Abstract Background and Aims Surgical explantation of transcatheter heart valves (THVs) is rapidly increasing, but there are limited data on patients with THV-associated infective endocarditis (IE). This study aims to assess the outcomes of patients undergoing THV explant for IE. Methods All patients who underwent THV explant between 2011 and 2022 from 44 sites in the EXPLANT-TAVR registry were identified. Patients with IE as the reason for THV explant were compared to those with other mechanisms of bioprosthetic valve dysfunction (BVD). Results A total of 372 patients from the EXPLANT-TAVR registry were included. Among them, 184 (49.5%) patients underwent THV explant due to IE and 188 (50.5%) patients due to BVD. At the index transcatheter aortic valve replacement, patients undergoing THV explant for IE were older (74.3 ± 8.6 vs. 71 ± 10.6 years) and had a lower Society of Thoracic Surgeons risk score [2.6% (1.8–5.0) vs. 3.3% (2.1–5.6), P = .029] compared to patients with BVD. Compared to BVD, IE patients had longer intensive care unit and hospital stays (P < .05) and higher stroke rates at 30 days (8.6% vs. 2.9%, P = .032) and 1 year (16.2% vs. 5.2%, P = .010). Adjusted in-hospital, 30-day, and 1-year mortality was 12.1%, 16.1%, and 33.8%, respectively, for the entire cohort, with no significant differences between groups. Although mortality was numerically higher in IE patients 3 years postsurgery (29.6% for BVD vs. 43.9% for IE), Kaplan–Meier analysis showed no significant differences between groups (P = .16). Conclusions In the EXPLANT-TAVR registry, patients undergoing THV explant for IE had higher 30-day and 1-year stroke rates and longer intensive care unit and hospital stays. Moreover, patients undergoing THV explant for IE had a higher 3-year mortality rate, which did not reach statistical significance given the relatively small sample size of this unique cohort and the reduced number of events.