TM
Terry McGenity
Author with expertise in Marine Microbial Diversity and Biogeography
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
643
h-index:
55
/
i10-index:
109
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Marine crude-oil biodegradation: a central role for interspecies interactions

Terry McGenity et al.Jan 1, 2012
The marine environment is highly susceptible to pollution by petroleum, and so it is important to understand how microorganisms degrade hydrocarbons, and thereby mitigate ecosystem damage. Our understanding about the ecology, physiology, biochemistry and genetics of oil-degrading bacteria and fungi has increased greatly in recent decades; however, individual populations of microbes do not function alone in nature. The diverse array of hydrocarbons present in crude oil requires resource partitioning by microbial populations, and microbial modification of oil components and the surrounding environment will lead to temporal succession. But even when just one type of hydrocarbon is present, a network of direct and indirect interactions within and between species is observed. In this review we consider competition for resources, but focus on some of the key cooperative interactions: consumption of metabolites, biosurfactant production, provision of oxygen and fixed nitrogen. The emphasis is largely on aerobic processes, and especially interactions between bacteria, fungi and microalgae. The self-construction of a functioning community is central to microbial success, and learning how such "microbial modules" interact will be pivotal to enhancing biotechnological processes, including the bioremediation of hydrocarbons.
0
Citation366
0
Save
0

Is there a common water-activity limit for the three domains of life?

Andrew Stevenson et al.Dec 12, 2014
Abstract Archaea and Bacteria constitute a majority of life systems on Earth but have long been considered inferior to Eukarya in terms of solute tolerance. Whereas the most halophilic prokaryotes are known for an ability to multiply at saturated NaCl (water activity (aw) 0.755) some xerophilic fungi can germinate, usually at high-sugar concentrations, at values as low as 0.650–0.605 aw. Here, we present evidence that halophilic prokayotes can grow down to water activities of &lt;0.755 for Halanaerobium lacusrosei (0.748), Halobacterium strain 004.1 (0.728), Halobacterium sp. NRC-1 and Halococcus morrhuae (0.717), Haloquadratum walsbyi (0.709), Halococcus salifodinae (0.693), Halobacterium noricense (0.687), Natrinema pallidum (0.681) and haloarchaeal strains GN-2 and GN-5 (0.635 aw). Furthermore, extrapolation of growth curves (prone to giving conservative estimates) indicated theoretical minima down to 0.611 aw for extreme, obligately halophilic Archaea and Bacteria. These were compared with minima for the most solute-tolerant Bacteria in high-sugar (or other non-saline) media (Mycobacterium spp., Tetragenococcus halophilus, Saccharibacter floricola, Staphylococcus aureus and so on) and eukaryotic microbes in saline (Wallemia spp., Basipetospora halophila, Dunaliella spp. and so on) and high-sugar substrates (for example, Xeromyces bisporus, Zygosaccharomyces rouxii, Aspergillus and Eurotium spp.). We also manipulated the balance of chaotropic and kosmotropic stressors for the extreme, xerophilic fungi Aspergillus penicilloides and X. bisporus and, via this approach, their established water-activity limits for mycelial growth (∼0.65) were reduced to 0.640. Furthermore, extrapolations indicated theoretical limits of 0.632 and 0.636 aw for A. penicilloides and X. bisporus, respectively. Collectively, these findings suggest that there is a common water-activity limit that is determined by physicochemical constraints for the three domains of life.
0
Citation272
0
Save
1

A concept for international societally relevant microbiology education and microbiology knowledge promulgation in society

