CR
Carrie Reed
Author with expertise in Influenza Virus Research and Epidemiology
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
14
(100% Open Access)
Cited by:
8,024
h-index:
50
/
i10-index:
120
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Adults

Seema Jain et al.Jul 14, 2015
+29
R
W
S
Community-acquired pneumonia is a leading infectious cause of hospitalization and death among U.S. adults. Incidence estimates of pneumonia confirmed radiographically and with the use of current laboratory diagnostic tests are needed.
0

Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Children

Seema Jain et al.Feb 25, 2015
+29
S
D
S
Incidence estimates of hospitalizations for community-acquired pneumonia among children in the United States that are based on prospective data collection are limited. Updated estimates of pneumonia that has been confirmed radiographically and with the use of current laboratory diagnostic tests are needed.
0

Estimated global mortality associated with the first 12 months of 2009 pandemic influenza A H1N1 virus circulation: a modelling study

Fatimah Dawood et al.Jun 26, 2012
+28
C
A
F
18,500 laboratory-confirmed deaths caused by the 2009 pandemic influenza A H1N1 were reported worldwide for the period April, 2009, to August, 2010. This number is likely to be only a fraction of the true number of the deaths associated with 2009 pandemic influenza A H1N1. We aimed to estimate the global number of deaths during the first 12 months of virus circulation in each country.We calculated crude respiratory mortality rates associated with the 2009 pandemic influenza A H1N1 strain by age (0-17 years, 18-64 years, and >64 years) using the cumulative (12 months) virus-associated symptomatic attack rates from 12 countries and symptomatic case fatality ratios (sCFR) from five high-income countries. To adjust crude mortality rates for differences between countries in risk of death from influenza, we developed a respiratory mortality multiplier equal to the ratio of the median lower respiratory tract infection mortality rate in each WHO region mortality stratum to the median in countries with very low mortality. We calculated cardiovascular disease mortality rates associated with 2009 pandemic influenza A H1N1 infection with the ratio of excess deaths from cardiovascular and respiratory diseases during the pandemic in five countries and multiplied these values by the crude respiratory disease mortality rate associated with the virus. Respiratory and cardiovascular mortality rates associated with 2009 pandemic influenza A H1N1 were multiplied by age to calculate the number of associated deaths.We estimate that globally there were 201,200 respiratory deaths (range 105,700-395,600) with an additional 83,300 cardiovascular deaths (46,000-179,900) associated with 2009 pandemic influenza A H1N1. 80% of the respiratory and cardiovascular deaths were in people younger than 65 years and 51% occurred in southeast Asia and Africa.Our estimate of respiratory and cardiovascular mortality associated with the 2009 pandemic influenza A H1N1 was 15 times higher than reported laboratory-confirmed deaths. Although no estimates of sCFRs were available from Africa and southeast Asia, a disproportionate number of estimated pandemic deaths might have occurred in these regions. Therefore, efforts to prevent influenza need to effectively target these regions in future pandemics.None.
0

Seroprevalence of Antibodies to SARS-CoV-2 in 10 Sites in the United States, March 23-May 12, 2020

Fiona Havers et al.Jul 21, 2020
+36
T
C
F

Importance

 Reported cases of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection likely underestimate the prevalence of infection in affected communities. Large-scale seroprevalence studies provide better estimates of the proportion of the population previously infected. 

Objective

 To estimate prevalence of SARS-CoV-2 antibodies in convenience samples from several geographic sites in the US. 

Design, Setting, and Participants

 This cross-sectional study performed serologic testing on a convenience sample of residual sera obtained from persons of all ages. The serum was collected from March 23 through May 12, 2020, for routine clinical testing by 2 commercial laboratory companies. Sites of collection were San Francisco Bay area, California; Connecticut; south Florida; Louisiana; Minneapolis-St Paul-St Cloud metro area, Minnesota; Missouri; New York City metro area, New York; Philadelphia metro area, Pennsylvania; Utah; and western Washington State. 

Exposures

 Infection with SARS-CoV-2. 

Main Outcomes and Measures

 The presence of antibodies to SARS-CoV-2 spike protein was estimated using an enzyme-linked immunosorbent assay, and estimates were standardized to the site populations by age and sex. Estimates were adjusted for test performance characteristics (96.0% sensitivity and 99.3% specificity). The number of infections in each site was estimated by extrapolating seroprevalence to site populations; estimated infections were compared with the number of reported coronavirus disease 2019 (COVID-19) cases as of last specimen collection date. 

