As there is growing evidence for the tumor microenvironment's (TME) role in tumorigenesis, we sought to investigate the role of fibroblast-expressed kinases in triple negative breast cancer (TNBC). Using a high-throughput kinome screen combined with 3D invasion assays, we identified fibroblast-expressed PIK3Cd) as a key regulator of rogression. Although PIK3Cd has been mainly described in leucocytes, we detected high expression in primary fibroblasts derived from TNBC patients, while PIK3Cδ was undetectable in cancer epithelial cell lines. Genetic and pharmacologic gain- and loss-of functions experiments verified the contribution of f-PIK3Cd in TNBC cell invasion. By employing an integrated secretomics and transcriptomics analysis, we revealed a paracrine mechanism via which f-PIK3Cd; confers its pro-tumorigenic effects. Inhibition of f-PIK3Cd promoted the secretion of factors, including PLGF and BDNF, which subsequently led to upregulation of NR4A1 in TNBC cells where it acts as a tumor suppressor. Inhibition of PIK3Cd in an orthotopic BC mouse model reduced tumor growth only after inoculation with fibroblasts, indicating a role of f-PIK3Cd in cancer progression. Similar results were observed in the MMTV-PyMT transgenic BC mouse model, in addition to a decrease on tumor metastasis emphasizing the potential immune-independent effects of PIK3Cd inhibition. Finally, analysis of BC patient cohorts and TCGA datasets identified f-PIK3Cd (protein and mRNA levels) as an independent prognostic factor for overall and disease free survival, highlighting it as a therapeutic target for TNBC.

Androgen receptor (AR), is a transcription factor and a member of a hormone receptor superfamily. AR plays a vital role in the progression of prostate cancer and is a crucial target for therapeutic interventions. While the majority of advanced-stage prostate cancer patients will initially respond to the androgen-deprivation, the disease often progresses to castrate-resistant prostate cancer (CRPC). Interestingly, CRPC tumors continue to depend on hyperactive AR signaling and will respond to potent second-line anti-androgen therapies, including bicalutamide (CASODEX®) and enzalutamide (XTANDI®). However, the progression-free survival rate for the CRPC patients on anti-androgen therapies is only 8 to 19 months. Hence, there is a need to understand the mechanisms underlying CRPC progression and eventual treatment resistance. Here, we have leveraged next-generation sequencing and newly developed analytical methodologies to evaluate the role of AR-signaling in regulating the transcriptome of prostate cancer cells. The genomic and pharmacologic stimulation- and inhibition-of AR activity demonstrates that AR regulates alternative splicing within cancer-relevant genes. Furthermore, by integrating transcriptomic data from in vitro experiments and in prostate cancer patients, we found that a significant number of AR-regulated splicing events are associated with tumor progression. For example, we found evidence for an inadvertent AR-antagonist mediated switch in IDH1 and PL2G2A isoform expression, which is associated with a decrease in overall survival of patients. Mechanistically, we discovered that the epithelial-specific splicing regulators (ESRP1 and ESRP2), flank many AR-regulated alternatively spliced exons. And, using 2D-invasion assays, we show that the inhibition of ESRPs can suppress AR-antagonist driven tumor invasion. In conclusion, until now, AR signaling has been primarily thought to modulate transcriptome of prostate epithelial cells by inducing or suppressing gene expression. Our work provides evidence for a new mechanism by which AR alters the transcriptome of prostate cancer cells by modulating alternative splicing. As such, our work has important implications for CRPC progression and development of resistance to treatment with bicalutamide and enzalutamide.