HM
Hussein Mohamed
Author with expertise in Ecology and Evolution of Viruses in Ecosystems
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(25% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
17
/
i10-index:
25
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Assessment of antimicrobial activity and GC-MS using culture filtrate of local marine Bacillus strains

Shaimaa Ali et al.May 24, 2024
Secondary metabolites produced by Bacillus species from marine sources encompass a variety of compounds such as lipopeptides, isocoumarins, polyketides, macrolactones, polypeptides and fatty acids. These bioactive substances exhibit various biological activities, including antibiotic, antifungal, antiviral, and antitumor properties. This study aimed to isolate and identify a particular species of Bacillus from marine water and organisms that can produce bioactive secondary metabolites. Among the 73 Bacillus isolates collected, only 5 exhibited antagonistic activity against various viral and bacterial pathogens. The active isolates were subjected to 16S rRNA sequencing to determine their taxonomical affiliation. Among them, Bacillus tequilensis CCASU-2024-66 strain no. 42, with the accession number ON 054302 in GenBank, exhibited the highest inhibitory potential. It displayed an inhibition zone of 21 mm against Bacillus cereus while showing a minimum zone of inhibition of 9 mm against Escherichia coli and gave different inhibition against pathogenic fungi, the highest inhibition zone 15 mm against Candida albicans but the lowest inhibition zone 10 mm was against Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum. Furthermore, it demonstrated the highest percentage of virucidal effect against the Newcastle virus and influenza virus, with rates of 98.6% and 98.1%, respectively. Furthermore, GC-MS analysis was employed to examine the bioactive substance components, specifically focusing on volatile and polysaccharide compounds. Based on these results, Bacillus tequilensis strain 42 may have the potential to be employed as an antiviral agent in poultry cultures to combat Newcastle and influenza, two extremely destructive viruses, thus reducing economic losses in the poultry production sector. Bacteria can be harnessed for the purpose of preserving food and controlling pathogenic fungi in both human and plant environments. Molecular docking for the three highly active derivatives 2,3-Butanediol, 2TMS, D-Xylopyranose, 4TMS, and Glucofuranoside, methyl 2,3,5,6-tetrakis-O-(trimethylsilyl) was carried out against the active sites of Bacillus cereus, Listeria monocytogenes, Candida albicans, Newcastle virus and influenza virus. The data obtained from molecular docking is highly correlated with that obtained from biology. Moreover, these highly active compounds exhibited excellent proposed ADMET profile.
0
Citation2
0
Save
0

Quercetin Derivatives from Bidens pilosa Suppressed Cell Proliferation via Inhibition of RSK2 Kinase and Aldose Reductase Enzymes: UPLC-MS/MS, GC–MS, In Vitro, and Computational Studies

Doaa Ali et al.Jan 6, 2025
Abstract Traditionally, Bidens pilosa L. is an edible herb utilized for various ailments. The study accomplished a complete analysis of B. pilosa extract including UPLC/T-TOF–MS/MS, GC–MS, and in vitro antiproliferative activity, in addition to molecular docking on kinase and aldose reductase enzymes. From GC–MS analysis, the percentage of identified unsaturated fatty acids (FAs) (11.38%) was greater than saturated FAs (8.69%), while the sterols percent (39.92%) was higher than the hydrocarbons percent (6.6%). Oleic and palmitic acids are the major FAs (9.48% and 6.14%, respectively). Phytochemical profile uncovered the presence of quercetin, kaempferol, myricetin, and isorhamnetin aglycones and/or glycoside derivatives alongside apigenin, acacetin, and luteolin derivatives. B. pilosa extract suppressed cell proliferation in a concentration-dependent manner against SNB-19 and SK-MEL-5 cell lines (IC 50 1.66 ± 0.06 and 4.04 ± 0.14 mg/mL, respectively). These potentials aligned with the molecular docking results on aldose reductase and kinase enzymes with promising binding affinities (− 5.3 to − 8.89 kcal mol −1 ). B. pilosa metabolites were found as kinases and aldose reductase inhibitors, which rationalize their antiproliferative activity. Unfortunately, toxicity assessments were not performed to assess the safety of B. pilosa extract. Assessment of the therapeutic efficiency via in vivo and clinical studies is required.