EK
Elaine Kilgour
Author with expertise in Genomic Landscape of Cancer and Mutational Signatures
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(100% Open Access)
Cited by:
1,276
h-index:
38
/
i10-index:
77
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

AZD4547: An Orally Bioavailable, Potent, and Selective Inhibitor of the Fibroblast Growth Factor Receptor Tyrosine Kinase Family

Paul Gavine et al.Feb 28, 2012
Abstract The fibroblast growth factor (FGF) signaling axis is increasingly implicated in tumorigenesis and chemoresistance. Several small-molecule FGF receptor (FGFR) kinase inhibitors are currently in clinical development; however, the predominant activity of the most advanced of these agents is against the kinase insert domain receptor (KDR), which compromises the FGFR selectivity. Here, we report the pharmacologic profile of AZD4547, a novel and selective inhibitor of the FGFR1, 2, and 3 tyrosine kinases. AZD4547 inhibited recombinant FGFR kinase activity in vitro and suppressed FGFR signaling and growth in tumor cell lines with deregulated FGFR expression. In a representative FGFR-driven human tumor xenograft model, oral administration of AZD4547 was well tolerated and resulted in potent dose-dependent antitumor activity, consistent with plasma exposure and pharmacodynamic modulation of tumor FGFR. Importantly, at efficacious doses, no evidence of anti-KDR–related effects were observed, confirming the in vivo FGFR selectivity of AZD4547. Taken together, our findings show that AZD4547 is a novel selective small-molecule inhibitor of FGFR with potent antitumor activity against FGFR-deregulated tumors in preclinical models. AZD4547 is under clinical investigation for the treatment of FGFR-dependent tumors. Cancer Res; 72(8); 2045–56. ©2012 AACR.
0

Selumetinib Plus Docetaxel Compared With Docetaxel Alone and Progression-Free Survival in Patients With KRAS-Mutant Advanced Non–Small Cell Lung Cancer

Pasi Jänne et al.May 9, 2017

Importance

 There are no specifically approved targeted therapies for the most common genomically defined subset of non–small cell lung cancer (NSCLC),KRAS-mutant lung cancer. 

Objective

 To compare efficacy of the mitogen-activated protein kinase kinase (MEK) inhibitor selumetinib + docetaxel with docetaxel alone as a second-line therapy for advancedKRAS-mutant NSCLC. 

Design, Setting, and Participants

 Multinational, randomized clinical trial conducted at 202 sites across 25 countries from October 2013 through January 2016. Of 3323 patients with advanced NSCLC and disease progression following first-line anticancer therapy tested for aKRASmutation, 866 were enrolled and 510 randomized. Primary reason for exclusion was ineligibility. The data cutoff date for analysis was June 7, 2016. 

Interventions

 Patients were randomized 1:1; 254 to receive selumetinib + docetaxel and 256 to receive placebo + docetaxel. 

Main Outcomes and Measures

 Primary end point was investigator assessed progression-free survival. Secondary end points included overall survival, objective response rate, duration of response, effects on disease-related symptoms, safety, and tolerability. 

Results

 Of 510 randomized patients (mean age, 61.4 years [SD, 8.3]; women, 207 [41%]), 505 patients (99%) received treatment and completed the study (251 received selumetinib + docetaxel; 254 received placebo + docetaxel). At the time of data cutoff, 447 patients (88%) had experienced a progression event and 346 deaths (68%) had occurred. Median progression-free survival was 3.9 months (interquartile range [IQR], 1.5-5.9) with selumetinib + docetaxel and 2.8 months (IQR, 1.4-5.5) with placebo + docetaxel (difference, 1.1 months; hazard ratio [HR], 0.93 [95% CI, 0.77-1.12];P = .44). Median overall survival was 8.7 months (IQR, 3.6-16.8) with selumetinib + docetaxel and 7.9 months (IQR, 3.8-20.1) with placebo + docetaxel (difference, 0.9 months; HR, 1.05 [95% CI, 0.85-1.30];P = .64). Objective response rate was 20.1% with selumetinib + docetaxel and 13.7% with placebo + docetaxel (difference, 6.4%; odds ratio, 1.61 [95% CI, 1.00-2.62];P = .05). Median duration of response was 2.9 months (IQR, 1.7-4.8; 95% CI, 2.7-4.1) with selumetinib + docetaxel and 4.5 months (IQR, 2.3-7.3; 95% CI, 2.8-5.6) with placebo + docetaxel. Adverse events of grade 3 or higher were more frequent with selumetinib + docetaxel (169 adverse events [67%] for selumetinib + docetaxel vs 115 adverse events [45%] for placebo + docetaxel; difference, 22%). 

Conclusions and Relevance

 Among patients with previously treated advancedKRAS-mutant non–small cell lung cancer, addition of selumetinib to docetaxel did not improve progression-free survival compared with docetaxel alone. 

