Tumor metastasis represents a stepwise progression and stands as a principal determinant of unfavorable prognoses among cancer patients. Consequently, an in-depth exploration of its mechanisms holds paramount clinical significance. Cancer-associated fibroblasts (CAFs), constituting the most abundant stromal cell population within the tumor microenvironment (TME), have garnered robust evidence support for their pivotal regulatory roles in tumor metastasis.

ABSTRACT Molecular mechanisms of virus-related diseases involve multiple factors, including viral mutation accumulation and integration of a viral genome into the host DNA. With increasing attention being paid to virus-mediated pathogenesis and the development of many useful technologies to identify virus mutations (VMs) and viral integration sites (VISs), abundant literatures on these topics are available in PubMed. However, knowledge of VMs and VISs is widely scattered in numerous published papers, and the association of VMs with VISs in the viral genome or the functional annotation of VISs still lacks integration and curation. To address these challenges, we built a database of human disease-related Vi rus M utations, I ntegration sites and C is-effects (ViMIC), which specialize in three features: virus mutation sites, viral integration sites and target genes. In total, the ViMIC provides information on 6,461 VMs, 79,089 VISs, and 15,056 viral target genes of 8 viruses in 65 human diseases obtained from literatures. Furthermore, in ViMIC, users are allowed to explore the cis-effects of virus-host interactions by surveying 78 histone modifications, binding of 1,358 transcription regulators, and chromatin accessibility on these VISs. We believe ViMIC will become a valuable resource for the virus research community. The database is available at http://bmtongji.cn/ViMIC/index.php .

Background Forest musk deer (FMD, Moschus Berezovskii ) is a critically endangered species world-widely, the death of which can be caused by pulmonary disease in the farm. Pulmonary fibrosis (PF) was a huge threat to the health and survival of captive FMD. MicroRNAs (miRNAs) and messenger RNAs (mRNAs) have been involved in the regulation of immune genes and disease development. However, the regulatory profiles of mRNAs and miRNAs involved in immune regulation of FMD are unclear. Methods In this study, mRNA-seq and miRNA-seq in blood were performed to constructed coexpression regulatory networks between PF and healthy groups of FMD. The hub immune- and apoptosis-related genes in the PF blood of FMD were explored through Gene Ontology (GO) and the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analysis. Further, protein–protein interaction (PPI) network of immune-associated and apoptosis-associated key signaling pathways were constructed based on mRNA-miRNA in the PF blood of the FMD. Immune hub DEGs and immune hub DEmiRNAs were selected for experimental verification using RT-qPCR. Results A total of 2744 differentially expressed genes (DEGs) and 356 differentially expressed miRNAs (DEmiRNAs) were identified in the PF blood group compared to the healthy blood group. Among them, 42 DEmiRNAs were negatively correlated with 20 immune DEGs from a total of 57 correlations. The DEGs were significantly associated with pathways related to CD molecules, immune disease, immune system, cytokine receptors, T cell receptor signaling pathway, Th1 and Th2 cell differentiation, cytokine-cytokine receptor interaction, intestinal immune network for IgA production, and NOD-like receptor signaling pathway. There were 240 immune-related DEGs, in which 186 immune-related DEGs were up-regulated and 54 immune-related DEGs were down-regulated. In the protein-protein interaction (PPI) analysis of immune-related signaling pathway, TYK2 , TLR2 , TLR4 , IL18 , CSF1 , CXCL13 , LCK , ITGB2 , PIK3CB , HCK , CD40 , CD86 , CCL3 , CCR7 , IL2RA , TLR3 , and IL4R were identified as the hub immune genes. The mRNA-miRNA coregulation analysis showed that let-7d, miR-324-3p, miR-760, miR-185, miR-149, miR-149-5p, and miR-1842-5p are key miRNAs that target DEGs involved in immune disease, immune system and immunoregulation. Conclusion The development and occurrence of PF were significantly influenced by the immune-related and apoptosis-related genes present in PF blood. mRNAs and miRNAs associated with the development and occurrence of PF in the FMD.

