Cancer cells frequently depend on chromatin regulatory activities to maintain a malignant phenotype. Here, we show that leukemia cells require the mammalian SWI/SNF chromatin remodeling complex for their survival and aberrant self-renewal potential. While Brg1, an ATPase subunit of SWI/SNF, is known to suppress tumor formation in several cell types, we found that leukemia cells instead rely on Brg1 to support their oncogenic transcriptional program, which includes Myc as one of its key targets. To account for this context-specific function, we identify a cluster of lineage-specific enhancers located 1.7 Mb downstream from Myc that are occupied by SWI/SNF as well as the BET protein Brd4. Brg1 is required at these distal elements to maintain transcription factor occupancy and for long-range chromatin looping interactions with the Myc promoter. Notably, these distal Myc enhancers coincide with a region that is focally amplified in ∼3% of acute myeloid leukemias. Together, these findings define a leukemia maintenance function for SWI/SNF that is linked to enhancer-mediated gene regulation, providing general insights into how cancer cells exploit transcriptional coactivators to maintain oncogenic gene expression programs.

Forced expression of selected transcription factors can transform somatic cells into embryonic stem cell (ESC)-like cells, termed induced pluripotent stem cells (iPSCs). There is no consensus regarding the preferred tissue from which to harvest donor cells for reprogramming into iPSCs, and some donor cell types may be more prone than others to accumulation of epigenetic imprints and somatic cell mutations. Here, we present a simple, reproducible, noninvasive method for generating human iPSCs from renal tubular cells present in urine. This procedure eliminates many problems associated with other protocols, and the resulting iPSCs display an excellent ability to differentiate. These data suggest that urine may be a preferred source for generating iPSCs.

Background Gowing number of studies have demonstrated the association between gut microbiome and T2DM microvascular complications, however the causal relationship remains unclear. Therefore, we using the Mendelian randomization (MR) approach to investigate this causal relation. Methods Using gut microbiome data from the International MiBioGen Consortium genome-wide association study (GWAS) and T2DM microvascular complications data from the FinnGen Consortium GWAS to perform MR analyses. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) were selected as instrumental variables (IVs), the inverse variance weighting (IVW) method was used as the primary analysis method, and the results were tested for heterogeneity and horizontal pleiotropy. Results Our research identified that there are 5 known microbial species and 2 unknown microbial species in the gut microbiome that were causally related to T2DM retinopathy. Besides, three and seven known microbial species causal relationships between the gut microbiome and T2DM neuropathy and T2DM nephropathy, respectively. Conclusions Using MR methods, we demonstrated the causal relationship between gut microbiome and microvascular complications in T2DM, providing a new strategy for the prevention and treatment of it.

Abstract N 6 ‐methyladenosine (m 6 A) is the most prevalent modification in cellular RNA which orchestrates diverse physiological and pathological processes during stress response. However, the differential m 6 A modifications that cope with herbivore stress in resistant and susceptible crop varieties remain unclear. Here, we found that rice stem borer (RSB) larvae grew better on indica rice (e.g., MH63, IR64, Nanjing 11) than on japonica rice varieties (e.g., Nipponbare, Zhonghua 11, Xiushui 11). Then, transcriptome‐wide m 6 A profiling of representative resistant (Nipponbare) and susceptible (MH63) rice varieties were performed using a nanopore direct RNA sequencing approach, to reveal variety‐specific m 6 A modifications against RSB. Upon RSB infestation, m 6 A methylation occurred in actively expressed genes in Nipponbare and MH63, but the number of methylation sites decreased across rice chromosomes. Integrative analysis showed that m 6 A methylation levels were closely associated with transcriptional regulation. Genes involved in herbivorous resistance related to mitogen‐activated protein kinase, jasmonic acid (JA), and terpenoid biosynthesis pathways, as well as JA‐mediated trypsin protease inhibitors, were heavily methylated by m 6 A, and their expression was more pronounced in RSB‐infested Nipponbare than in RSB‐infested MH63, which may have contributed to RSB resistance in Nipponbare. Therefore, dynamics of m 6 A modifications act as the main regulatory strategy for expression of genes involved in plant–insect interactions, which is attributed to differential responses of resistant and susceptible rice varieties to RSB infestation. These findings could contribute to developing molecular breeding strategies for controlling herbivorous pests.

