Abstract Most children have a mild course of acute COVID-19. Only few mainly non-controlled studies with small sample size have evaluated long-term recovery from SARS-CoV-2 infection in children. The aim of this study was to evaluate symptoms and duration of ‘long COVID’ in children. A nationwide cohort study of 37,522 children aged 0–17 years with RT-PCR verified SARS-CoV-2 infection (response rate 44.9%) and a control group of 78,037 children (response rate 21.3%). An electronic questionnaire was sent to all children from March 24th until May 9th, 2021. Symptoms lasting > 4 weeks were common among both SARS-CoV-2 children and controls. However, SARS-CoV-2 children aged 6–17 years reported symptoms more frequently than the control group (percent difference 0.8%). The most reported symptoms among pre-school children were fatigue Risk Difference (RD) 0.05 (CI 0.04–0.06), loss of smell RD 0.01 (CI 0.01–0.01), loss of taste RD 0.01 (CI 0.01–0.02) and muscle weakness RD 0.01 (CI 0.00–0.01). Among school children the most significant symptoms were loss of smell RD 0.12 (CI 0.12–0.13), loss of taste RD 0.10 (CI 0.09–0.10), fatigue RD 0.05 (CI 0.05–0.06), respiratory problems RD 0.03 (CI 0.03–0.04), dizziness RD 0.02 (CI 0.02–0.03), muscle weakness RD 0.02 (CI 0.01–0.02) and chest pain RD 0.01 (CI 0.01–0.01). Children in the control group experienced significantly more concentration difficulties, headache, muscle and joint pain, cough, nausea, diarrhea and fever than SARS-CoV-2 infected. In most children ‘long COVID’ symptoms resolved within 1–5 months. Conclusions : Long COVID in children is rare and mainly of short duration. What is Known: • There are increasing reports on ‘long COVID’ in adults. • Only few studies have evaluated the long-term recovery from COVID-19 in children, and common for all studies is a small sample size (median number of children included 330), and most lack a control group. What is New: • 0.8% of SARS-CoV-2 positive children reported symptoms lasting >4 weeks (‘long COVID’), when compared to a control group. • The most common ‘long COVID’ symptoms were fatigue, loss of smell and loss of taste, dizziness, muscle weakness, chest pain and respiratory problems. • These ‘long COVID’ symptoms cannot be assigned to psychological sequelae of social restrictions. • Symptoms such as concentration difficulties, headache, muscle- and joint pain as well as nausea are not ‘long COVID’ symptoms. • In most cases ‘long COVID’ symptoms resolve within 1-5 months.

Except for a few countries, comprehensive all-cause surveillance for bacteremia is not part of mandatory routine public health surveillance. We argue that time has come to include automated surveillance for bacteremia in the national surveillance systems, and explore diverse approaches and challenges in establishing bacteremia monitoring. Assessed against proposed criteria, surveillance for bacteremia should be given high priority. This is based on severity, burden of illness, health gains obtained by improved treatment and prevention, risk of outbreaks (including health care associated infections), the emergence of antimicrobial drug resistance as well as the changing epidemiology of bacteremia which is seen along with an aging population and advances in medical care. The establishment of comprehensive surveillance for bacteremia was until recently conceived as an insurmountable task. With computerized systems in clinical microbiology, surveillance by real-time data capture has become achievable. This calls for re-addressing the question of including bacteremia among the conditions under mandatory surveillance. Experiences from several countries, including Denmark, show that this is feasible. We propose enhanced international collaboration, legislative action, and funding to address the challenges and opportunities.

An increasing incidence of positive blood cultures has been reported in several countries. This represents an important challenge for public health due to the large number of hospital admissions with high mortality among these patients. This study aims to characterize the epidemiology and mortality associated with positive blood cultures.

To identify diagnostic opportunities, we investigated healthcare-seeking behavior among patients with Lyme neuroborreliosis (LNB) within 28 weeks before diagnosis.

