Abstract Background Intestinal metaplasia (IM) is classified into complete intestinal metaplasia (CIM) and incomplete intestinal metaplasia (IIM). Patients diagnosed with IIM face an elevated susceptibility to the development of gastric cancer, underscoring the critical need for early screening measures. In addition to the complexities associated with diagnosis, the exact mechanisms driving the progression of gastric cancer in IIM patients remain poorly understood. OLFM4 is overexpressed in several types of tumors, including colorectal, gastric, pancreatic, and ovarian cancers, and its expression has been associated with tumor progression. Methods In this study, we used pathological sections from two clinical centers, biopsies of IM tissues, precancerous lesions of gastric cancer (PLGC) cell models, animal models, and organoids to explore the role of OLFM4 in IIM. Results Our results show that OLFM4 expression is highly increased in IIM, with superior diagnostic accuracy of IIM when compared to CDX2 and MUC2. OLFM4, along with MYH9, was overexpressed in IM organoids and PLGC animal models. Furthermore, OLFM4, in combination with Myosin heavy chain 9 (MYH9), accelerated the ubiquitination of GSK3β and resulted in increased β-catenin levels through the Wnt signaling pathway, promoting the proliferation and invasion abilities of PLGC cells. Conclusions OLFM4 represents a novel biomarker for IIM and could be utilized as an important auxiliary means to delimit the key population for early gastric cancer screening. Finally, our study identifies cell signaling pathways involved in the progression of IM.

Abstract 5-methylcytosine (m 5 C) is an important epitranscriptomic modification involved in mRNA stability and translation efficiency in various biological processes. However, it remains unclear if m 5 C modification contributes to the dynamic regulation of the transcriptome during the developmental cycles of Plasmodium parasites. Here, we characterize the landscape of m 5 C mRNA modifications at single nucleotide resolution in the asexual replication stages and gametocyte sexual stages of rodent ( P. yoelii ) and human ( P. falciparum ) malaria parasites. While different representations of m 5 C-modified mRNAs are associated with the different stages, the abundance of the m 5 C marker is strikingly enhanced in the transcriptomes of gametocytes. Our results show that m 5 C modifications confer stability to the Plasmodium transcripts and that a Plasmodium ortholog of NSUN2 is a major mRNA m 5 C methyltransferase in malaria parasites. Upon knock-out of P. yoelii nsun2 ( pynsun2 ), marked reductions of m 5 C modification were observed in a panel of gametocytogenesis-associated transcripts. These reductions correlated with impaired gametocyte production in rodent and human malaria parasites. Restoration of the nsun2 gene in the knock-out parasites rescued the gametocyte production phenotype as well as m 5 C modification of the gametocytogenesis-associated transcripts. Together with the mRNA m 5 C profiles for two species of Plasmodium , our findings demonstrate a major role for NSUN2-mediated m 5 C modifications in mRNA transcript stability and sexual differentiation in malaria parasites. Significance Modifications of RNA including methylations of cytosine (m 5 C) and adenosine (m 6 A) have important roles in RNA metabolism, cellular responses to stress, and biological processes of differentiation and development. Here, we report on the profiles of m 5 C mRNA modifications in malaria parasites that infect rodents ( Plasmodium yoelii ) and humans ( Plasmodium falciparum ). These parasites have genes that encode homologs of human and plant NSUN2 methyltransferases (m 5 C “writers”). We show that one of these homologs, termed PyNSUN2, stabilizes mRNA transcripts in P. yoelii and mediates m 5 C-associated development of the parasite sexual stages (gametocytes). Further research on m 5 C and other epitranscriptomic modifications may yield new insights into molecular pathways of gametocyte development and mosquito infectivity that can be exploited to interrupt malaria transmission.

Background Detection of gastric cancer (GC) at early stages is an effective strategy for decreasing mortality. This study aimed to construct a prediction nomogram based on a questionnaire to assess the risk of developing GC. Methods Our study comprised a total of 4379 participants (2326 participants from outpatient at Fengqing People’s Hospital were considered for model development and internal validation, and 2053 participants from outpatients at the endoscopy center at the Seventh Affiliated Hospital of Sun Yat-Sen University were considered for independent external validation) and gastric mucosa status was determined by endoscopy and biopsies. The eligible participants in development cohort from Fengqing people’s Hospital were randomly separated into a training cohort (n=1629, 70.0%) and an internal validation cohort (n=697, 30.0%). The relevant features were selected by a least absolute shrinkage and selection operator (LASSO), and the ensuing features were evaluated through multivariable logistic regression analysis. Subsequently, the variables were selected to construct a prediction nomogram. The discriminative ability and predictive accuracy of the nomogram were evaluated by the C-index and calibration plot, respectively. Decision curve analysis (DCA) curves were used for the assessment of clinical benefit of the model. This model was developed to estimate the risk of developing neoplastic lesions according to the “transparent reporting of a multivariable prediction model for individual prognosis or diagnosis” (TRIPOD) statement. Results Six variables, including age, sex, alcohol consumption, cigarette smoking, education level, and Hp infection status, were independent risk factors for the development of neoplastic lesions. Thus, these variables were incorporated into the final nomogram. The AUC of the nomogram were 0.701, 0.657 and 0.699 in the training, internal validation, and external validation cohorts, respectively. The calibration curve showed that the nomogram was in good agreement with the observed outcomes. Compared to treatment of all patients or none, our nomogram showed a notably higher clinical benefit. Conclusion This nomogram proved to be a convenient, cost-effective tool to effectively predict an individual’s risk of developing neoplastic lesions, and it can act as a prescreening tool before gastroscopy.

Sigmoid colon cancer with spinal metastases is rare in distant metastasis. In addition, the prognosis of colon cancer patients with spinal metastases is extremely poor. In order to find effective therapeutic agents, we need to know the biological characteristics of such patients from related models. We collected sigmoid colon cancer tissue from a young female subject who was diagnosed with sigmoid colon cancer with multiple spinal metastases. We successfully established a sigmoid colon cancer organoid using this tissue and investigated drug screening in the patient. HE staining, immunohistochemistry, and DNA sequencing were utilized to compare the biological characteristics between the original tumor and the organoid. Furthermore, we investigated the drug screening of the sigmoid colon cancer organoid in vitro. A colon cancer organoid from sigmoid colon cancer with spinal metastases was successfully established. The organoid culture maintained the morphological features, histological features, and genomic landscape of the corresponding sigmoid colon cancer cells. Moreover, we performed drug screening tests to evaluate the effects of chemotherapeutic drugs and targeted drugs. The sigmoid colon cancer organoid with spinal metastases was a favorable preclinical model to explore the clinicopathologic characteristics of colon cancer patients with spinal metastases.