Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1), the cause of human acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), is a zoonotic infection of staggering proportions and social impact. Yet uncertainty persists regarding its natural reservoir. The virus most closely related to HIV-1 is a simian immunodeficiency virus (SIV) thus far identified only in captive members of the chimpanzee subspecies Pan troglodytes troglodytes . Here we report the detection of SIVcpz antibodies and nucleic acids in fecal samples from wild-living P. t. troglodytes apes in southern Cameroon, where prevalence rates in some communities reached 29 to 35%. By sequence analysis of endemic SIVcpz strains, we could trace the origins of pandemic (group M) and nonpandemic (group N) HIV-1 to distinct, geographically isolated chimpanzee communities. These findings establish P. t. troglodytes as a natural reservoir of HIV-1.

Bullous pemphigoid is the most common autoimmune blistering skin disease of the elderly. Because elderly people have low tolerance for standard regimens of oral corticosteroids, we studied whether highly potent topical corticosteroids could decrease mortality while controlling disease.

High doses of corticosteroids are considered the standard treatment for pemphigus. Because long-term corticosteroid treatment can cause severe and even life-threatening side-effects in patients with this disease, we assessed whether first-line use of rituximab as adjuvant therapy could improve the proportion of patients achieving complete remission off-therapy, compared with corticosteroid treatment alone, while decreasing treatment side-effects of corticosteroids.We did a prospective, multicentre, parallel-group, open-label, randomised trial in 25 dermatology hospital departments in France (Ritux 3). Eligible participants were patients with newly diagnosed pemphigus aged 18-80 years being treated for the first time (not at the time of a relapse). We randomly assigned participants (1:1) to receive either oral prednisone alone, 1·0 or 1·5 mg/kg per day tapered over 12 or 18 months (prednisone alone group), or 1000 mg of intravenous rituximab on days 0 and 14, and 500 mg at months 12 and 18, combined with a short-term prednisone regimen, 0·5 or 1·0 mg/kg per day tapered over 3 or 6 months (rituximab plus short-term prednisone group). Follow-up was for 3 years (study visits were scheduled weekly during the first month of the study, then monthly until month 24, then an additional visit at month 36). Treatment was assigned through central computer-generated randomisation, with stratification according to disease-severity (severe or moderate, based on Harman's criteria). The primary endpoint was the proportion of patients who achieved complete remission off-therapy at month 24 (intention-to-treat analysis). This study is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT00784589.Between May 10, 2010, and Dec 7, 2012, we enrolled 91 patients and randomly assigned 90 to treatment (90 were analysed; 1 patient withdrew consent before the random assignment). At month 24, 41 (89%) of 46 patients assigned to rituximab plus short-term prednisone were in complete remission off-therapy versus 15 (34%) of 44 assigned to prednisone alone (absolute difference 55 percentage points, 95% CI 38·4-71·7; p<0·0001. This difference corresponded to a relative risk of success of 2·61 (95% CI 1·71-3·99, p<0·0001), corresponding to 1·82 patients (95% CI 1·39-2·60) who would need to be treated with rituximab plus prednisone (rather than prednisone alone) for one additional success. No patient died during the study. More severe adverse events of grade 3-4 were reported in the prednisone-alone group (53 events in 29 patients; mean 1·20 [SD 1·25]) than in the rituximab plus prednisone group (27 events in 16 patients; mean 0·59 [1·15]; p=0·0021). The most common of these events in both groups were diabetes and endocrine disorder (11 [21%] with prednisone alone vs six [22%] with rituximab plus prednisone), myopathy (ten [19%] vs three [11%]), and bone disorders (five [9%] vs five [19%]).Data from our trial suggest that first-line use of rituximab plus short-term prednisone for patients with pemphigus is more effective than using prednisone alone, with fewer adverse events.French Ministry of Health, French Society of Dermatology, Roche.

Plasmodium falciparum is the most prevalent and lethal of the malaria parasites infecting humans, yet the origin and evolutionary history of this important pathogen remain controversial. Here we develop a single-genome amplification strategy to identify and characterize Plasmodium spp. DNA sequences in faecal samples from wild-living apes. Among nearly 3,000 specimens collected from field sites throughout central Africa, we found Plasmodium infection in chimpanzees (Pan troglodytes) and western gorillas (Gorilla gorilla), but not in eastern gorillas (Gorilla beringei) or bonobos (Pan paniscus). Ape plasmodial infections were highly prevalent, widely distributed and almost always made up of mixed parasite species. Analysis of more than 1,100 mitochondrial, apicoplast and nuclear gene sequences from chimpanzees and gorillas revealed that 99% grouped within one of six host-specific lineages representing distinct Plasmodium species within the subgenus Laverania. One of these from western gorillas comprised parasites that were nearly identical to P. falciparum. In phylogenetic analyses of full-length mitochondrial sequences, human P. falciparum formed a monophyletic lineage within the gorilla parasite radiation. These findings indicate that P. falciparum is of gorilla origin and not of chimpanzee, bonobo or ancient human origin.

