Background Since 2014, the United States has experienced a biennial spike in pediatric acute flaccid myelitis (AFM). Epidemiologic evidence suggests non-polio enteroviruses (EVs) are a potential etiology, yet EV RNA is rarely detected in cerebrospinal fluid (CSF) and only inconsistently identified from the respiratory tract, serum, or stool.Methods We interrogated CSF from children with AFM (n=42) and pediatric controls with other neurologic diseases (OND) (n=58). Samples were incubated with T7 bacteriophage expressing 481,966 sixty-two amino acid peptides with a fourteen amino acid overlap tiled across all known vertebrate virus and arbovirus genomes, an adaption of the VirScan method. Antibody-bound phage were deep sequenced to quantify enriched peptides with normalized counts expressed as reads per hundred thousand (rpK). EV antibody findings were confirmed with ELISA using whole viral protein 1 (VP1) from contemporary enterovirus (EV) A71 and D68 strains. Separately, metagenomic next-generation sequencing (mNGS) of CSF RNA, both unbiased and with targeted enrichment for EVs, was performed.Results The most significantly enriched viral family by VirScan of CSF in AFM versus OND controls was Picornaviridae (mean rpK 11,266 versus mean rpK 950, p-adjusted < 0.001, Wilcoxon signed-rank test with Bonferroni adjustment). Enriched Picornaviridae peptides belonged almost entirely to the genus Enterovirus. The mean EV VP1 ELISA signal in AFM (mean OD 0.51) was significantly higher than OND controls (mean OD 0.08, p-value < 0.001, Mann-Whitney test). mNGS did not detect additional enterovirus RNA in CSF.Conclusion Despite the rare detection of EV RNA in the CNS of patients with AFM, a pan-viral serologic assay identified high levels of CSF EV antibodies in AFM CSF compared to CSF from OND controls. These results provide further evidence for a causal role of non-polio enteroviruses in AFM.

Abstract Mitochondrial DNA (mtDNA) has been suggested to drive immune system activation, but the induction of interferon signaling by mtDNA has not been demonstrated in a Mendelian mitochondrial disease. We initially ascertained two patients, one with a purely neurological phenotype, and one with features suggestive of systemic sclerosis in a syndromic context, and found them both to demonstrate enhanced interferon-stimulated gene (ISG) expression in blood. We determined each to harbor a previously described de novo dominant-negative heterozygous mutation in ATAD3A , encoding ATPase family AAA domain-containing protein 3A (ATAD3A). We identified five further patients with mutations in ATAD3A , and recorded up-regulated ISG expression and interferon alpha protein in four of them. Knockdown of ATAD3A in THP-1 cells resulted in increased interferon signaling, mediated by cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) and stimulator of interferon genes (STING). Enhanced interferon signaling was abrogated in THP-1 cells and patient fibroblasts depleted of mtDNA. Thus, mutations in the mitochondrial membrane protein ATAD3A define a novel type I interferonopathy. Summary Dominant-negative mutations in ATAD3A, a ubiquitously expressed mitochondrial protein, cause mitochondrial DNA-dependent up-regulation of type I interferon signaling in the context of neurological disease and autoimmunity, thereby defining a novel type I interferonopathy.

Background: LC-FAOD may be missed in neuromuscular (NM) clinics due to its rarity and absence from common NM genetic panels. The Canadian Neuromuscular Disease Registry (CNDR) collects real-world patient data and includes a network of clinician-investigators. Our objective was to inform future registry work by evaluating diagnosis pathways for LC-FAOD patients and estimating the number followed at Canadian NM clinics. Methods: A questionnaire was developed with an expert committee and circulated to 111 CNDR-affiliated NM neurologists. Results: 12 neurologists in 5 provinces, primarily adult-treating (n=8) completed the survey (10.8% response rate). Eleven (91.7%) practiced for >10 years. Agreement trends existed between definition of, and tests to evaluate, rhabdomyolysis. Four clinics routinely follow LC-FAOD patients. In the last 1-2 years, respondents diagnosed approximately 91 patients with LC-FAOD (mean=7.5 per clinic). 83.3% never received continuing education on LC-FAOD, though 75% indicated interest in expert-led webinars. Further data will be presented. Conclusions: Low sample size limits conclusions about LC-FAOD clinical trends. Results suggest LC-FAOD may be under-diagnosed or not routinely followed by NM specialists, limiting viability of an LC-FAOD registry. Practitioners may be interested in LC-FAOD-specific education. Future work could include collaboration with metabolic geneticists on education initiatives to raise awareness and improve care for these patients.