Abstract The recently emerged pathogenic severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has spread rapidly, leading to a global COVID-19 pandemic. Binding of the viral spike protein (SARS-2-S) to cell surface receptor angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) mediates host cell infection. In the present study, we demonstrate that in addition to ACE2, the S1 subunit of SARS-2-S binds to HDL and that SARS-CoV-2 hijacks the SR-B1-mediated HDL uptake pathway to facilitate its entry. SR-B1 facilitates SARS-CoV-2 entry into permissive cells by augmenting virus attachment. MAb (monoclonal antibody)-mediated blocking of SARS-2-S-HDL binding and SR-B1 antagonists strongly inhibit HDL-enhanced SARS-CoV-2 infection. Notably, SR-B1 is co-expressed with ACE2 in human pulmonary and extrapulmonary tissues. These findings revealed a novel mechanism for SARS-CoV-2 entry and could provide a new target to treat SARS-CoV-2 infection.

Abstract Microorganisms in the rhizosphere, particularly arbuscular mycorrhiza, have a broad symbiotic relationship with their host plants. One of the major fungi isolated from the rhizosphere of Peucedanum praeruptorum is Penicillium restrictum . The relationship between the metabolites of P. restrictum and the root exudates of P. praeruptorum is being investigated. The accumulation of metabolites in the mycelium and fermentation broth of P. restrictum was analysed over different fermentation periods. Non‐targeted metabolomics was used to compare the differences in intracellular and extracellular metabolites over six periods. There were significant differences in the content and types of mycelial metabolites during the incubation. Marmesin, an important intermediate in the biosynthesis of coumarins, was found in the highest amount on the fourth day of incubation. The differential metabolites were screened to obtain 799 intracellular and 468 extracellular differential metabolites. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway enrichment analysis showed that the highly enriched extracellular metabolic pathways were alanine, aspartate and glutamate metabolism, glyoxylate and dicarboxylate metabolism, and terpenoid backbone biosynthesis. In addition, the enrichment analysis associated with intracellular and extracellular ATP‐binding cassette transporter proteins revealed that some ATP‐binding cassette transporters may be involved in the transportation of certain amino acids and carbohydrates. Our results provide some theoretical basis for the regulatory mechanisms between the rhizosphere and the host plant and pave the way for the heterologous production of furanocoumarin.

Abstract Viral zoonoses are a serious threat to public health and global security, as reflected by the current scenario of the growing number of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) cases. However, as pathogenic viruses are highly diverse, identification of their host ranges remains a major challenge. Here, we present a combined computational and experimental framework, called REceptor ortholog-based POtential virus hoST prediction (REPOST), for the prediction of potential virus hosts. REPOST first selects orthologs from a diverse species by identity and phylogenetic analyses. Secondly, these orthologs is classified preliminarily as permissive or non-permissive type by infection experiments. Then, key residues are identified by comparing permissive and non-permissive orthologs. Finally, potential virus hosts are predicted by a key residue–specific weighted module. We performed REPOST on SARS-CoV-2 by studying angiotensin-converting enzyme 2 orthologs from 287 vertebrate animals. REPOST efficiently narrowed the range of potential virus host species (with 95.74% accuracy).

Abstract Background Hypospadias with lichen sclerosus (LS) poses surgical challenges due to lack of materials for urethral reconstruction and coverage and the limited number of reports on this clinical condition. Objectives To report surgical strategies and outcomes for primary and redo hypospadias patients with LS. Materials and methods We conducted a retrospective observational descriptive study with 31 patients with primary/redo hypospadias and LS between 2013 and 2023. Of these patients, 9 had primary hypospadias with 7 distal types and 2 proximal types, and 22 were redo patients. Nineteen of the 31 patients underwent various surgical techniques, and 12 underwent the oral mucosa onlay procedure (OMOP). Postoperative uroflowmetry, hypospadias objective scoring evaluation (HOSE), and complications were evaluated. Results For primary distal hypospadias with LS‐affected skin, five patients underwent circumcision; these patients had normal postoperative urinary flow, and only one patient had an inconspicuous penis after surgery. For the patients with primary proximal hypospadias with an LS‐affected urethra, one patient required perineal urethrostomy following a modified Koyanagi procedure for recurrent stricture; the other patient underwent two‐stage transverse preputial island flap urethroplasty with no postoperative lower urinary tract symptoms (LUTS) and satisfactory aesthetic scores. In two remaining cases of primary distal hypospadias with meatus/urethral LS, no LUTS or postoperative complications occurred following meatoplasty/circumcision and penile basal fixation. During reoperations, compared with those of patients who underwent other redo procedures, twelve patients who underwent OMOP had better Qmax and uroflowmetry ( p = 0.002) and higher HOSE scores ( p = 0.01). Conclusions For primary hypospadias patients with LS, enhanced exposure of the penile shaft and glans may benefit distal hypospadias, whereas staged surgery may be suitable for proximal hypospadias. The oral mucosa is favored for urethral augmentation in patients with redo hypospadias complicated with LS, and the OMOP can address neourethra coverage effectively.