ML
Mark Law
Author with expertise in Lymphoid Neoplasms
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(86% Open Access)
Cited by:
2,592
h-index:
45
/
i10-index:
150
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

A t(1;19)(q10;p10) Mediates the Combined Deletions of 1p and 19q and Predicts a Better Prognosis of Patients with Oligodendroglioma

Robert Jenkins et al.Oct 15, 2006
Abstract Combined deletion of chromosomes 1p and 19q is associated with improved prognosis and responsiveness to therapy in patients with anaplastic oligodendroglioma. The deletions usually involve whole chromosome arms, suggesting a t(1;19)(q10;p10). Using stem cell medium, we cultured a few tumors. Paraffin-embedded tissue was obtained from 21 Mayo Clinic patients and 98 patients enrolled in 2 North Central Cancer Treatment Group (NCCTG) low-grade glioma trials. Interphase fusion of CEP1 and 19p12 probes detected the t(1;19). 1p/19q deletions were evaluated by fluorescence in situ hybridization. Upon culture, one oligodendroglioma contained an unbalanced 45,XX,t(1;19)(q10;p10). CEP1/19p12 fusion was observed in all metaphases and 74% of interphase nuclei. Among Mayo Clinic oligodendrogliomas, the prevalence of fusion was 81%. Among NCCTG patients, CEP1/19p12 fusion prevalence was 55%, 47%, and 0% among the oligodendrogliomas, mixed oligoastrocytomas, and astrocytomas, respectively. Ninety-one percent of NCCTG gliomas with 1p/19q deletion and 12% without 1p/19q deletion had CEP1/19p12 fusion (P &lt; 0.001, χ2 test). The median overall survival (OS) for all patients was 8.1 years without fusion and 11.9 years with fusion (P = 0.003). The median OS for patients with low-grade oligodendroglioma was 9.1 years without fusion and 13.0 years with fusion (P = 0.01). Similar significant median OS differences were observed for patients with combined 1p/19q deletions. The absence of alterations was associated with a significantly shorter OS for patients who received higher doses of radiotherapy. Our results strongly suggest that a t(1;19)(q10;p10) mediates the combined 1p/19q deletion in human gliomas. Like combined 1p/19q deletion, the 1;19 translocation is associated with superior OS and progression-free survival in low-grade glioma patients. (Cancer Res 2006; 66(20): 9852-61)
0
Citation722
0
Save
0

ALK-negative anaplastic large cell lymphoma is a genetically heterogeneous disease with widely disparate clinical outcomes

Edgardo Castellar et al.Jun 3, 2014
Anaplastic lymphoma kinase (ALK)-negative anaplastic large cell lymphoma (ALCL) is a CD30-positive T-cell non-Hodgkin lymphoma that morphologically resembles ALK-positive ALCL but lacks chromosomal rearrangements of the ALK gene. The genetic and clinical heterogeneity of ALK-negative ALCL has not been delineated. We performed immunohistochemistry and fluorescence in situ hybridization on 73 ALK-negative ALCLs and 32 ALK-positive ALCLs and evaluated the associations among pathology, genetics, and clinical outcome. Chromosomal rearrangements of DUSP22 and TP63 were identified in 30% and 8% of ALK-negative ALCLs, respectively. These rearrangements were mutually exclusive and were absent in ALK-positive ALCLs. Five-year overall survival rates were 85% for ALK-positive ALCLs, 90% for DUSP22-rearranged ALCLs, 17% for TP63-rearranged ALCLs, and 42% for cases lacking all 3 genetic markers (P < .0001). Hazard ratios for death in these 4 groups after adjusting for International Prognostic Index and age were 1.0 (reference group), 0.58, 8.63, and 4.16, respectively (P = 7.10 × 10(-5)). These results were similar when restricted to patients receiving anthracycline-based chemotherapy, as well as to patients not receiving stem cell transplantation. Thus, ALK-negative ALCL is a genetically heterogeneous disease with widely disparate outcomes following standard therapy. DUSP22 and TP63 rearrangements may serve as predictive biomarkers to help guide patient management.
0
Citation415
0
Save
0

Review—Ionizing Radiation Damage Effects on GaN Devices

S. Pearton et al.Nov 24, 2015
Gallium Nitride based high electron mobility transistors (HEMTs) are attractive for use in high power and high frequency applications, with higher breakdown voltages and two dimensional electron gas (2DEG) density compared to their GaAs counterparts. Specific applications for nitride HEMTs include air, land and satellite based communications and phased array radar. Highly efficient GaN-based blue light emitting diodes (LEDs) employ AlGaN and InGaN alloys with different compositions integrated into heterojunctions and quantum wells. The realization of these blue LEDs has led to white light sources, in which a blue LED is used to excite a phosphor material; light is then emitted in the yellow spectral range, which, combined with the blue light, appears as white. Alternatively, multiple LEDs of red, green and blue can be used together. Both of these technologies are used in high-efficiency white electroluminescent light sources. These light sources are efficient and long-lived and are therefore replacing incandescent and fluorescent lamps for general lighting purposes. Since lighting represents 20–30% of electrical energy consumption, and because GaN white light LEDs require ten times less energy than ordinary light bulbs, the use of efficient blue LEDs leads to significant energy savings. GaN-based devices are more radiation hard than their Si and GaAs counterparts due to the high bond strength in III-nitride materials. The response of GaN to radiation damage is a function of radiation type, dose and energy, as well as the carrier density, impurity content and dislocation density in the GaN. The latter can act as sinks for created defects and parameters such as the carrier removal rate due to trapping of carriers into radiation-induced defects depends on the crystal growth method used to grow the GaN layers. The growth method has a clear effect on radiation response beyond the carrier type and radiation source. We review data on the radiation resistance of AlGaN/GaN and InAlN/GaN HEMTs and GaN–based LEDs to different types of ionizing radiation, and discuss ion stopping mechanisms. The primary energy levels introduced by different forms of radiation, carrier removal rates and role of existing defects in GaN are discussed. The carrier removal rates are a function of initial carrier concentration and dose but not of dose rate or hydrogen concentration in the nitride material grown by Metal Organic Chemical Vapor Deposition. Proton and electron irradiation damage in HEMTs creates positive threshold voltage shifts due to a decrease in the two dimensional electron gas concentration resulting from electron trapping at defect sites, as well as a decrease in carrier mobility and degradation of drain current and transconductance. State-of-art simulators now provide accurate predictions for the observed changes in radiation-damaged HEMT performance. Neutron irradiation creates more extended damage regions and at high doses leads to Fermi level pinning while 60Co γ-ray irradiation leads to much smaller changes in HEMT drain current relative to the other forms of radiation. In InGaN/GaN blue LEDs irradiated with protons at fluences near 1014 cm−2 or electrons at fluences near 1016 cm−2, both current-voltage and light output-current characteristics are degraded with increasing proton dose. The optical performance of the LEDs is more sensitive to the proton or electron irradiation than that of the corresponding electrical performances.