Abstract Generation and subsequently accessibility of secondary findings (SF) in diagnostic practice is a subject of debate around the world and particularly in Europe. The French FIND study has been set up to assess patient/parent expectations regarding SF from exome sequencing (ES) and to collect their real-life experience until 1 year after the delivery of results. 340 patients who had ES for undiagnosed developmental disorders were included in this multicenter mixed study (quantitative N = 340; qualitative N = 26). Three groups of actionable SF were rendered: predisposition to late-onset actionable diseases; genetic counseling; pharmacogenomics. Participants expressed strong interest in obtaining SF and a high satisfaction level when a SF is reported. The medical actionability of the SF reinforced parents’ sense of taking action for their child and was seen as an opportunity. While we observed no serious psychological concerns, we showed that these results could have psychological consequences, in particular for late-onset actionable diseases SF, within families already dealing with rare diseases. This study shows that participants remain in favor of accessing SF despite the potential psychological, care, and lifestyle impacts, which are difficult to anticipate. The establishment of a management protocol, including the support of a multidisciplinary team, would be necessary if national policy allows the reporting of these data.

Abstract Objective Prenatal exome sequencing (pES) is now commonly used in clinical practice. It can be used to identifiy an additional diagnosis in around 30% of fetuses with structural defects and normal chromosomal microarray analysis (CMA). However, interpretation remains challenging due to the limited prenatal data for genetic disorders. Method We conducted an ancillary study including fetuses with pathogenic/likely pathogenic variants identified by trio‐pES from the “AnDDI‐Prenatome” study. The prenatal phenotype of each patient was categorized as typical, uncommon, or unreported based on the comparison of the prenatal findings with documented findings in the literature and public phenotype‐genotype databases (ClinVar, HGMD, OMIM, and Decipher). Results Prenatal phenotypes were typical for 38/56 fetuses (67.9%). For the others, genotype‐phenotype associations were challenging due to uncommon prenatal features (absence of recurrent hallmark, rare, or unreported). We report the first prenatal features associated with LINS1 and PGM1 variants. In addition, a double diagnosis was identified in three fetuses. Conclusion Standardizing the description of prenatal features, implementing longitudinal prenatal follow‐up, and large‐scale collection of prenatal features are essential steps to improving pES data interpretation.

Summary

 Integrating genomic medicine into healthcare systems is a health policy challenge that requires continuously transferring scientific advances into clinics and ensuring equal access for patients. France was one of the first countries to integrate genome sequencing into clinical practice at a nationwide level, with the ambition to provide more accurate diagnostics and personalized treatments. Since 2016, the French government has invested €239M in the 2025 French Genomic Medicine Initiative (PFMG2025) which has so far focused on patients with rare diseases (RD), cancer genetic predisposition (CGP) and cancers. PFMG2025 has addressed numerous challenges to set up an operational organizational framework. As of December the 31st 2023, 12,737 results were returned to prescribers for RD/CGP patients (median delivery time: 202 days, diagnostic yield: 30.6%) and 3109 for cancer patients (median delivery time: 45 days). PFMG2025's future priorities encompass ensuring economic sustainability, strengthening links with research, empowering patients and practitioners, and fostering collaborations with European partners. 

Funding

 As of December the 31st 2023, €239M have been invested by the French government.