarded, resulting in a huge amount of waste. In this study, rice bran was fermented by Lactobacillus fermentum MF423 to obtain a product with high antioxidant activity. First, a reliable and efficient method for assessing the antioxidant capacity of the fermentation products was established using high-performance liquid chromatography (HPLC), which ensured the consistency of the batch fermentation. The fermented rice bran product (FLRB) exhibited significant antioxidant activity in cells, C. elegans, and hyperlipidemic mice. Transcriptome analysis of mouse livers showed that the expression of plin5 was upregulated in diabetic mice administered FLRB, thereby preventing the excessive production of free fatty acids (FFAs) and the subsequent generation of large amounts of reactive oxygen species (ROS). These studies lay the foundation for the application of rice bran fermentation products.

ABSTRACT Aluminum (Al) toxicity in acidic soils leads to a considerable reduction in crop yields. MicroRNAs play essential roles in abiotic stress responses, but little is known of their role in the response of peanut ( Arachnis hypogea L.) to Al stress. In this study, a novel Ah‐miR2916 (miR2916)–AhERF13–AhSUC3 module was found to be involved in the Al‐stress response via ethylene‐mediated signaling in peanut. Overexpression of miR2916 in Arabidopsis resulted in reduced Al tolerance by downregulating ethylene biosynthesis, while knockdown miR2916 in peanut enhanced Al tolerance. Notably, the APETALA2/ethylene‐responsive factor (ERF), AhERF13, was identified as a potential target of miR2916 . AhERF13 expression was increased in miR2916 knockdown peanut lines and displayed an opposing pattern to that of miR2916 under Al stress. Consistently, knockdown AhERF13 peanut lines indicated that AhERF13 positively regulates Al tolerance by upregulating ethylene biosynthesis. AhERF13 was shown capable of binding to an ERF motif in the promoter region of sucrose transport protein 3 ( AhSUC3 ) and positively regulate its expression. Consequently, AhSUC3 improved Al tolerance by upregulating ethylene biosynthesis. These results provide further insights into the molecular mechanisms operating during peanut response to Al stress, and suggests targets for manipulation in breeding programs for improved Al tolerance.