AH
Allan Hackshaw
Author with expertise in Genomic Landscape of Cancer and Mutational Signatures
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
24
(75% Open Access)
Cited by:
6,728
h-index:
77
/
i10-index:
182
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

First-Trimester or Second-Trimester Screening, or Both, for Down's Syndrome

Fergal Malone et al.Nov 9, 2005
It is uncertain how best to screen pregnant women for the presence of fetal Down's syndrome: to perform first-trimester screening, to perform second-trimester screening, or to use strategies incorporating measurements in both trimesters.Women with singleton pregnancies underwent first-trimester combined screening (measurement of nuchal translucency, pregnancy-associated plasma protein A [PAPP-A], and the free beta subunit of human chorionic gonadotropin at 10 weeks 3 days through 13 weeks 6 days of gestation) and second-trimester quadruple screening (measurement of alpha-fetoprotein, total human chorionic gonadotropin, unconjugated estriol, and inhibin A at 15 through 18 weeks of gestation). We compared the results of stepwise sequential screening (risk results provided after each test), fully integrated screening (single risk result provided), and serum integrated screening (identical to fully integrated screening, but without nuchal translucency).First-trimester screening was performed in 38,167 patients; 117 had a fetus with Down's syndrome. At a 5 percent false positive rate, the rates of detection of Down's syndrome were as follows: with first-trimester combined screening, 87 percent, 85 percent, and 82 percent for measurements performed at 11, 12, and 13 weeks, respectively; with second-trimester quadruple screening, 81 percent; with stepwise sequential screening, 95 percent; with serum integrated screening, 88 percent; and with fully integrated screening with first-trimester measurements performed at 11 weeks, 96 percent. Paired comparisons found significant differences between the tests, except for the comparison between serum integrated screening and combined screening.First-trimester combined screening at 11 weeks of gestation is better than second-trimester quadruple screening but at 13 weeks has results similar to second-trimester quadruple screening. Both stepwise sequential screening and fully integrated screening have high rates of detection of Down's syndrome, with low false positive rates.
0
Citation1,038
0
Save
0

Integrated Screening for Down's Syndrome Based on Tests Performed during the First and Second Trimesters

Nicholas Wald et al.Aug 12, 1999
Both first-trimester screening and second-trimester screening for Down's syndrome are effective means of selecting women for chorionic-villus sampling or amniocentesis, but there is uncertainty about which screening method should be used in practice. We propose a new screening method in which measurements obtained during both trimesters are integrated to provide a single estimate of a woman's risk of having a pregnancy affected by Down's syndrome.We used data from published studies of various screening methods employed during the first and second trimesters. The first-trimester screening consisted of measurement of serum pregnancy-associated plasma protein A in 77 pregnancies affected by Down's syndrome and 383 unaffected pregnancies and measurements of nuchal translucency obtained by ultrasonography in 326 affected and 95,476 unaffected pregnancies. The second-trimester tests were various combinations of measurements of serum alpha-fetoprotein, unconjugated estriol, human chorionic gonadotropin, and inhibin A in 77 affected and 385 unaffected pregnancies.When we used a risk of 1 in 120 or greater as the cutoff to define a positive result on the integrated screening test, the rate of detection of Down's syndrome was 85 percent, with a false positive rate of 0.9 percent. To achieve the same rate of detection, current screening tests would have higher false positive rates (5 to 22 percent). If the integrated test were to replace the triple test (measurements of serum alpha-fetoprotein, unconjugated estriol, and human chorionic gonadotropin), currently used with a 5 percent false positive rate, for screening during the second trimester, the detection rate would be higher 85 percent vs. 69 percent), with a reduction of four fifths in the number of invasive diagnostic procedures and consequent losses of normal fetuses.The integrated test detects more cases of Down's syndrome with a much lower false positive rate than the best currently available test.
0
Citation495
0
Save
0

Enhanced CAR T cell expansion and prolonged persistence in pediatric patients with ALL treated with a low-affinity CD19 CAR

Sara Ghorashian et al.Sep 1, 2019
Chimeric antigen receptor (CAR)-modified T cells targeting CD19 demonstrate unparalleled responses in relapsed/refractory acute lymphoblastic leukemia (ALL)1-5, but toxicity, including cytokine-release syndrome (CRS) and neurotoxicity, limits broader application. Moreover, 40-60% of patients relapse owing to poor CAR T cell persistence or emergence of CD19- clones. Some factors, including the choice of single-chain spacer6 and extracellular7 and costimulatory domains8, have a profound effect on CAR T cell function and persistence. However, little is known about the impact of CAR binding affinity. There is evidence of a ceiling above which increased immunoreceptor affinity may adversely affect T cell responses9-11. We generated a novel CD19 CAR (CAT) with a lower affinity than FMC63, the high-affinity binder used in many clinical studies1-4. CAT CAR T cells showed increased proliferation and cytotoxicity in vitro and had enhanced proliferative and in vivo antitumor activity compared with FMC63 CAR T cells. In a clinical study (CARPALL, NCT02443831 ), 12/14 patients with relapsed/refractory pediatric B cell acute lymphoblastic leukemia treated with CAT CAR T cells achieved molecular remission. Persistence was demonstrated in 11 of 14 patients at last follow-up, with enhanced CAR T cell expansion compared with published data. Toxicity was low, with no severe CRS. One-year overall and event-free survival were 63% and 46%, respectively.
0
Citation446
0
Save
0

