GT
Gregory Tranah
Author with expertise in Epigenetic Modifications and Their Functional Implications
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
4
h-index:
10
/
i10-index:
10
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Expression of mitochondrial oxidative stress response genes in muscle is associated with mitochondrial respiration, physical performance, and muscle mass in the Study of Muscle, Mobility, and Aging

Gregory Tranah et al.Jun 1, 2024
+11
P
H
G
Abstract Gene expression in skeletal muscle of older individuals may reflect compensatory adaptations in response to oxidative damage that preserve tissue integrity and maintain function. Identifying associations between oxidative stress response gene expression patterns and mitochondrial function, physical performance, and muscle mass in older individuals would further our knowledge of mechanisms related to managing molecular damage that may be targeted to preserve physical resilience. To characterize expression patterns of genes responsible for the oxidative stress response, RNA was extracted and sequenced from skeletal muscle biopsies collected from 575 participants (≥70 years old) from the Study of Muscle, Mobility, and Aging. Expression levels of 21 protein‐coding RNAs related to the oxidative stress response were analyzed in relation to six phenotypic measures, including maximal mitochondrial respiration from muscle biopsies (Max OXPHOS), physical performance (VO 2 peak, 400‐m walking speed, and leg strength), and muscle size (thigh muscle volume and whole‐body D3Cr muscle mass). The mRNA level of the oxidative stress response genes most consistently associated across outcomes are preferentially expressed within the mitochondria. Higher expression of mRNAs that encode generally mitochondria located proteins SOD2 , TRX2 , PRX3 , PRX5 , and GRX2 were associated with higher levels of mitochondrial respiration and VO 2 peak. In addition, greater SOD2, PRX3, and GRX2 expression was associated with higher physical performance and muscle size. Identifying specific mechanisms associated with high functioning across multiple performance and physical domains may lead to targeted antioxidant interventions with greater impacts on mobility and independence.
0
Citation4
0
Save
0

Whole-Genome Association Analyses of Sleep-disordered Breathing Phenotypes in the NHLBI TOPMed Program

Brian Cade et al.Jun 3, 2019
+36
M
H
B
Abstract Sleep-disordered breathing (SDB) is a common disorder associated with significant morbidity. Through the NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) program we report the first whole-genome sequence analysis of SDB. We identified 4 rare gene-based associations with SDB traits in 7,988 individuals of diverse ancestry and 4 replicated common variant associations with inclusion of additional samples (n=13,257). We identified a multi-ethnic set-based rare-variant association (p = 3.48 × 10 −8 ) on chromosome X with ARMCX3 . Transcription factor binding site enrichment identified associations with genes implicated with respiratory and craniofacial traits. Results highlighted associations in genes that modulate lung development, inflammation, respiratory rhythmogenesis and HIF1A -mediated hypoxic response.