VG
Valentina González-Jaramillo
Author with expertise in Epigenetic Modifications and Their Functional Implications
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
8
(75% Open Access)
Cited by:
484
h-index:
12
/
i10-index:
13
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Dynamic interventions to control COVID-19 pandemic: a multivariate prediction modelling study comparing 16 worldwide countries

Rajiv Chowdhury et al.May 1, 2020
Abstract To date, non-pharmacological interventions (NPI) have been the mainstay for controlling the coronavirus disease-2019 (COVID-19) pandemic. While NPIs are effective in preventing health systems overload, these long-term measures are likely to have significant adverse economic consequences. Therefore, many countries are currently considering to lift the NPIs—increasing the likelihood of disease resurgence. In this regard, dynamic NPIs, with intervals of relaxed social distancing, may provide a more suitable alternative. However, the ideal frequency and duration of intermittent NPIs, and the ideal “break” when interventions can be temporarily relaxed, remain uncertain, especially in resource-poor settings. We employed a multivariate prediction model, based on up-to-date transmission and clinical parameters, to simulate outbreak trajectories in 16 countries, from diverse regions and economic categories. In each country, we then modelled the impacts on intensive care unit (ICU) admissions and deaths over an 18-month period for following scenarios: (1) no intervention, (2) consecutive cycles of mitigation measures followed by a relaxation period, and (3) consecutive cycles of suppression measures followed by a relaxation period. We defined these dynamic interventions based on reduction of the mean reproduction number during each cycle, assuming a basic reproduction number ( R 0 ) of 2.2 for no intervention, and subsequent effective reproduction numbers ( R ) of 0.8 and 0.5 for illustrative dynamic mitigation and suppression interventions, respectively. We found that dynamic cycles of 50-day mitigation followed by a 30-day relaxation reduced transmission, however, were unsuccessful in lowering ICU hospitalizations below manageable limits. By contrast, dynamic cycles of 50-day suppression followed by a 30-day relaxation kept the ICU demands below the national capacities. Additionally, we estimated that a significant number of new infections and deaths, especially in resource-poor countries, would be averted if these dynamic suppression measures were kept in place over an 18-month period. This multi-country analysis demonstrates that intermittent reductions of R below 1 through a potential combination of suppression interventions and relaxation can be an effective strategy for COVID-19 pandemic control. Such a “schedule” of social distancing might be particularly relevant to low-income countries, where a single, prolonged suppression intervention is unsustainable. Efficient implementation of dynamic suppression interventions, therefore, confers a pragmatic option to: (1) prevent critical care overload and deaths, (2) gain time to develop preventive and clinical measures, and (3) reduce economic hardship globally.
0

Dietary protein intake and all-cause and cause-specific mortality: results from the Rotterdam Study and a meta-analysis of prospective cohort studies

Zhangling Chen et al.Feb 19, 2020
Evidence for associations between long-term protein intake with mortality is not consistent. We aimed to examine associations of dietary protein from different sources with all-cause and cause-specific mortality. We followed 7786 participants from three sub-cohorts of the Rotterdam Study, a population-based cohort in the Netherlands. Dietary data were collected using food-frequency questionnaires at baseline (1989-1993, 2000-2001, 2006-2008). Deaths were followed until 2018. Associations were examined using Cox regression. Additionally, we performed a highest versus lowest meta-analysis and a dose-response meta-analysis to summarize results from the Rotterdam Study and previous prospective cohorts. During a median follow-up of 13.0 years, 3589 deaths were documented in the Rotterdam Study. In this cohort, after multivariable adjustment, higher total protein intake was associated with higher all-cause mortality [e.g. highest versus lowest quartile of total protein intake as percentage of energy (Q4 versus Q1), HR = 1.12 (1.01, 1.25)]; mainly explained by higher animal protein intake and CVD mortality [Q4 versus Q1, CVD mortality: 1.28 (1.03, 1.60)]. The association of animal protein intake and CVD was mainly contributed to by protein from meat and dairy. Total plant protein intake was not associated with all-cause or cause-specific mortality, mainly explained by null associations for protein from grains and potatoes; but higher intake of protein from legumes, nuts, vegetables, and fruits was associated with lower risk of all-cause and cause-specific mortality. Findings for total and animal protein intake were corroborated in a meta-analysis of eleven prospective cohort studies including the Rotterdam Study (total 64,306 deaths among 350,452 participants): higher total protein intake was associated with higher all-cause mortality [pooled RR for highest versus lowest quantile 1.05 (1.01, 1.10)]; and for dose-response per 5 energy percent (E%) increment, 1.02 (1.004, 1.04); again mainly driven by an association between animal protein and CVD mortality [highest versus lowest, 1.09 (1.01, 1.18); per 5 E% increment, 1.05 (1.02, 1.09)]. Furthermore, in the meta-analysis a higher plant protein intake was associated with lower all-cause and CVD mortality [e.g. for all-cause mortality, highest versus lowest, 0.93 (0.87, 0.99); per 5 E% increment, 0.87 (0.78, 0.98), for CVD mortality, highest versus lowest 0.86 (0.73, 1.00)]. Evidence from prospective cohort studies to date suggests that total protein intake is positively associated with all-cause mortality, mainly driven by a harmful association of animal protein with CVD mortality. Plant protein intake is inversely associated with all-cause and CVD mortality. Our findings support current dietary recommendations to increase intake of plant protein in place of animal protein.Clinical trial registry number and website NTR6831, https://www.trialregister.nl/trial/6645.
0
Citation79
0
Save
0