Neuropathology of inflicted head injury in children: I. Patterns of brain damage

J. Geddes et al.Jul 1, 2001
Fifty-three cases of non-accidental head injury in children were subjected to detailed neuropathological study, which included immunocytochemistry for microscopic damage. Clinical details were available for all the cases. There were 37 infants, age at head injury ranging from 20 days to 9 months, and 16 children (range 13 months to 8 years). The most common injuries were skull fractures (36% of cases), acute subdural bleeding (72%) and retinal haemorrhages (71%); the most usual cause of death was raised intracranial pressure secondary to brain swelling (82%). On microscopy, severe hypoxic brain damage was present in 77% of cases. While vascular axonal damage was found in 21 out of 53 cases, diffuse traumatic axonal injury was present in only three. Eleven additional cases, all of them infants, showed evidence of localized axonal injury to the craniocervical junction or the cervical cord. When the data were analysed by median age at head injury, statistically significant patterns of age-related damage emerged. Our study shows that infants of 2–3 months typically present with a history of apnoea or other breathing abnormalities, show axonal damage at the craniocervical junction, and tend also to have a skull fracture, a thin film of subdural haemorrhage, but lack extracranial injury. Children over 1 year are more likely to suffer severe extracranial, particularly abdominal, injuries. They tend to have larger subdural haemorrhages, and where traumatic axonal injury is present, show patterns of hemispheric white matter damage more akin to those reported in adults. Diffuse axonal injury is an uncommon sequel of inflicted head injury in children.
0

A simple prognostic scoring system for patients receiving transarterial embolisation for hepatocellular cancer

Latha Kadalayil et al.Jul 16, 2013
BackgroundThe prognosis for patients with hepatocellular cancer (HCC) undergoing transarterial therapy (TACE/TAE) is variable.MethodsWe carried out Cox regression analysis of prognostic factors using a training dataset of 114 patients treated with TACE/TAE. A simple prognostic score (PS) was developed, validated using an independent dataset of 167 patients and compared with Child–Pugh, CLIP, Okuda, Barcelona Clinic Liver Cancer (BCLC) and MELD.ResultsLow albumin, high bilirubin or α-fetoprotein (AFP) and large tumour size were associated with a two- to threefold increase in the risk of death. Patients were assigned one point if albumin <36 g/dl, bilirubin >17 μmol/l, AFP >400 ng/ml or size of dominant tumour >7 cm. The Hepatoma arterial-embolisation prognostic (HAP) score was calculated by summing these points. Patients were divided into four risk groups based on their HAP scores; HAP A, B, C and D (scores 0, 1, 2 and >2, respectively). The median survival for the groups A, B, C and D was 27.6, 18.5, 9.0 and 3.6 months, respectively. The HAP score validated well with the independent dataset and performed better than other scoring systems in differentiating high- and low-risk groups.ConclusionsThe HAP score predicts outcomes in patients with HCC undergoing TACE/TAE and may help guide treatment selection, allow stratification in clinical trials and facilitate meaningful comparisons across reported series.
0
Citation314
0
Save
0

Stromal features are predictive of disease mortality in oral cancer patients

Daniel Marsh et al.Nov 25, 2010
Abstract Worldwide, approximately 405 000 cases of oral cancer (OSCC) are diagnosed each year, with a rising incidence in many countries. Despite advances in surgery and radiotherapy, which remain the standard treatment options, the mortality rate has remained largely unchanged for decades, with a 5‐year survival rate of around 50%. OSCC is a heterogeneous disease, staged currently using the TNM classification, supplemented with pathological information from the primary tumour and loco‐regional lymph nodes. Although patients with advanced disease show reduced survival, there is no single pathological or molecular feature that identifies aggressive, early‐stage tumours. We retrospectively analysed 282 OSCC patients for disease mortality, related to clinical, pathological, and molecular features based on our previous functional studies [EGFR, αvβ6 integrin, smooth muscle actin (SMA), p53, p16, EP4]. We found that the strongest independent risk factor of early OSCC death was a feature of stroma rather than tumour cells. After adjusting for all factors, high stromal SMA expression, indicating myofibroblast transdifferentiation, produced the highest hazard ratio (3.06, 95% CI 1.65–5.66) and likelihood ratio (3.6; detection rate: false positive rate) of any feature examined, and was strongly associated with mortality, regardless of disease stage. Functional assays showed that OSCC cells can modulate myofibroblast transdifferentiation through αvβ6‐dependent TGF‐β1 activation and that myofibroblasts promote OSCC invasion. Finally, we developed a prognostic model using Cox regression with backward elimination; only SMA expression, metastasis, cohesion, and age were significant. This model was independently validated on a patient subset (detection rate 70%; false positive rate 20%; ROC analysis 77%, p < 0.001). Our study highlights the limited prognostic value of TNM staging and suggests that an SMA‐positive, myofibroblastic stroma is the strongest predictor of OSCC mortality. Whether used independently or as part of a prognostic model, SMA identifies a significant group of patients with aggressive tumours, regardless of disease stage. Copyright © 2011 Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd.
0
Citation308
0
Save
Load More