Trial Registration

 clinicaltrials.gov:NCT01933932
0
Citation301
0
Save
0

High-Level Clonal FGFR Amplification and Response to FGFR Inhibition in a Translational Clinical Trial

Alex Pearson et al.May 14, 2016
Abstract FGFR1 and FGFR2 are amplified in many tumor types, yet what determines response to FGFR inhibition in amplified cancers is unknown. In a translational clinical trial, we show that gastric cancers with high-level clonal FGFR2 amplification have a high response rate to the selective FGFR inhibitor AZD4547, whereas cancers with subclonal or low-level amplification did not respond. Using cell lines and patient-derived xenograft models, we show that high-level FGFR2 amplification initiates a distinct oncogene addiction phenotype, characterized by FGFR2-mediated transactivation of alternative receptor kinases, bringing PI3K/mTOR signaling under FGFR control. Signaling in low-level FGFR1-amplified cancers is more restricted to MAPK signaling, limiting sensitivity to FGFR inhibition. Finally, we show that circulating tumor DNA screening can identify high-level clonally amplified cancers. Our data provide a mechanistic understanding of the distinct pattern of oncogene addiction seen in highly amplified cancers and demonstrate the importance of clonality in predicting response to targeted therapy. Significance: Robust single-agent response to FGFR inhibition is seen only in high-level FGFR-amplified cancers, with copy-number level dictating response to FGFR inhibition in vitro, in vivo, and in the clinic. High-level amplification of FGFR2 is relatively rare in gastric and breast cancers, and we show that screening for amplification in circulating tumor DNA may present a viable strategy to screen patients. Cancer Discov; 6(8); 838–51. ©2016 AACR. This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 803
0
Citation234
0
Save
0

Selumetinib in Combination With Dacarbazine in Patients With Metastatic Uveal Melanoma: A Phase III, Multicenter, Randomized Trial (SUMIT)

Richard Carvajal et al.Mar 12, 2018
Purpose Uveal melanoma is the most common primary intraocular malignancy in adults with no effective systemic treatment option in the metastatic setting. Selumetinib (AZD6244, ARRY-142886) is an oral, potent, and selective MEK1/2 inhibitor with a short half-life, which demonstrated single-agent activity in patients with metastatic uveal melanoma in a randomized phase II trial. Methods The Selumetinib (AZD6244: ARRY-142886) (Hyd-Sulfate) in Metastatic Uveal Melanoma (SUMIT) study was a phase III, double-blind trial ( ClinicalTrial.gov identifier: NCT01974752) in which patients with metastatic uveal melanoma and no prior systemic therapy were randomly assigned (3:1) to selumetinib (75 mg twice daily) plus dacarbazine (1,000 mg/m 2 intravenously on day 1 of every 21-day cycle) or placebo plus dacarbazine. The primary end point was progression-free survival (PFS) by blinded independent central radiologic review. Secondary end points included overall survival and objective response rate. Results A total of 129 patients were randomly assigned to receive selumetinib plus dacarbazine (n = 97) or placebo plus dacarbazine (n = 32). In the selumetinib plus dacarbazine group, 82 patients (85%) experienced a PFS event, compared with 24 (75%) in the placebo plus dacarbazine group (median, 2.8 v 1.8 months); the hazard ratio for PFS was 0.78 (95% CI, 0.48 to 1.27; two-sided P = .32). The objective response rate was 3% with selumetinib plus dacarbazine and 0% with placebo plus dacarbazine (two-sided P = .36). At 37% maturity (n = 48 deaths), analysis of overall survival gave a hazard ratio of 0.75 (95% CI, 0.39 to 1.46; two-sided P = .40). The most frequently reported adverse events (selumetinib plus dacarbazine v placebo plus dacarbazine) were nausea (62% v 19%), rash (57% v 6%), fatigue (44% v 47%), diarrhea (44% v 22%), and peripheral edema (43% v 6%). Conclusion In patients with metastatic uveal melanoma, the combination of selumetinib plus dacarbazine had a tolerable safety profile but did not significantly improve PFS compared with placebo plus dacarbazine.
0
Citation234
0
Save
4

Using DNA sequencing data to quantify T cell fraction and therapy response

Robert Bentham et al.Sep 8, 2021
The immune microenvironment influences tumour evolution and can be both prognostic and predict response to immunotherapy1,2. However, measurements of tumour infiltrating lymphocytes (TILs) are limited by a shortage of appropriate data. Whole-exome sequencing (WES) of DNA is frequently performed to calculate tumour mutational burden and identify actionable mutations. Here we develop T cell exome TREC tool (T cell ExTRECT), a method for estimation of T cell fraction from WES samples using a signal from T cell receptor excision circle (TREC) loss during V(D)J recombination of the T cell receptor-α gene (TCRA (also known as TRA)). TCRA T cell fraction correlates with orthogonal TIL estimates and is agnostic to sample type. Blood TCRA T cell fraction is higher in females than in males and correlates with both tumour immune infiltrate and presence of bacterial sequencing reads. Tumour TCRA T cell fraction is prognostic in lung adenocarcinoma. Using a meta-analysis of tumours treated with immunotherapy, we show that tumour TCRA T cell fraction predicts immunotherapy response, providing value beyond measuring tumour mutational burden. Applying T cell ExTRECT to a multi-sample pan-cancer cohort reveals a high diversity of the degree of immune infiltration within tumours. Subclonal loss of 12q24.31–32, encompassing SPPL3, is associated with reduced TCRA T cell fraction. T cell ExTRECT provides a cost-effective technique to characterize immune infiltrate alongside somatic changes. A robust, cost-effective technique based on whole-exome sequencing data can be used to characterize immune infiltrates, relate the extent of these infiltrates to somatic changes in tumours, and enables prediction of tumour responses to immune checkpoint inhibition therapy.
4
Citation47
1
Save