Kenneth Timmis et al.May 1, 2024
Executive summary Microbes are all pervasive in their distribution and influence on the functioning and well‐being of humans, life in general and the planet. Microbially‐based technologies contribute hugely to the supply of important goods and services we depend upon, such as the provision of food, medicines and clean water. They also offer mechanisms and strategies to mitigate and solve a wide range of problems and crises facing humanity at all levels, including those encapsulated in the sustainable development goals (SDGs) formulated by the United Nations. For example, microbial technologies can contribute in multiple ways to decarbonisation and hence confronting global warming, provide sanitation and clean water to the billions of people lacking them, improve soil fertility and hence food production and develop vaccines and other medicines to reduce and in some cases eliminate deadly infections. They are the foundation of biotechnology, an increasingly important and growing business sector and source of employment, and the centre of the bioeconomy , Green Deal , etc. But, because microbes are largely invisible, they are not familiar to most people, so opportunities they offer to effectively prevent and solve problems are often missed by decision‐makers, with the negative consequences this entrains. To correct this lack of vital knowledge, the International Microbiology Literacy Initiative–the IMiLI–is recruiting from the global microbiology community and making freely available, teaching resources for a curriculum in societally relevant microbiology that can be used at all levels of learning. Its goal is the development of a society that is literate in relevant microbiology and, as a consequence, able to take full advantage of the potential of microbes and minimise the consequences of their negative activities. In addition to teaching about microbes, almost every lesson discusses the influence they have on sustainability and the SDGs and their ability to solve pressing problems of societal inequalities. The curriculum thus teaches about sustainability, societal needs and global citizenship. The lessons also reveal the impacts microbes and their activities have on our daily lives at the personal, family, community, national and global levels and their relevance for decisions at all levels. And, because effective, evidence‐based decisions require not only relevant information but also critical and systems thinking, the resources also teach about these key generic aspects of deliberation. The IMiLI teaching resources are learner‐centric, not academic microbiology‐centric and deal with the microbiology of everyday issues. These span topics as diverse as owning and caring for a companion animal, the vast range of everyday foods that are produced via microbial processes, impressive geological formations created by microbes, childhood illnesses and how they are managed and how to reduce waste and pollution. They also leverage the exceptional excitement of exploration and discovery that typifies much progress in microbiology to capture the interest, inspire and motivate educators and learners alike. The IMiLI is establishing Regional Centres to translate the teaching resources into regional languages and adapt them to regional cultures, and to promote their use and assist educators employing them. Two of these are now operational. The Regional Centres constitute the interface between resource creators and educators–learners. As such, they will collect and analyse feedback from the end‐users and transmit this to the resource creators so that teaching materials can be improved and refined, and new resources added in response to demand: educators and learners will thereby be directly involved in evolution of the teaching resources. The interactions between educators–learners and resource creators mediated by the Regional Centres will establish dynamic and synergistic relationships–a global societally relevant microbiology education ecosystem–in which creators also become learners, teaching resources are optimised and all players/stakeholders are empowered and their motivation increased. The IMiLI concept thus embraces the principle of teaching societally relevant microbiology embedded in the wider context of societal, biosphere and planetary needs, inequalities, the range of crises that confront us and the need for improved decisioning, which should ultimately lead to better citizenship and a humanity that is more sustainable and resilient. Abstract The biosphere of planet Earth is a microbial world: a vast reactor of countless microbially driven chemical transformations and energy transfers that push and pull many planetary geochemical processes, including the cycling of the elements of life, mitigate or amplify climate change (e.g., Nature Reviews Microbiology, 2019, 17, 569) and impact the well‐being and activities of all organisms, including humans. Microbes are both our ancestors and creators of the planetary chemistry that allowed us to evolve (e.g., Life's engines: How microbes made earth habitable, 2023). To understand how the biosphere functions, how humans can influence its development and live more sustainably with the other organisms sharing it, we need to understand the microbes. In a recent editorial (Environmental Microbiology, 2019, 21, 1513), we advocated for improved microbiology literacy in society. Our concept of microbiology literacy is not based on knowledge of the academic subject of microbiology, with its multitude of component topics, plus the growing number of additional topics from other disciplines that become vitally important elements of current microbiology. Rather it is focused on microbial activities that impact us–individuals/communities/nations/the human world–and the biosphere and that are key to reaching informed decisions on a multitude of issues that regularly confront us, ranging from personal issues to crises of global importance. In other words, it is knowledge and understanding essential for adulthood and the transition to it, knowledge and understanding that must be acquired early in life in school. The 2019 Editorial marked the launch of the International Microbiology Literacy Initiative, the IMiLI. Here, we present our concept of how microbiology literacy may be achieved and the rationale underpinning it; the type of teaching resources being created to realise the concept and the framing of microbial activities treated in these resources in the context of sustainability, societal needs and responsibilities and decision‐making; and the key role of Regional Centres that will translate the teaching resources into local languages, adapt them according to local cultural needs, interface with regional educators and develop and serve as hubs of microbiology literacy education networks. The topics featuring in teaching resources are learner‐centric and have been selected for their inherent relevance, interest and ability to excite and engage. Importantly, the resources coherently integrate and emphasise the overarching issues of sustainability, stewardship and critical thinking and the pervasive interdependencies of processes. More broadly, the concept emphasises how the multifarious applications of microbial activities can be leveraged to promote human/animal, plant, environmental and planetary health, improve social equity, alleviate humanitarian deficits and causes of conflicts among peoples and increase understanding between peoples (Microbial Biotechnology, 2023, 16(6), 1091–1111). Importantly, although the primary target of the freely available (CC BY‐NC 4.0) IMiLI teaching resources is schoolchildren and their educators, they and the teaching philosophy are intended for all ages, abilities and cultural spectra of learners worldwide: in university education, lifelong learning, curiosity‐driven, web‐based knowledge acquisition and public outreach. The IMiLI teaching resources aim to promote development of a global microbiology education ecosystem that democratises microbiology knowledge.
1
Paper
Citation5
0
Save