Results

 Serum samples were tested from 16 025 persons, 8853 (55.2%) of whom were women; 1205 (7.5%) were 18 years or younger and 5845 (36.2%) were 65 years or older. Most specimens from each site had no evidence of antibodies to SARS-CoV-2. Adjusted estimates of the proportion of persons seroreactive to the SARS-CoV-2 spike protein antibodies ranged from 1.0% in the San Francisco Bay area (collected April 23-27) to 6.9% of persons in New York City (collected March 23-April 1). The estimated number of infections ranged from 6 to 24 times the number of reported cases; for 7 sites (Connecticut, Florida, Louisiana, Missouri, New York City metro area, Utah, and western Washington State), an estimated greater than 10 times more SARS-CoV-2 infections occurred than the number of reported cases. 

Conclusions and Relevance

 During March to early May 2020, most persons in 10 diverse geographic sites in the US had not been infected with SARS-CoV-2 virus. The estimated number of infections, however, was much greater than the number of reported cases in all sites. The findings may reflect the number of persons who had mild or no illness or who did not seek medical care or undergo testing but who still may have contributed to ongoing virus transmission in the population.
0
Citation700
0
Save
0

Household Transmission of 2009 Pandemic Influenza A (H1N1) Virus in the United States

Simon Cauchemez et al.Dec 30, 2009
+5
C
C
S
As of June 11, 2009, a total of 17,855 probable or confirmed cases of 2009 pandemic influenza A (H1N1) had been reported in the United States. Risk factors for transmission remain largely uncharacterized. We characterize the risk factors and describe the transmission of the virus within households.
0

Community Mitigation Guidelines to Prevent Pandemic Influenza — United States, 2017

Stephen Redd et al.Apr 20, 2017
+14
N
A
S
This report from CDC’s Morbidity and Mortality Weekly Report (MMWR) replaces the 2007 Interim Pre-pandemic Planning Guidance: Community Strategy for Pandemic Influenza Mitigation in the United States â€” Early, Targeted, Layered Use of Nonpharmaceutical Interventions.
0
Paper
Citation445
0
Save
0

Estimating the Burden of 2009 Pandemic Influenza A (H1N1) in the United States (April 2009-April 2010)

Sundar Shrestha et al.Dec 13, 2010
+18
R
D
S
To calculate the burden of 2009 pandemic influenza A (pH1N1) in the United States, we extrapolated from the Centers for Disease Control and Prevention's Emerging Infections Program laboratory-confirmed hospitalizations across the entire United States, and then corrected for underreporting. From 12 April 2009 to 10 April 2010, we estimate that approximately 60.8 million cases (range: 43.3–89.3 million), 274 304 hospitalizations (195 086–402 719), and 12 469 deaths (8868–18 306) occurred in the United States due to pH1N1. Eighty-seven percent of deaths occurred in those under 65 years of age with children and working adults having risks of hospitalization and death 4 to 7 times and 8 to 12 times greater, respectively, than estimates of impact due to seasonal influenza covering the years 1976–2001. In our study, adults 65 years of age or older were found to have rates of hospitalization and death that were up to 75% and 81%, respectively, lower than seasonal influenza. These results confirm the necessity of a concerted public health response to pH1N1.
0

Estimating Influenza Disease Burden from Population-Based Surveillance Data in the United States

Carrie Reed et al.Mar 4, 2015
+11
P
S
C
Annual estimates of the influenza disease burden provide information to evaluate programs and allocate resources. We used a multiplier method with routine population-based surveillance data on influenza hospitalization in the United States to correct for under-reporting and estimate the burden of influenza for seasons after the 2009 pandemic. Five sites of the Influenza Hospitalization Surveillance Network (FluSurv-NET) collected data on the frequency and sensitivity of influenza testing during two seasons to estimate under-detection. Population-based rates of influenza-associated hospitalization and Intensive Care Unit admission from 2010-2013 were extrapolated to the U.S. population from FluSurv-NET and corrected for under-detection. Influenza deaths were calculated using a ratio of deaths to hospitalizations. We estimated that influenza-related hospitalizations were under-detected during 2010-11 by a factor of 2.1 (95%CI 1.7-2.9) for age < 18 years, 3.1 (2.4-4.5) for ages 18-64 years, and 5.2 (95%CI 3.8-8.3) for age 65+. Results were similar in 2011-12. Extrapolated estimates for 3 seasons from 2010-2013 included: 114,192-624,435 hospitalizations, 18,491-95,390 ICU admissions, and 4,915-27,174 deaths per year; 54-70% of hospitalizations and 71-85% of deaths occurred among adults aged 65+. Influenza causes a substantial disease burden in the U.S. that varies by age and season. Periodic estimation of multipliers across multiple sites and age groups improves our understanding of influenza detection in sentinel surveillance systems. Adjusting surveillance data using a multiplier method is a relatively simple means to estimate the impact of influenza and the subsequent value of interventions to prevent influenza.
0

