Since its pandemic in 2019, SARS-CoV-2 has badly affected the countries around the globe. There is no FDA approved drug for the treatment of the disease. In this study, we evaluated potential targets against non-structural protein-1 (Nsp-1), which is crucial in disturbing host-translational machinery. As the completecrystal structure of the Nsp-1 was not available, we used I-TASSER for making the complete structure of the protein. The structure was verified using ERRATand PROVEAN. As the previous studies had reported different binding sites for this protein, we used blind docking of Nsp-1 with 2225 FDA approved drugsusing AutoDock Vina. Based upon the residue interactions obtained from the blind docking, we selected C-terminal of Nsp-1 for specific docking against FDAapproved drugs. Based upon the docking results, Glycyrrhizin was found to be suitable drug showing strong interactions. We further verified the glycyrrhizin-Nsp-1 complex by analyzing the trajectory for 60 ns, by comparing with individual protein. RMSD analysis during the trajectory and RMSF analysis alsosuggested the stability of the protein-ligand complex and resulted in 49 hydrogen bonds during the simulation process. The study suggests that Glycyrrhizin can act as potential inhibitors against Nsp-1 of SARS-COV-2.

Type-II diabetes is the most common type of diabetes, which has affected more than 465 million people globally and has become the ninth leading cause of mortality. The current study aims to determine risk factors associated with type-II diabetes such as BMI, cholesterol levels, physical activity, and smoking along with co-morbidities associated with this disease. The data was collected from the province of Punjab, Pakistan. For this purpose, a survey was performed for investigating the prevalence of type II diabetes and associated risk factors combined with it. A sample size of 265 patients was collected and interviewed through a questionnaire who were observed having type-II diabetes. A questionnaire was designed to record these patients’ responses. The questionnaire contained sub-categorizes, such as participants characteristics, lifestyle, and comorbidities associated with the disease. The findings indicated that the mean BMI was 25.62 in the studied cohort. However, 78% of the patients had a family history of diabetes. Moreover, 76% of the participants were reported to be non-smokers and 75.67% of the participants reported atypical features associated with this disease. It was also observed that 13 % of the patients with low BMI (less than 18.5) had gastrointestinal diseases and 14.72% of the patients with a BMI greater than 18.5 but less than 25 had hypertension, and 8.30 % of the patients with more than 30 BMI also had hypertension. High BMI was found to be a major risk factor associated with type-II diabetes in this study population. The patients observed with high BMI were also more prone towards comorbidities associated with this disease. However, data suggested that most of the patients had familial type-II diabetes.

NIMA-related kinase 7 (NEK7) and phosphoprotein phosphatase-1 catalytic subunit alpha (PPP1CA) are the most common proteins overexpressed in pancreatic ductal adenocarcinoma, which is the most common type of pancreatic cancer. The goal of the current study was to identify a possible NEK7 and PPP1CA therapeutic inhibitor. For this investigation, 5000 compounds were retrieved from the IMPPAT library of phytochemicals, which were docked with our respective target proteins. Also, a reference compound, gemcitabine, which is a Food and Drug Administration (FDA) approved drug, was docked with the target proteins. The binding energy of the reference compound for both the targeted proteins was −6.5 kcal/mol. The common ligand with the lowest binding energy for both targets is boeravinone B (PubChem ID: 14018348) with −9.2 kcal/mol of NEK7 and −7.6 kcal/mol for PPP1CA. The compound was further investigated through density function theory (DFT) and molecular dynamic simulation analysis. The root mean square deviation (RMSD), root mean square fluctuation (RMSF), radius of gyration (Rg), and hydrogen bonding analysis indicated the stability of the boeravinone B with the target proteins (NEK7 and PPP1CA).

Coronavirus disease 19 (COVID-19) severity data is highly variable and many factors were linked to increased severity. Owing to the dense population, varied demographic characteristics, and high burden of various diseases, it is important to identify risk factors resulting in severe COVID-19 in Pakistan. It was a descriptive study, and 652 COVID-19-positive patients were enrolled from Mayo Hospital Lahore and grouped into mild and severe cases. Demographic, clinical history and laboratory findings at the time of admission were collected. Data were analyzed using SPSS V21. The results indicated that the patients with age above 30 years showed a significant association with disease severity and with increasing every 10 years, the odds of disease severity became double. Further, male gender (OR 1.729, p 0.002), low socioeconomic status (OR 4.01, p <0.0001), diabetes mellitus (OR 2.52, p 0.001), hypertension (OR 1.81, p 0.01) and heart attack (OR 2.05, p 0.02) were significantly increasing disease severity. Interestingly, malarial history and smoking showed a significant association with a milder form of the disease. We conclude that young people (30 and above) were at significant risk of severe COVID-19 infection. Similarly, diabetes mellitus, hypertension and cardiovascular diseases were identified as independent risk factors for COVID-19 severity in Pakistan.

The Human Leukocyte Antigen (HLA) system, a set of highly polymorphic genes, has been found to play an effective role in the disease resistance and disease susceptibility. In this study, prevalence of class-I alleles of HLA was characterized at HLAA,- B and -C loci in the 216 individuals randomly selected population at different regions of Punjab province of Pakistan. The study revealed that at HLA-A locus the allele 11 was most prevalent with 16.7 % frequency. Similarly, at HLA-B locus the allele 51 was found abundant with 15% frequency and at HLA-C locus the allele 7 was prevalent with 24% frequency. Among the two-locus HLA class I haplotypes, B*08/C*07 was found to be the most prevalent followed by B*35/C*04. Surprisingly, HLA-B*29 and HLA-B*36 alleles were found in the Punjabi population which is contrary to the previous reports.

Tuberculosis, being one of the top 10 death causing diseases worldwide, is still widespread in developing countries. Pakistan is currently ranked fifth among the high tuberculosis burden countries and 5 % of the total patients worldwide are from this country. The study was conducted on 633 tuberculosis patients involving both pulmonary and extrapulmonary tuberculosis from Punjab population of Pakistan. Male to female ratio was found to be 0.96 in this population. Most of the individuals infected from this disease were found to be of age group 15-34 where 38.38% males and 46.43% females were infected. Among pulmonary tuberculosis, age group <15 was most infected with 31.11% males and 39.84% females while among extra pulmonary tuberculosis age group 15-34 was found most infected with 51.53% males and 56.31% females. Significant difference in MFR and age groups prevalence of this disease was noted when compares with neighbor countries India and Iran.