SL
Shi-Lin Li
Author with expertise in Design and Application of Intelligent Monitoring Systems
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(75% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
6
/
i10-index:
4
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

16S rRNA, metagenomics and 2bRAD-M sequencing to decode human thanatomicrobiome

Xiaoxu Huang et al.Jul 6, 2024
Abstract Microorganisms are essential in the decomposition of corpses and play a significant role in forensic science. However, previous studies have primarily focused on animal remains, specifically the gut, skin, and burial environment. Insufficient research has been conducted on the microbiota of human cadavers, especially in cases of advanced decomposition and additional tissues, resulting in a lack of relevant reference data. In this study, the microbiota of eight cadavers at different stages of decomposition were detected using 16S rRNA, metagenomic sequencing and 2bRAD-M sequencing. Nine different sites, including oral and nasal cavities, heart, liver, spleen, lung, kidney, muscle and gut, were analysed and the efficacy of these methods was evaluated. The results showed that 16S rRNA sequencing was the most cost-effective method for the study of cadavers in the early stages of decomposition, whereas for cadaveric tissues in the late stages of decomposition, 2bRAD-M could overcome host contamination more effectively than metagenomic sequencing. This paves the way for new opportunities in data retrieval and promotes in-depth investigations into the microbiota.
0
Citation2
0
Save
0

The Relative Contribution of Root Morphology and Arbuscular Mycorrhizal Fungal Colonization on Phosphorus Uptake in Rice/Soybean Intercropping Under Dry Cultivation

Huimin Ma et al.Jan 2, 2025
Intercropping has the potential to improve phosphorus (P) uptake and crop growth, but the potential benefits and relative contributions of root morphology and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) colonization are largely unknown for the intercropping of rice and soybean under dry cultivation. Both field and pot experiments were conducted with dry-cultivated rice (Oryza sativa L.) and soybean (Glycine max L. Merr.) grown alone or intercropped under two P levels. Two root separation modes between rice and soybean were employed to explore the contribution of AMF association and root plasticity on P uptake in intercrops. The results showed that rice/soybean intercropping resulted in a notable increase in the total biomass and yield compared to monoculture in the field. In the potted experiment, compared to the plastic root separation treatment (PS), the no root separation treatment (NS) increased the total biomass and P uptake by 9.4% and 19.9%, irrespective of the P levels. This was primarily attributable to a considerable enhancement in biomass and phosphorus uptake in soybean by 40.4% and 49.7%, which offset a slight decline in the rice of NS compared to PS by 26.8% and 18.0%, respectively. The results of random forest analysis indicate that the P uptake by the dominant species, soybean, was mainly contributed by root morphology, while rice was more dependent on AMF colonization in the intercropping system. Therefore, dry-cultivated rice/soybean intercropping enhances P uptake and productivity by leveraging complementary belowground strategies, with soybean benefiting primarily from root morphological adjustments and rice relying more on arbuscular mycorrhizal fungi colonization.
0

Why do patients with isolated PCL rupture experience no subjective knee joint instability during walking? An in vivo biomechanical study

Mingfeng Lu et al.Jan 7, 2025
The aim of this study is to assess the kinematic changes in the knee joint during walking in patients with isolated PCL-deficiency (PCLD) to determine the presence of walking-related joint instability (mechanical instability-abnormal displacement form structural damage). Additionally, the study seeks to provide biomechanical insights into the observed differences between subjective and objective assessments. 35 healthy volunteers and 27 patients with isolated PCLD (both involved and uninvolved sides) were included in the study. All participants walked on a treadmill at a self-selected comfortable speed. An optical 3D motion capture system was employed to collect six degrees of freedom kinematic data of the knee joint during walking. Statistical Parametric Mapping (SPM) was employed, using independent and paired t-tests to evaluate differences between the healthy control group and the PCLD group, as well as between the involved and uninvolved sides, respectively. Compared with the healthy control group, posterior tibial displacement (the main indicator for anterior-posterior instability) of the involved limb was significantly decreased during 79%-94%. additionally, knee flexion angles of the involved limb were significantly increased compared with healthy control group during 0%-5% and 95%-99% of the gait cycle and significantly decreased during 66%-87%; In the uninvolved side, adaptive gait changes were observed, with knee flexion angles significantly reduced during 20%-50% and 64%-89% of the gait cycle and posterior tibial displacement significantly reduced during 60%-94% compared with the healthy control group; Compared to the uninvolved limb, the involved limb showed increased internal rotation during 62%-71% of the gait cycle and increased knee flexion during 8%-53%, with no significant differences in other dimensions. From a biomechanical perspective, patients with PCL rupture exhibit no joint instability during walking. Compared to the healthy control group, the involved leg shows a significant reduction in posterior tibial displacement and a diminished range of knee flexion. Clinical evaluations of PCLD should incorporate dynamic functional assessments, thereby providing a more comprehensive basis for treatment decisions.