Estimates of the Prevalence of Pandemic (H1N1) 2009, United States, April–July 2009

Carrie Reed et al.Nov 26, 2009
+4
D
F
C
Abstract Through July 2009, a total of 43,677 laboratory-confirmed cases of influenza A pandemic (H1N1) 2009 were reported in the United States, which is likely a substantial underestimate of the true number. Correcting for under-ascertainment using a multiplier model, we estimate that 1.8 million–5.7 million cases occurred, including 9,000–21,000 hospitalizations.
0

Outbreak of Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N1) Viruses in U.S. Dairy Cattle and Detection of Two Human Cases — United States, 2024

Shikha Garg et al.May 24, 2024
+20
T
C
S
Comprehensive and timely information on influenza virus characteristics is critical for determining when the flu season starts and which viruses are circulating, for identifying and preparing viruses for use in influenza vaccines, and for detecting novel influenza viruses with potential for pandemic spread.In 2013, the first edition of the "Right Size Roadmap" was released.The document was the result of an initiative begun in 2010, led in partnership by the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) and the Association of Public Health Laboratories (APHL) which engaged various stakeholders, including: epidemiologists, laboratorians, and influenza coordinators at local and state public health departments and at CDC; members and staff from the Council of State and Territorial Epidemiologists (CSTE); clinical and commercial laboratory associations; academic statisticians; and consultants in efficiency improvement.The goal of the effort was to support improved use of new tools for accurate and rapid molecular diagnosis of influenza, new opportunities for electronic communication of laboratory results, and to maintain or enhance virologic surveillance in the United States to detect first cases of emerging novel influenza A virus infection, such as infections with variant A(H3N2), or avian A(H5Nx) or A(H7N9) viruses.The resulting document provided a set of functional requirements to design and build an optimal virologic surveillance system, improve existing systems approaches, focus resources and efficiencies, inform policymakers, and justify state and local funding requests.It used statistical tools to determine the desired or acceptable level of surveillance and recommended efficiency approaches.Today we have a standardized sampling strategy across public health and clinical laboratories that is nationally representative, ensures efficiency and data confidence, and includes characterizing both the antigenic and genomic properties of circulating influenza viruses.The landscape of influenza virologic surveillance has changed significantly since the first edition with national surveillance of influenza having transitioned to rely on public health laboratories submitting a set number of influenza positive samples weekly to one of the National Influenza Reference Centers (NIRCs), established in 2009, where additional characterization including virus isolation and whole genomic sequencing are done.Resultant isolates and data are then compiled by the CDC for further characterization and analysis.In addition to identifying the optimum "sampling" strategy, major improvements in sharing these data have taken place.In March 2009, five laboratories were routinely sharing specimen level data electronically with CDC.Today, all public health laboratories at the state level and some local public health and clinical laboratories send specimen level data electronically to CDC's Influenza Division.This increase has improved the timeliness and completeness of reporting for both seasonal influenza surveillance activities and the identification of novel influenza A viruses.Influenza viruses are constantly changing, and efforts to monitor and characterize the virus similarly need to be flexible and adaptive to changes in healthcare, laboratory technology, and financial and staff resources.Equally, this second release will also change, and as such, continued input and feedback are invited to improve these recommendations for achieving a right size for influenza virologic surveillance.Future iterations will explore the possibility of utilizing the Right Size approach for non-influenza virus responses. Vivien DuganDirector, Influenza Division Centers for Disease Control and Prevention * Any influenza positive specimen that cannot be definitively typed and subtyped as a circulating seasonal influenza A virus, influenza positive specimens producing nonstandard or inconclusive results as defined in the CDC Flu rRT-PCR Dx Panel Instructions for Use package insert.
0
Citation15
0
Save
Load More