Exacerbations of asthma are associated with substantial morbidity and mortality and with considerable use of health care resources. Preventing exacerbations remains an important goal of therapy. There is evidence that eosinophilic inflammation of the airway is associated with the risk of exacerbations.

Some patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) respond to corticosteroid therapy. Whether these patients have different airway pathology from other COPD patients is unclear. We tested the hypothesis that response to prednisolone is related to the presence of eosinophilic airway inflammation.We did a randomised, double-blind, crossover trial. Patients who had COPD treated with bronchodilators only were assigned placebo and 30 mg prednisolone daily for 2 weeks each, in a random order, separated by a 4-week washout period. Before and after each treatment period, we assessed patients with spirometry, symptom scores, the chronic respiratory disease questionnaire (CRQ), incremental shuttle walk test, and induced sputum. Analysis was done by intention to treat.83 patients were recruited, of whom 67 were randomised. The geometric mean sputum eosinophil count fell significantly after prednisolone (from 2.4% to 0.4%; mean difference six-fold [95% CI 3.1-11.4]) but not after placebo. Other sputum cell counts did not change. After stratification into tertiles by baseline eosinophil count, postbronchodilator forced expiratory volume in 1 s (FEV1) and total scores on the CRQ improved progressively after prednisolone from the lowest to the highest eosinophilic tertile, compared with placebo. The mean change in postbronchodilator FEV1, total CRQ score, and shuttle walk distance with prednisolone compared with placebo in the highest tertile was 0.19 L (0.06-0.32), 0.62 (0.31-0.93), and 20 m (5-35), respectively.Our findings suggest that eosinophilic airway inflammation contributes to airflow obstruction and symptoms in some patients with COPD and that the short-term effects of prednisolone are due to modification of this feature of the inflammatory response. The possibility that sputum eosinophilia identifies a subgroup of patients who particularly respond to long-term treatment with inhaled corticosteroids should be investigated.

With the use of a mouse model expressing human Fc-gamma receptors (FcγRs), we demonstrated that antibodies with isotypes equivalent to ipilimumab and tremelimumab mediate intra-tumoral regulatory T (Treg) cell depletion in vivo, increasing the CD8+ to Treg cell ratio and promoting tumor rejection. Antibodies with improved FcγR binding profiles drove superior anti-tumor responses and survival. In patients with advanced melanoma, response to ipilimumab was associated with the CD16a-V158F high affinity polymorphism. Such activity only appeared relevant in the context of inflamed tumors, explaining the modest response rates observed in the clinical setting. Our data suggest that the activity of anti-CTLA-4 in inflamed tumors may be improved through enhancement of FcγR binding, whereas poorly infiltrated tumors will likely require combination approaches.

Evidence suggests that eosinophilic airway inflammation is important in the pathogenesis of severe chronic obstructive pulmonary disease (COPD) exacerbations. The present authors tested the hypothesis that a management strategy that aims to reduce sputum eosinophil counts is associated with a reduction in exacerbations of COPD. A total of 82 patients with COPD were randomised into two groups. One group was treated according to traditional guidelines (British Thoracic Society (BTS) group) and the other (sputum group) was treated with the additional aim of minimising eosinophilic airway inflammation, assessed using the induced sputum eosinophil count. The primary outcome was exacerbations, which were categorised as mild, moderate or severe. The frequency of severe exacerbations per patient per year was 0.5 and 0.2 in the BTS and sputum groups, respectively (mean reduction 62%). The majority of this benefit was confined to patients with eosinophilic airway inflammation. There was no difference in the frequency of mild and moderate exacerbations. The average daily dose of inhaled or oral corticosteroids during the trial did not differ between the groups. Out of 42 patients in the sputum group, 17 required regular oral corticosteroids to minimise eosinophilic airway inflammation. A management strategy that aims to minimise eosinophilic airway inflammation, as well as symptoms, is associated with a reduction in severe exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease.

The immune microenvironment influences tumour evolution and can be both prognostic and predict response to immunotherapy1,2. However, measurements of tumour infiltrating lymphocytes (TILs) are limited by a shortage of appropriate data. Whole-exome sequencing (WES) of DNA is frequently performed to calculate tumour mutational burden and identify actionable mutations. Here we develop T cell exome TREC tool (T cell ExTRECT), a method for estimation of T cell fraction from WES samples using a signal from T cell receptor excision circle (TREC) loss during V(D)J recombination of the T cell receptor-α gene (TCRA (also known as TRA)). TCRA T cell fraction correlates with orthogonal TIL estimates and is agnostic to sample type. Blood TCRA T cell fraction is higher in females than in males and correlates with both tumour immune infiltrate and presence of bacterial sequencing reads. Tumour TCRA T cell fraction is prognostic in lung adenocarcinoma. Using a meta-analysis of tumours treated with immunotherapy, we show that tumour TCRA T cell fraction predicts immunotherapy response, providing value beyond measuring tumour mutational burden. Applying T cell ExTRECT to a multi-sample pan-cancer cohort reveals a high diversity of the degree of immune infiltration within tumours. Subclonal loss of 12q24.31–32, encompassing SPPL3, is associated with reduced TCRA T cell fraction. T cell ExTRECT provides a cost-effective technique to characterize immune infiltrate alongside somatic changes. A robust, cost-effective technique based on whole-exome sequencing data can be used to characterize immune infiltrates, relate the extent of these infiltrates to somatic changes in tumours, and enables prediction of tumour responses to immune checkpoint inhibition therapy.