Hexavalent chromium (Cr(VI)) exposure has been linked with gastrointestinal toxicity, whereas the molecular pathways and key targets remain elusive. Computational toxicology analysis predicted the correlation between protein phosphatase 2A (PP2A) and genes regarding Cr(VI)-induced intestinal injury. Here, we generated a mouse model with intestinal epithelium-specific knock-out of Ppp2r1a (encoding PP2A Aα subunit) to investigate the mechanisms underlying Cr(VI)-induced small intestinal toxicity. Heterozygous mice (HE) and matched wild-type (WT) littermates were administrated with Cr(VI) at 0, 5, 20, 80 mg/L for 28 successive days. Cr(VI) treatment led to crypt hyperplasia, epithelial cell apoptosis, and intestinal barrier dysfunction, accompanied by the decline of goblet cell counts and Occludin expression in WT mice. Notably, these effects were aggravated in HE mice, indicating that PP2A Aα deficiency conferred mice with susceptibility to Cr(VI)-induced intestinal injury. Integrated data analysis and biological experiments revealed Cr(VI) exposure could decrease YAP1 phosphorylation at Ser127 but increase protein expression and activity, together with elevated TAZ protein driving epithelial crypt cells proliferation following damage, suggesting the involvement of Hippo/YAP1 signaling pathway in Cr(VI)-induced intestinal toxicity. Nevertheless, the enhanced phosphorylation of YAP1 in HE mice resulted in proliferation/repair defects in intestinal epithelium, thereby exacerbating Cr(VI)-induced gut barrier dysfunction. Notably, by molecular docking and further studies, we identified Urolithin A, a microbial metabolite, attenuated Cr(VI)-induced disruption of intestinal barrier function, partly by modulating YAP1 expression and activity. Our findings reveal the novel molecular pathways participated in Cr(VI)-caused small intestinal injury and urolithin A could potentially protect against environmental hazards-induced intestinal diseases.

Magnaporthe oryzae, one of the most destructive rice pathogens, causes significant losses during the rice harvest every year. Bacillus amyloliquefaciens has been explored in many crops as a potential biocontrol agent. However, the mechanisms of B. amyloliquefaciens controled rice blast are not fully understood. Here, a biocontrol strain LM-1, isolated from a contaminated medium, was identified as B. amyloliquefaciens using morphological observation, physiological and biochemical tests, and 16S rDNA sequencing. LM-1 inhibited the growth and pathogenicity of M. oryzae and Bipolaris oryzae (Breda de Haan) Shoem. The mycelia of M. oryzae co-cultured with LM-1 were enlarged and broken by fluorescence microscopy using calcofluor white. LM-1 inhibited the mycelia of M. oryzae from producing conidia. Genes itu, srf, and fenB were detected in LM-1. Furthermore, the supernatant of LM-1 interfered with the appressorium formation of M. oryzae, blocked conidial cell death, and reduced autophagy degradation but did not affect the normal germination of rice seeds and seeding growth. Additionally, we observed hypersensitivity reactions, reactive oxygen species, and iron accumulation reduction in rice cells inoculated with supernatant. Our study reveals that LM-1 has a control effect on rice blast and affects cell wall integrity, sporulation, appressorium formation, cell death, and autophagy.

To date, previous research has elucidated the impact of adult attachment type on marital relationships. However, the mechanisms underpinning the relationship between attachment type and marital adjustment in breast cancer patients remain unclear. In this study, a cohort of 272 breast cancer patients was surveyed using several instruments: the General Information Questionnaire, Revised Marital Adjustment Scale (RDAS), Adult Attachment Scale (AAS), Interpersonal Reactivity Indicator Scale (IRI), and Regulated Emotional Self-Efficacy Scale (RESS). We conducted moderated mediation analyses using the SPSS macro program PROCESS plug-in. Empathy was found to mediate the association between attachment type (attachment anxiety/attachment avoidance) and marital adjustment, with indirect effects of −0.141 (95% CI [−0.260, −0.063]) and 0.157 (95% CI [0.073,0.289]), respectively. Additionally, affect regulation self-efficacy was found to mediate the subsequent impact of attachment type (attachment anxiety/attachment avoidance) on marital adjustment via empathy, with moderated effects of 0.380 (95% CI [0.236, 0.525]) and 0.374 (95% CI [0.240, 0.509]), respectively. Consequently, the presence of insecure attachment in breast cancer patients appears to influence their empathy levels, thereby negatively impacting marital adjustment. Encouragingly, enhancing emotional regulation self-efficacy in patients holds the potential to mitigate these adverse effects. These findings contribute not only to a deeper theoretical understanding but also lay a solid foundation for practical interventions aimed at enhancing marital relationships among breast cancer patients.

Objective: The aim of this study is to assess the latent profile types of marital adjustment in patients with breast cancer and to analyze the factors influencing these various profiles. Methods: Patients with breast cancer who visited the Breast Surgery Department from January to June 2023 were selected using convenience sampling. These patients were surveyed using a general data questionnaire, the Revised Dyadic Adjustment Scale (RDAS), the Interpersonal Reactivity Index-C (IRI-C), and the Emotional Regulation Self-Efficacy Scale (RESS). Latent profile analysis (LPA) was used to determine different types of marital adjustment among patients, and influencing factors for the various profiles were identified through univariate analysis and multivariate logistic regression analysis. Results: Marital adjustment in patients with breast cancer was categorized into three latent profiles: the "low marital adjustment-low cohesion group" (20.2%), the "midlevel marital adjustment group" (35.3%), and the "high marital adjustment-satisfaction group" (44.4%). The influencing factors included age, marital status, primary caregiver, type of surgical intervention, empathy, and emotional regulation self-efficacy ( P < 0.05). Conclusion: The marital adjustment levels of patients with breast cancer exhibited significant heterogeneity. Medical staff can implement targeted interventions based on the distinct characteristics of each marital adjustment profile, thereby enhancing the marital adjustment of these patients. Keywords: breast cancer, emotional regulation self-efficacy, empathy, influencing factors, latent profile analysis, marital adjustment