Chimpanzees (Pan troglodytes troglodytes) from west central Africa are recognized as the reservoir of simian immunodeficiency viruses (SIVcpzPtt) that have crossed at least twice to humans: this resulted in the AIDS pandemic (from human immunodeficiency virus HIV-1 group M) in one instance and infection of just a few individuals in Cameroon (by HIV-1 group N) in another. A third HIV-1 lineage (group O) from west central Africa also falls within the SIVcpzPtt radiation, but the primate reservoir of this virus has not been identified. Here we report the discovery of HIV-1 group O-like viruses in wild gorillas.

An efavirenz-based regimen (with a 600-mg dose of efavirenz, known as EFV600) was the World Health Organization preferred first-line treatment for human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection until June 2018. Given concerns about side effects, dolutegravir-based and low-dose efavirenz–based combinations have been considered as first-line treatments for HIV-1 in resource-limited settings.

Abstract Outbreaks of monkeypox (mpox) have historically resulted from zoonotic spillover of clade I monkeypox virus (MPXV) in Central Africa and clade II MPXV in West Africa. In 2022, subclade IIb caused a global epidemic linked to transmission through sexual contact. Here we describe the epidemiological and genomic features of an mpox outbreak in a mining region in eastern Democratic Republic of the Congo, caused by clade I MPXV. Surveillance data collected between September 2023 and January 2024 identified 241 suspected cases. Genomic analysis demonstrates a distinct clade I lineage divergent from previously circulating strains in the Democratic Republic of the Congo. Of the 108 polymerase chain reaction-confirmed mpox cases, the median age of individuals was 22 years, 51.9% were female and 29% were sex workers, suggesting a potential role for sexual transmission. The predominance of APOBEC3-type mutations and the estimated emergence time around mid-September 2023 imply recent sustained human-to-human transmission.

Abstract Extra-intestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC), a predominant Gram-negative bacterial pathogen, express a wide range of virulence factors and is responsible of several diseases including urinary tract infections (UTI), nosocomial pneumonia, bacteremia, and neonatal meningitis. ExPEC isolates are often multidrug resistant (MDR) and clones producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) are increasingly reported all over the world. Seventy-eight clinical ExPEC strains were selected for this study. The majority was from UTIs (n=51), while the rest (n=27) was from pus, sputum, bronchial fluid and vaginal samples (non-uropathogenic ExPEC). Interestingly, 49 out of the 78 ExPEC isolates where considered as community-acquired (CA) and 29 hospital-acquired (HA) bacteria. Antibiotic susceptibility testing was performed using the Kirby-Bauer disc diffusion method. Standard polymerase chain reaction (PCR) was used to screen major ESBL genes ( bla CTX-M , bla OXA-1 , bla TEM , bla SHV ) and blaCTX-M variants ( bla CTX-M-1 , bla CTX-M-9 , bla CTX-M-15 , bla CTX-M-25 ). All the ExPEC strains were resistant to ampicillin, ticarcillin, amoxicillin/clavulanic acid combination, cefalotin, cefotaxime, ceftazidime, cefepime and aztreonam, but showed a high susceptibity to fosfomycin (98.7%, n = 77), ertapenem (96.2%, n = 75), and imipenem (100%). Moreover, isolates harbored at least one ESBL gene, including bla CTX-M (98.7%), bla OXA-1 (78.2%), bla TEM (44.9%) and bla SHV (3.8%). The CTX-M variants were also found with the predominance of bla CTX-M-1 (90.9%) and bla CTX-M-15 (90.9%) followed by bla CTX-M-9 (11.7%), while bla CTX-M-25 was not detected. Despite the resistance to most of the tested antibiotics, ExPEC isolates showed fortunately a good susceptibility to fosfomycin and carbapenems. bla CTX-M ( bla CTX-M1 , bla CTX-M15 ) and bla OXA-1 seem to be E. coli major ESBL genes circulating in Senegal. No significant difference was noted when comparing prevalence of ESBL genes detected from CA and HA strains, and from UPEC and non-uropathogenic ExPEC. The high level of resistance to antimicrobials observed stresses the need of establishing an epidemiological surveillance of antimicrobial resistance in both community and hospital settings.