The transcriptional coactivator Yes-associated protein (YAP) is a major regulator of organ size and proliferation in vertebrates. As such, YAP can act as an oncogene in several tissue types if its activity is increased aberrantly. Although no activating mutations in the yap1 gene have been identified in human cancer, yap1 is located on the 11q22 amplicon, which is amplified in several human tumors. In addition, mutations or epigenetic silencing of members of the Hippo pathway, which represses YAP function, have been identified in human cancers. Here we demonstrate that, in addition to increasing tumor growth, increased YAP activity is potently prometastatic in breast cancer and melanoma cells. Using a Luminex-based approach to multiplex in vivo assays, we determined that the domain of YAP that interacts with the TEAD/TEF family of transcription factors but not the WW domains or PDZ-binding motif, is essential for YAP-mediated tumor growth and metastasis. We further demonstrate that, through its TEAD-interaction domain, YAP enhances multiple processes known to be important for tumor progression and metastasis, including cellular proliferation, transformation, migration, and invasion. Finally, we found that the metastatic potential of breast cancer and melanoma cells is strongly correlated with increased TEAD transcriptional activity. Together, our results suggest that increased YAP/TEAD activity plays a causal role in cancer progression and metastasis.

Hermit crabs hide into shells when confronted with potential dangers, including images presented on a monitor. We do not know, however, what hermit crabs can see and how they perceive different objects. We examined the hiding response of the Caribbean hermit crab (Coenobita clypeatus) to various stimuli presented on a monitor in seven experiments to explore whether crabs could discriminate different properties of a threatening digital image, including color, brightness, contrast, shape and orientation. We found crabs responded differently to expanding circles presented in wavelengths of light corresponding to what humans see as red, blue, and green. "Blue" stimuli elicited the strongest hiding response (Experiments 1, 2, & 7). "Blue" was also more effective than a gray stimulus of similar brightness (Experiment 3). Hermit crabs were sensitive to the amount of contrast between a stimulus and its background rather than absolute brightness of the stimulus (Experiment 4). Moreover, we did not find evidence that crabs could discriminate orientation (Experiment 6), and mixed evidence that they could discriminate stimulus shape (Experiments 5 & 7). These results suggest that the Caribbean hermit crab is sensitive to color features, but not spatial features, of a threatening object presented on a computer screen. This is the first study to use the hiding response of the hermit crab to examine its visual ability, and demonstrates that the hiding response provides a useful behavioral approach with which to study learning and discrimination in the hermit crab.

Amid an unprecedented loss of biodiversity, a pressing issue is how to improve the efficiency of conservation with limited resources and information. Collecting data on species with a small population is costly and time consuming, and many high-stakes decisions need to be made based on limited data. We develop a partially observable Markov decision processes model with unknown parameters to jointly optimize the information collection and protection efforts for threatened species. The model takes into account uncertainties about the state, detectability, and dynamics of the species, and it adaptively adjusts the efforts of surveying and protection in real time. Although the standard formulation is intractable, we exploit the structure of ecological problems to identify a hybrid belief state in low dimensions, and we reformulate the stochastic dynamic program as a piecewise deterministic optimal control problem. This enables us to obtain structural insights into the optimal policy (some are in closed form) and find a near-optimal approximate policy with performance guarantee. In certain situations, areas where the species has never been found may be more likely to contain the species than areas where it has been previously found. We also conduct a case study on the conservation of the Hainan gibbon, the rarest primate species, in which we extend the model to optimize the spatiotemporal allocation of limited resources. This paper was accepted by Chung Piaw Teo, optimization. Funding: This work was supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada [Grant RGPIN-2019-05671]. Supplemental Material: The online appendix and data files are available at https://doi.org/10.1287/mnsc.2023.01753 .

Background: General control nonderepressible 5 (Gcn5) is a lysine acetyltransferase (KAT) that is evolutionarily conserved across eukaryotes, with two homologs (Kat2a and Kat2b) identified in humans and one (Gcn5) in Drosophila. Gcn5 contains a P300/CBP-associated factor (PCAF) domain, a Gcn5-N-acetyltransferase (GNAT) domain, and a Bromodomain, allowing it to regulate gene expression through the acetylation of both histone and non-histone proteins. In Drosophila, Gcn5 is crucial for embryonic development, with maternal Gcn5 supporting early development. However, the functional mechanisms of Gcn5 after the depletion of maternal deposits remain unclear. Methods: Our study employed the Gal4/UAS-RNAi system to achieve whole-body or heart-specific Gcn5 knockdown in Drosophila and selected 96-hour-old surviving larvae for transcriptomic and metabolomic analyses. Results: Omics results revealed that Gcn5 knockdown significantly impacts various metabolic pathways, as well as lysosomes, non-homologous end-joining, Toll and Imd signaling pathways, and circadian rhythms, among others. Furthermore, defects in chitin synthesis may be associated with impaired pupation. Additionally, heart-specific Gcn5 knockdown affected cardiac physiology but appeared to have a potential protective effect against age-related cardiac decline. Conclusions: These findings deepen our understanding of Gcn5’s roles in Drosophila development and provide valuable insights for developing Gcn5-targeted therapies, particularly considering its involvement in various human diseases.

Pygopus (Pygo) has been identified as a specific nuclear co-activator of the canonical Wingless (Wg)/Wnt signaling pathway in Drosophila melanogaster. Pygo proteins consist of two conserved domains: an N-terminal homologous domain (NHD) and a C-terminal plant homologous domain (PHD). The PHD’s ability to bind to di- and trimethylated lysine 4 of histone H3 (H3K4me2/3) appears to be independent of Wnt signaling. There is ongoing debate regarding the significance of Pygo’s histone-binding capacity. Drosophila Pygo orthologs have a tryptophan (W) > phenylalanine (F) substitution in their histone pocket-divider compared to vertebrates, leading to reduced histone affinity. In this research, we utilized CRISPR/Cas9 technology to introduce the Pygo-F773W point mutation in Drosophila, successfully establishing a viable homozygous Pygo mutant line for the first time. Adult mutant flies displayed noticeable abnormalities in reproduction, locomotion, heart function, and lifespan. RNA-seq and cluster analysis indicated that the mutation primarily affected pathways related to immunity, metabolism, and posttranslational modification in adult flies rather than the Wnt signaling pathway. Additionally, a reduction in H3K9 acetylation levels during the embryonic stage was observed in the mutant strains. These findings support the notion that Pygo plays a wider role in chromatin remodeling, with its involvement in Wnt signaling representing only a specific aspect of its chromatin-related functions.