XS
Xiue Shi
Author with expertise in Ethical Considerations in Medical Research Participation
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
15
/
i10-index:
18
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The methodological quality of animal studies: A cross-sectional study based on the SYRCLE’s risk of bias tool

Weiyi Zhang et al.Jul 12, 2019
Objective: To assess the methodological quality of animal studies published in China and abroad using the SYRCLE’s risk of bias tool, and to provide references to improve the methodological quality of animal studies to encourage high quality preclinical studies. Methods: An electronic search was performed in the Chinese Scientific Citation Database (CSCD) and Web of Science from 2014 to October 2018. Document screening and data extraction were performed independently by four researchers. The methodological quality of the included studies was assessed using the SYRCLE’s risk of bias tool. Statistical analysis was performed using SPSS23. Results: A total of 2764 animal studies were included. Of the studies, 984 were published in English and 1780 were in Chinese. The citation frequency of more than 90% of the included studies was less than 5. The results of methodological quality assessment showed that 36.36% (8/22) of the sub-items were rated as "low risk" in more than 50% of the included studies, of which 75% (6/8) were rated as "low risk" in more than 80% of the included studies. A total of 59.09% (13/22) of the sub-items were rated as "low risk" in less than 30% of the included studies, of which 92.31% (12/13) were rated as "low risk" in less than 10% of the included studies. The incidence of "low risk" Chinese studies regarding performance bias, detection bias and reporting bias were lower than English studies. For foreign studies, more attention should be paid to selection bias, attrition bias, and reporting bias. Conclusion: We identified limitations in the methodological quality of animal experiment studies published in China and abroad. We therefore suggest that it is necessary to take targeted measures to popularize the SYRCLE’s risk of bias tool to effectively improve the design and implementation of animal experiments, and guide study development.
0
0
Save
0

Gut microbiota-mediated hsa_circ_0126925 targets BCAA metabolic enzyme BCAT2 to exacerbate colorectal cancer progression

Huihui Yao et al.Dec 6, 2024
Abstract Recent evidence indicates that a high-fat diet (HFD) can promote tumor development, especially colorectal cancer (CRC), by influencing the microbiota. Regulatory circular RNAs (circRNAs) play an important role in modulating host–microbe interactions; however, the specific mechanisms by which circRNAs influence cancer progression by regulating these interactions remain unclear. Here, we report that consumption of a HFD modulates the microbiota by specifically upregulating the expression of the noncoding RNA hsa_circ_0126925 (herein referred to as circ_0126925) in CRC. Acting as a scaffold, circ_0126925 hinders the recruitment of the E3 ubiquitin ligase tripartite motif-containing protein 21 (TRIM21) to branched-chain amino acid transaminase 2 (BCAT2), leading to reduced degradation of BCAT2. This reduction in targeted degradation of BCAT2 can protect tumours from limited branched-chain amino acids (BCAAs) interference by improving the metabolism of BCAAs in CRC. Taken together, these data demonstrate that circ_0126925 plays a critical role in promoting the progression of CRC by maintaining BCAA metabolism and provide insight into the functions and crosstalk of circ_0126925 in host–microbe interactions in CRC. Implications: This study preliminarily confirms that circRNAs do indeed respond to microbiota/microbial metabolites, providing further evidence for the potential development of circRNAs as diagnostic tools and/or therapeutic agents to alleviate microbiome related pathology in humans.