Epigenetics and Inflammatory Markers: A Systematic Review of the Current Evidence

Valentina González-Jaramillo et al.May 8, 2019
Epigenetic mechanisms have been suggested to play a role in the genetic regulation of pathways related to inflammation. Therefore, we aimed to systematically review studies investigating the association between DNA methylation and histone modifications with circulatory inflammation markers in blood. Five bibliographic databases were screened until 21 November of 2017. We included studies conducted on humans that examined the association between epigenetic marks (DNA methylation and/or histone modifications) and a comprehensive list of inflammatory markers. Of the 3,759 identified references, 24 articles were included, involving, 17,399 individuals. There was suggestive evidence for global hypomethylation but better-quality studies in the future have to confirm this. Epigenome-wide association studies (EWAS) (n=7) reported most of the identified differentially methylated genes to be hypomethylated in inflammatory processes. Candidate genes studies reported 18 differentially methylated genes related to several circulatory inflammation markers. There was no overlap in the methylated sites investigated in candidate gene studies and EWAS, except for TMEM49, which was found to be hypomethylated with higher inflammatory markers in both types of studies. The relation between histone modifications and inflammatory markers was assessed by one study only. This review supports an association between epigenetic marks and inflammation, suggesting hypomethylation of the genome. Important gaps in the quality of studies were reported such as inadequate sample size, lack of adjustment for relevant confounders, and failure to replicate the findings. While most of the studies have been focused on C-reactive protein, further efforts should investigate other inflammatory markers.
0
Citation39
0
Save
0

Associations between Phytoestrogens, Glucose Homeostasis, and Risk of Diabetes in Women: A Systematic Review and Meta-Analysis

Marija Glišić et al.Nov 1, 2018
Phytoestrogens might have advantageous effects on diabetes in women. We performed a systematic review and meta-analysis to determine the effect of phytoestrogens on glucose homeostasis and the risk of type 2 diabetes (T2D) among women. Randomized controlled trials (RCTs) and prospective observational studies that assessed associations of phytoestrogens (supplementation, dietary intake, or biomarkers) with fasting glucose or insulin, homeostatic model assessment of insulin resistance (HOMA-IR), or with the risk of T2D were included. We identified 18 RCTs (n = 1687 individuals) investigating the effect of phytoestrogen supplementation on glucose homeostasis and 9 prospective population-based studies (n = 212,796 individuals) examining the association between phytoestrogen intake and the risk of T2D. Compared with placebo, phytoestrogen supplementation resulted in improvements in fasting glucose and HOMA-IR: the pooled mean differences of changes were –0.12 mmol/L (95% CI: –0.20, –0.03 mmol/L) and –0.24 mmol/L (95% CI: –0.45, –0.03 mmol/L), respectively. Although there was no significant decrease in insulin concentrations with overall phytoestrogen supplementation, the pooled mean difference in changes was –0.99 pmol/L (95% CI: –4.65, 2.68 pmol/L). However, the results of RCTs varied by type of phytoestrogens: soy-derived isoflavones and genistein improved glucose homeostasis, whereas isoflavone mix and daidzein had no effect or were associated with an adverse glycemic profile. Higher dietary phytoestrogen intake was associated with a 10% lower risk of developing T2D in observational studies (pooled RR: 0.90; 95% CI: 0.85, 0.96; for the highest compared with the lowest quantiles). Results were similar when the analyses were restricted to only medium- and high-quality studies. Overall, phytoestrogens may have a positive influence on glycemia and could be used for diabetes prevention in women. However, for some individual types of phytoestrogens, such as mixed isoflavones, caution is needed in recommending their use in women, because their use could lead to an adverse glycemic profile in women.
0
Citation30
0
Save
0

Sexually dimorphic DNA-methylation in cardiometabolic health: A systematic review