Vast amounts of pathogen genomic, demographic and spatial data are transforming our understanding of SARS-CoV-2 emergence and spread. We examined the drivers of molecular evolution and spread of 291,791 SARS-CoV-2 genomes from Denmark in 2021. With a sequencing rate consistently exceeding 60%, and up to 80% of PCR-positive samples between March and November, the viral genome set is broadly whole-epidemic representative. We identify a consistent rise in viral diversity over time, with notable spikes upon the importation of novel variants (e.g., Delta and Omicron). By linking genomic data with rich individual-level demographic data from national registers, we find that individuals aged < 15 and > 75 years had a lower contribution to molecular change (i.e., branch lengths) compared to other age groups, but similar molecular evolutionary rates, suggesting a lower likelihood of introducing novel variants. Similarly, we find greater molecular change among vaccinated individuals, suggestive of immune evasion. We also observe evidence of transmission in rural areas to follow predictable diffusion processes. Conversely, urban areas are expectedly more complex due to their high mobility, emphasising the role of population structure in driving virus spread. Our analyses highlight the added value of integrating genomic data with detailed demographic and spatial information, particularly in the absence of structured infection surveys.

Background It has been suggested that neuroborreliosis in children can manifest as psychiatric neurodevelopmental disorders or cause long‐term neurodevelopmental sequelae. However, previous studies were limited by size and design. Methods We performed a nationwide, population‐based, matched cohort study in Denmark between 1995 and 2021. We included all Danish residents <16 years old with a positive Borrelia burgdorferi sensu lato intrathecal antibody index test (children with neuroborreliosis). To form a comparison cohort, we randomly extracted individuals from the general population matched on date of birth and sex 10:1 to children with neuroborreliosis. We calculated hazard ratios (HRs) with 95% CIs of contact to departments of psychiatry, diagnosis of attention deficit disorder, diagnosis of learning or intellectual developmental disorders, or receipt of psychostimulants for attention deficit disorder among children with neuroborreliosis compared with comparison cohort members. We did a sensitivity analysis in the form of a case‐control study, where we examined whether these outcomes were more frequent among children with neuroborreliosis than in the comparison cohort before study inclusion to account for differential delay in diagnosis. Results We included 1,132 children with neuroborreliosis and 11,320 comparison cohort members with an observation time of 168,858 person‐years. We found no associations between neuroborreliosis and contact with departments of psychiatry (HR: 1.0, 95% CI 0.9–1.2), diagnosis of attention deficit disorder (HR: 0.9, 95% CI 0.6–1.3), diagnosis of learning or intellectual developmental disorders (HR 0.8, 95% CI 0.5–1.4), or receipt of psychostimulants for attention deficit disorder (HR: 0.8, 95% CI 0.6–1.1). Also, in the sensitivity analyses, these outcomes were not more present among children with neuroborreliosis than in the comparison cohort before study inclusion. Conclusions Our results do not support that neuroborreliosis in children manifests as psychiatric neurodevelopmental disorders or causes long‐term neurodevelopmental sequelae.

ABSTRACT Klebsiella pneumoniae (KP) is a major global health problem as it leads to hospital outbreaks all over the world and is becoming more difficult to treat due to its increasing antimicrobial resistance (AMR). Optimization and development of new treatments of KP requires understanding of its population structure and AMR properties. Therefore, in this study, we collected and sequenced 491 KP strains from four major Danish microbiology departments covering 51% of the Danish population. The isolates were whole genome sequenced (WGS), phenotypically characterized and compared with 2,124 KP strains from 13 different countries (PATRIC strains). We found that while genomic content varies significantly across the Danish strains, they also differ significantly from strains from other countries, due to the lack of certain AMR sequence types (e.g. ST258 and ST307) in Denmark. Genomic and experimental analysis suggest that Danish strains contain fewer virulence mechanisms and are more susceptible to antimicrobials compared to strains from other countries, likely due to the relatively low antibiotic usage in Denmark where 70% of hospital antibiotic usage is penicillins. We also identified potential novel AMR determinants to tigecycline through statistical analysis of genomic and phenotypic data. To conclude, we obtained a more comprehensive understanding of the KP strains in Denmark and provided valuable insights for future experiments and strategies to combat AMR in KP.