Circular RNAs are a recently (re-)discovered abundant RNA species with presumed function as miRNA sponges, thus part of the competing endogenous RNA network. We analysed the expression of circular and linear RNAs and proliferation in matched normal colon mucosa and tumour tissues. We predicted >1,800 circular RNAs and proved the existence of five randomly chosen examples using RT-qPCR. Interestingly, the ratio of circular to linear RNA isoforms was always lower in tumour compared to normal colon samples and even lower in colorectal cancer cell lines. Furthermore, this ratio correlated negatively with the proliferation index. The correlation of global circular RNA abundance (the circRNA index) and proliferation was validated in a non-cancerous proliferative disease, idiopathic pulmonary fibrosis, ovarian cancer cells compared to cultured normal ovarian epithelial cells and 13 normal human tissues. We are the first to report a global reduction of circular RNA abundance in colorectal cancer cell lines and cancer compared to normal tissues and discovered a negative correlation of global circular RNA abundance and proliferation. This negative correlation seems to be a general principle in human tissues as validated with three different settings. Finally, we present a simple model how circular RNAs could accumulate in non-proliferating cells.

It is still a question of debate whether neutrophils, often found in the tumor microenvironment, mediate tumor-promoting or rather tumor-inhibiting activities. The present study focusses on the involvement of neutrophils in high grade serous ovarian cancer (HGSOC). Multi-omics data comprising proteomics, eicosadomics, metabolomics, Luminex-based cytokinomics, and FACS data were generated from ascites samples. Integrated data analysis demonstrates a significant increase of neutrophil extracellular trap- (NET) associated molecules in non-miliary ascites samples. A co-association network analysis performed with the ascites data further revealed a striking co-correlation between NETosis-associated metabolites with several eicosanoids. Investigating primary neutrophils from healthy domors, NET formation was induced using ionomycin or phorbol ester. Data congruence with ascites analyses indicated the predominance of NOX-independent NETosis. NETosis is associated with S100A8/A9 release. An increase of the S100A8/CRP abundance ratio was found to correlate with improved survival of HGSOC patients. The analysis of additional five independent proteome studies with regard to S100A8/CRP ratios confirmed this observation. In conclusion, here we present evidence that increased NET formation relates to improved outcomes in cancer patients.

Combined [