Eralda Asllanaj et al.May 1, 2020
Sex is a major determinant of cardiometabolic risk. DNA methylation (DNAm), an important epigenetic mechanism that differs between sexes, has been associated with cardiometabolic diseases. Therefore, we aimed to systematically review studies in adults investigating sex-specific associations of DNAm with intermediate cardiometabolic traits and incident cardiovascular disease including stroke, myocardial infarction (MI) and coronary heart disease (CHD). Five bibliographic databases were searched from inception to 15 July 2019. We selected 35 articles (based on 30 unique studies) from 17,023 references identified, with a total of 14,020 participants of European, North American or Asian ancestry. Four studies reported sex differences between global DNAm and blood lipid levels and stroke risk. In 25 studies that took a genome wide or candidate gene approach, DNAm at 31 gene sites was associated with sex differences in cardiometabolic diseases. The identified genes were PLA2G7, BCL11A, KDM6A, LIPC, ABCG1, PLTP, CETP, ADD1, CNN1B, HOOK2, GFBP-7,PTPN1, GCK, PTX3, ABCG1, GALNT2, CDKN2B, APOE, CTH, GNASAS, INS, PON1, TCN2, CBS, AMT, KDMA6A, FTO, MAP3K13, CCDC8, MMP-2 and ER-α. Prioritized pathway connectivity analysis associated these genes with biological pathways such as vitamin B12 metabolism, statin pathway, plasma lipoprotein, plasma lipoprotein assembly, remodeling and clearance and cholesterol metabolism. Our findings suggest that DNAm might be a promising molecular strategy for understanding sex differences in the pathophysiology of cardiometabolic diseases and that future studies should investigate the effects of sex on epigenetic mechanisms in cardiometabolic risk. In addition, we emphasize the gap between the translational potential and the clinical utilization of cardiometabolic epigenetics.
0
Citation17
0
Save
0

Dietary factors and onset of natural menopause: a systematic review and meta-analysis

Giorgia Grisotto et al.May 1, 2022
Diet has been suggested to play a role in determining the age at natural menopause; however, the evidence is inconsistent.We systematically reviewed and evaluated published research about associations between diet and onset of natural menopause (ONM).We searched 6 databases (Medline, Embase, Cochrane, PubMed, Web of Science and Google Scholar) through January 21,2021 to identify prospective studies assessing the association between diet and ONM. Two independent reviewers extracted data using a predesigned data-collection form. Pooled hazard risks (HRs) were calculated using random effect models.Of the 6,137 eligible references we reviewed, we included 15 articles in our final analysis. Those 15 articles included 91,554 women out of 298,413 who experienced natural menopause during follow-up. Overall, there were 89 food groups investigated, 38 macronutrients and micronutrients, and 6 dietary patterns. Among the food groups, higher intake of green and yellow vegetables was associated with earlier age of ONM, while high intakes of some dairy products, such as low-fat, skimmed milk, and low intake of alcohol were associated with a later onset. We observed no consistent association between macronutrient and micronutrient intake and ONM. Our results suggests that a vegetarian diet could be associated with early ONM; we did not observe any other consistent effect from other dietary patterns. Limitations included the number of studies, lack of replication studies and the research being of an observational nature; most studies (11/15) were at medium risk of bias.Although some food items were associated with ONM, the overall evidence about associations between diet and ONM remains controversial. Prospero id: CRD42021232087.
0
Citation8
0
Save
0

A core outcome set for best care for the dying person: Results of an international Delphi study and consensus meeting

Sofía Zambrano et al.Dec 4, 2024
Background: Outcome measurement is essential to progress clinical practice and improve patient care. Aim: To develop a Core Outcome Set for best care for the dying person. Design: We followed the Core Outcome Measures in Effectiveness Trials (COMET) Initiative guidelines, which involved identifying potential outcomes via a systematic literature review (n = 619 papers) and from participants in the “iLIVE” project (10 countries: 101 patients, 37 family members, 63 clinicians), followed by a two-round Delphi study, and a consensus meeting. Setting/participants: Clinicians, researchers, family members, and patient representatives from 20 countries participated in the Delphi Rounds 1 (n = 462) and 2 (n = 355). Thirty-two participants attended the consensus meeting. Results: From the systematic review and the cohort study we identified 256 and 238 outcomes respectively, from which we extracted a 52-outcome list covering areas related to the patients’ physical, psychosocial, and spiritual dimensions, family support, place of care and care delivery, relational aspects of care, and general concepts. A preliminary 13-outcome list reached consensus during the Delphi. At the consensus meeting, a 14-item Core Outcome Set was ratified by the participants. Conclusions: This study involved a large and diverse sample of key stakeholders in defining the core outcome set for best care for the dying person, focusing on the last days of life. By actively integrating the perspectives of family carers and patient representatives from various cultural backgrounds this Core Outcome Set enriches our understanding of essential elements of care for the dying and provides a solid foundation for advancing quality of end-of-life care.