This cross-sectional study examines the knowledge, perception, and practice of health professions students and academics in Jordan concerning halal pharmaceuticals. Health professions students and academics from various universities in Jordan were surveyed using a structured questionnaire. Data analysis included descriptive statistics and inferential tests to identify factors affecting knowledge, perception, and practice. Participants had a high level of awareness regarding general halal and haram concepts, but there was relatively lower awareness of the term “halal pharmaceuticals” and detailed information about non-halal ingredients. Knowledge scores varied between students and academics, with academics scoring higher. Participants exhibited positive perceptions, acknowledging the importance of knowledge about halal pharmaceuticals and patients’ rights to inquire about medication sources and ingredients. Concerns were raised about the potential controversy surrounding the topic. This research contributes to understanding the role of halal pharmaceuticals in healthcare, particularly in predominantly Muslim countries. The findings highlight the importance of integrating education on halal pharmaceuticals into healthcare curricula, emphasizing patient-centered care, and addressing cultural and religious sensitivity. There is a need for tailored educational approaches and sensitivity training to bridge the gap between knowledge and practice.