A cDNA encoding a multispecific organic anion transporter 3 (hOAT3) was isolated from a human kidney cDNA library. The hOAT3 cDNA consisted of 2179 base pairs that encoded a 543-amino-acid residue protein with 12 putative transmembrane domains. The deduced amino acid sequence of hOAT3 showed 36 to 51% identity to those of other members of the OAT family. Northern blot analysis revealed that hOAT3 mRNA is expressed in the kidney, brain, and skeletal muscle. When expressed inXenopus laevis oocytes, hOAT3 mediated the transport of estrone sulfate (K_m = 3.1 μM),p-aminohippurate (K_m = 87.2 μM), methotrexate (K_m = 10.9 μM), and cimetidine (K_m = 57.4 μM) in a sodium-independent manner. hOAT3 also mediated the transport of dehydroepiandrosterone sulfate, ochratoxin A, PGE₂, estradiol glucuronide, taurocholate, glutarate, cAMP and uric acid. Estrone sulfate did not show any trans-stimulatory effects on either influx or efflux of [³H]estrone sulfate via hOAT3. hOAT3 interacted with chemically heterogeneous anionic compounds, such as nonsteroidal anti-inflammatory drugs, diuretics, sulfobromophthalein, penicillin G, bile salts and tetraethyl ammonium bromide. The hOAT3 protein was shown to be localized in the basolateral membrane of renal proximal tubules and the hOAT3 gene was determined to be located on the human chromosome 11q12-q13.3 by fluorescent in situ hybridization analysis. These results suggest an important role of hOAT3 in the excretion/detoxification of endogenous and exogenous organic anions in the kidney.

Background:Stent underexpansion remains a concern as a cause of drug-eluting stent (DES) failure. Although coronary calcification is considered to be a contributing factor in stent underexpansion, previous intravascular ultrasound studies have failed to demonstrate this relationship. We investigated whether stent expansion could be predicted by coronary calcification as assessed by optical coherence tomography (OCT).Methods and Results:We enrolled 51 de novo native coronary artery lesions treated by a single 2nd-generation DES (3 types). Prior to stent deployment, the arc and area of calcium at the target lesion were measured using OCT. After successful stent implantation, OCT imaging was repeated to assess minimal stent diameter and area (MSD and MSA). Stent expansion was defined as MSD (or MSA) divided by the values predicted by the manufacturers’ compliance charts. Patients were divided into 4 groups according to the median values of the arc and area of calcium. Mean stent expansion was 73.3±8.7% for MSD and 65.2±12.0% for MSA. Stent expansion defined by MSD was significantly different among the 4 groups (P=0.02). A similar trend was observed for stent expansion defined by MSA (P=0.16).Conclusions:The extent of target lesion calcification as assessed by OCT may be an important determinant of the expansion of 2nd-generation DES. (Circ J 2014; 78: 2209–2214)

Exercise testing is routinely used in clinical practice to assess fitness - a strong predictor of survival - as well as causes of exercise limitations. While these studies often focus on cardiopulmonary response and selected molecular pathways, the dynamic system-wide molecular response to exercise has not been fully characterized. We performed a longitudinal multi-omic profiling of plasma and peripheral blood mononuclear cells including transcriptome, immunome, proteome, metabolome and lipidome in 36 well-characterized volunteers before and after a controlled bout of acute exercise (2, 15, 30 min and 1 hour in recovery). Integrative analysis revealed an orchestrated choreography of biological processes across key tissues. Most of these processes were dampened in insulin resistant participants. Finally, we discovered biological pathways involved in exercise capacity and developed prediction models revealing potential resting blood-based biomarkers of fitness.

11550 Background: Improvements in surgical techniques and the introduction of perioperative chemotherapy have led to the improved 5-year survival rate of 91% for bone and tissue sarcoma in Japan (JCOG1306 trial). However, for invasive soft tissue sarcomas, the local control rate remains approximately 80% with a high recurrence rate. Undifferentiated pleomorphic sarcoma (UPS) and myxofibrosarcoma (MFS) frequently exhibit strong local invasiveness, yet the mechanisms underlying their invasiveness remain unclear. Thus, in this study, we aimed to explore the tumor microenvironment and genetic profiles associated with the invasiveness of UPS and MFS by using bulk RNA-sequencing data. Methods: We focused on 47 cases with UPS or MFS, whose RNA-sequencing data were obtained from surgical specimens at the Cancer Institute Hospital of JFCR between April 2017 and April 2023. The entire cohort was divided into two groups based on preoperative MRIs. Tumors showing a tail-like sign or irregular margins were categorized as invasive (Group I: 32 cases, average age 71±13 years, UPS 22 cases, MFS 10 cases), while tumors with clearly defined margins were categorized as non-invasive (Group NI: 15 cases, average age 68±13 years, UPS 10 cases, MFS 5 cases). We calculated immune cell fractions using CIBERSORTx and analyzed the differentially expressed genes (DEGs) and altered pathways using iDEP estimated from RNA-sequencing data. The results were analyzed for correlation with clinical outcomes. Results: The 5-year overall survival rate was significantly lower in Group I (74%) than in Group NI (100%, p=0.04), while the 5-year recurrence-free survival rate did not differ significantly between the groups (p=0.4). Group I showed significantly lower naive B cell count (p=0.04), and cases with higher naive B cell count had a significantly higher 5-year overall survival rate than those with lower count (93% vs. 69%, p=0.04). A total of 1260 DEGs were identified between Group I and NI, including 241 immune-related genes, and 11 genes were associated with overall survival. Multivariate analysis of these 11 immune-related genes and overall survival revealed the significant association of one gene, “Gene X” (p=0.01). In Group I, pathways related to fat metabolism were downregulated, while those related to sugar metabolism and rheumatoid arthritis were upregulated. Conclusions: This study revealed that soft tissue sarcoma invasiveness is correlated with overall survival. Specific tumor-infiltrating immune cells and immune-related genes may be regulated by the associated metabolic pathways. The pathways including “Gene X”, which reported with its antibodies, may contribute to the regulation of invasiveness of invasive soft tissue sarcoma and the improvement in survival rate. Thus, “Gene X” may be considered a potential novel therapeutic target for invasive soft tissue sarcoma.

Abstract Background Gastric cancer is a major oncological challenge, ranking highly among causes of cancer-related mortality worldwide. This study was initiated to address the variability in patient responses to combination chemotherapy, highlighting the need for personalized treatment strategies based on genomic data. Methods We analyzed whole-genome and RNA sequences from biopsy specimens of 65 advanced gastric cancer patients before their chemotherapy treatment. Using machine learning techniques, we developed a model with 123 omics features, such as immune signatures and copy number variations, to predict their chemotherapy outcomes. Results The model demonstrated a prediction accuracy of 70–80% in forecasting chemotherapy responses in both test and validation cohorts. Notably, tumor-associated neutrophils emerged as significant predictors of treatment efficacy. Further single-cell analyses from cancer tissues revealed different neutrophil subgroups with potential antitumor activities suggesting their usefulness as biomarkers for treatment decisions. Conclusions This study confirms the utility of machine learning in advancing personalized medicine for gastric cancer by identifying tumor-associated neutrophils and their subgroups as key indicators of chemotherapy response. These findings could lead to more tailored and effective treatment plans for patients.