It has been well documented that the endoplasmic reticulum (ER) responds to cellular stresses through the unfolded protein response (UPR), but it is unknown how the Golgi responds to similar stresses. In this study, we treated HeLa cells with ER stress inducers, thapsigargin (TG), tunicamycin (Tu) and Dithiothreitol (DTT), and found that only TG treatment caused Golgi fragmentation. TG induced Golgi fragmentation at a low dose and short time when UPR was undetectable, demonstrating that Golgi fragmentation occurs independently of ER stress. Further experiments demonstrated that TG induces Golgi fragmentation through elevated intracellular Ca2+ and protein kinase Cα (PKCα) activity, which phosphorylates the Golgi stacking protein GRASP55. Significantly, activation of PKCα with other activating or inflammatory agents, including Phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) and histamine, modulates the Golgi structure in a similar fashion. Hence, our study revealed a novel mechanism through which increased cytosolic Ca2+ modulates Golgi structure and function.

This study aimed to investigate the alterations in sleep quality and sleep patterns among military personnel at altitudes ranging from 1500 to 4500 m, as well as the associated factors influencing their sleep. This study employed a longitudinal prospective survey conducted over a period of six months, from November 2023 to June 2024. A total of 90 soldiers were recruited for participation. Initially, demographic data and sleep conditions were collected through a questionnaire administered to participants at an altitude of 1,500 m. Subsequently, participants were monitored continuously to gather data over seven days at an altitude of 4,500 m, specifically during the 7 days of the 6-month survey period), and the 1st month at an altitude of 4,500 m (on the 1st month of the six-month survey period. Spearman's rank correlation was utilized to investigate the relationships among sleep quality, gastrointestinal symptoms, and mood states. The total score of the Pittsburgh Sleep Quality Index (PSQI) exhibited an increase, indicating impaired sleep quality among soldiers stationed at an altitude of 4,500 m for durations 7 days, 1 month, 3 months, and 6 months. Notably, after 7 days of soldiers, there was a significant gradual in the number of military soldiers experiencing gastrointestinal symptoms, such as diarrhea, abdominal distention, and constipation, which subsequently stabilized with prolonged exposure to the altitude. Furthermore, a significant rise in the incidence of depression was observed after days of rapid exposure 4,500 above sea level, and the emotional state of military personnel tended to tend towards mild depression over the duration of time Correlation. Correlation analysis showed that the PSQI score was closely related to the Athens Insomnia Scale(AIS) total score, Epworth Sleepiness Scale(ESS) total score, Self-Rating Anxiety Scale(SAS) total score, Self-Rating Depression Scale(SDS) total score, difficulty in falling asleep, easy to wake up or wake up early at night, poor breathing and snoring (on the 1st month, the 3rd month and the 6th month at the altitude of 4500 m respectively: rs = 0.868, 0.648, 0.483, 0.459, 0.472, 0.364, 0.613, 0.75; rs = 0.856, 0.521, 0.481, 0.354, 0.768, 0.720, 0.511, 0.535; rs = 0.756, 0.490, 0.496, 0.352, 0.708, 0.737, 0.424, 0.408, p < 0.01 or p < 0.05); Positively correlated with heart rate (at 4500 m 7 days at altitude: rs = 0.233, p = 0.027), diarrhea (at 4500 m 1-month at altitude: rs = 0.237) bloating and constipation (at 4500 m 1 month and 3months respectively: rs = 0.472; rs = 0.364; rs = 0.341, 0.273, p < 0.05); and with age, sex, marital status, education were significantly positive correlation (rs = 0.463, 0.251, 0.255, 0.230, p < 0.05). The impaired sleep quality, gastrointestinal symptoms, and anxiety and depression in military personnel changed with the extension of the time of stationing at 4500 m altitude, which was most prominent when stationed at high altitude for 7 days; the sleep quality of those stationed at high altitude had a close relationship with the gastrointestinal symptoms, the type of sleep(insomnia and drowsiness), and the heart rate, but it varied with the duration of the stationing at high altitude; our study provides new information for the prevention of sleep disturbance, gastrointestinal symptoms, and negative emotions in high-altitude military personnel.