PURPOSE To estimate age-specific relative and absolute cancer risks of breast cancer and to estimate risks of ovarian, pancreatic, male breast, prostate, and colorectal cancers associated with germline PALB2 pathogenic variants (PVs) because these risks have not been extensively characterized. METHODS We analyzed data from 524 families with PALB2 PVs from 21 countries. Complex segregation analysis was used to estimate relative risks (RRs; relative to country-specific population incidences) and absolute risks of cancers. The models allowed for residual familial aggregation of breast and ovarian cancer and were adjusted for the family-specific ascertainment schemes. RESULTS We found associations between PALB2 PVs and risk of female breast cancer (RR, 7.18; 95% CI, 5.82 to 8.85; P = 6.5 × 10 −76 ), ovarian cancer (RR, 2.91; 95% CI, 1.40 to 6.04; P = 4.1 × 10 −3 ), pancreatic cancer (RR, 2.37; 95% CI, 1.24 to 4.50; P = 8.7 × 10 −3 ), and male breast cancer (RR, 7.34; 95% CI, 1.28 to 42.18; P = 2.6 × 10 −2 ). There was no evidence for increased risks of prostate or colorectal cancer. The breast cancer RRs declined with age ( P for trend = 2.0 × 10 −3 ). After adjusting for family ascertainment, breast cancer risk estimates on the basis of multiple case families were similar to the estimates from families ascertained through population-based studies ( P for difference = .41). On the basis of the combined data, the estimated risks to age 80 years were 53% (95% CI, 44% to 63%) for female breast cancer, 5% (95% CI, 2% to 10%) for ovarian cancer, 2%-3% (95% CI females, 1% to 4%; 95% CI males, 2% to 5%) for pancreatic cancer, and 1% (95% CI, 0.2% to 5%) for male breast cancer. CONCLUSION These results confirm PALB2 as a major breast cancer susceptibility gene and establish substantial associations between germline PALB2 PVs and ovarian, pancreatic, and male breast cancers. These findings will facilitate incorporation of PALB2 into risk prediction models and optimize the clinical cancer risk management of PALB2 PV carriers.

Germline DNA testing using the next-gene­ration sequencing (NGS) technology has become the analytical standard for the diagnostics of hereditary diseases, including cancer. Its increasing use places high demands on correct sample identification, independent confirmation of prioritized variants, and their functional and clinical interpretation. To streamline these processes, we introduced parallel DNA and RNA capture-based NGS using identical capture panel CZECANCA, which is routinely used for DNA analysis of hereditary cancer predisposition. Here, we present the analytical workflow for RNA sample processing and its analytical and diagnostic performance. Parallel DNA/RNA analysis allowed credible sample identification by calculating the kinship coefficient. The RNA capture-based approach enriched transcriptional targets for the majority of clinically relevant cancer predisposition genes to a degree that allowed analysis of the effect of identified DNA variants on mRNA processing. By comparing the panel and whole-exome RNA enrichment, we demonstrated that the tissue-specific gene expression pattern is independent of the capture panel. Moreover, technical replicates confirmed high reproducibility of the tested RNA analysis. We concluded that parallel DNA/RNA NGS using the identical gene panel is a robust and cost-effective diagnostic strategy. In our setting, it allows routine analysis of 48 DNA/RNA pairs using NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 cycles) in a single run with sufficient coverage to analyse 226 cancer predisposition and candidate ge­nes. This approach can replace laborious Sanger confirmatory sequencing, increase testing turnaround, reduce analysis costs, and improve interpretation of the impact of variants by analysing their effect on mRNA processing.

Abstract RAD18 is an E3 ubiquitin ligase that prevents replication fork collapse by promoting DNA translesion synthesis and template switching. Besides this classical role, RAD18 has been implicated in homologous recombination; however, this function is incompletely understood. Here, we show that RAD18 is recruited to DNA lesions by monoubiquitination of histone H2A at K15 and counteracts accumulation of 53BP1. Super-resolution microscopy revealed that RAD18 localizes to the proximity of DNA double strand breaks and limits the distribution of 53BP1 to the peripheral chromatin nanodomains. Whereas auto-ubiquitination of RAD18 mediated by RAD6 inhibits its recruitment to DNA breaks, interaction with SLF1 promotes RAD18 accumulation at DNA breaks in the post-replicative chromatin by recognition of histone H4K20me0. Surprisingly, suppression of 53BP1 function by RAD18 is not involved in homologous recombination and rather leads to reduction of non-homologous end joining. Instead, we provide evidence that RAD18 promotes HR repair by recruiting the SMC5/6 complex to DNA breaks. Finally, we identified several new loss-of-function mutations in RAD18 in cancer patients suggesting that RAD18 could be involved in cancer development.

Introduction Renal cell carcinoma (RCC) is one of the most prevalent cancers in kidney transplant recipients (KTR). The hereditary background of RCC in native kidneys has been determined, implicating its clinical importance. Materials and methods This retrospective single-center pilot study aimed to identify a potential genetic predisposition to RCC of the transplanted kidney and outcome in KTR who underwent single kidney transplantation between January 2000 and December 2020 and manifested RCC of the transplanted kidney. Next-generation sequencing (NGS) based germline genetic analysis from peripheral blood-derived genomic DNA (gDNA) was performed in both the recipient and donor using a gene panel targeting 226 cancer predisposition genes. Results The calculated incidence of RCC of the transplanted kidney among 4146 KTR was 0.43%. In fifteen KTR and donors, NGS was performed. The mean KTR age at transplantation and the diagnosis of RCC was 50.3 years (median 54; 5–67 years) and 66 years (median 66; 24–79 years), respectively. The mean donor age at transplantation and graft age at RCC diagnosis was 39.7 years (median 42; 7–68 years) and 50.2 years (median 46; 20–83 years), respectively. The mean follow-up after RCC diagnosis was 47 months (median 39.1; 0–112 months). Papillary RCC was the most prevalent (n = 8), followed by clear cell RCC (n = 6) and unspecified RCC (n = 1). Thirteen RCCs were low-stage (pT1a/b) diseases, one was pT3, and one was of unknown stage. Most RCC was higher graded. No germline pathogenic cancer-predisposition variant was found in either KTR or donors except for several variants of uncertain significance. Conclusion RCC of the transplanted kidney is very rare. Germline cancer-predisposition testing has identified several variants of uncertain significance, but no germline genetic predisposition to graft RCC in KTR. Further research is needed to assess the clinical relevance of genetic testing for cancer risk in KTR.