LL
Lihua Liu
Author with expertise in Genomic Selection in Plant and Animal Breeding
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(75% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
30
/
i10-index:
106
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Dissemination of clinical Escherichia coli strains harboring mcr-1, blaNDM−7 and siderophore-producing plasmids in a Chinese hospital

Lihua Liu et al.Jun 18, 2024
Abstract Background Carbapenem-resistant E. coli (CREco) pose a significant public health threat due to their multidrug resistance. Colistin is often a last-resort treatment against CREco; however, the emergence of colistin resistance gene mcr-1 complicates treatment options. Methods Two E. coli strains (ECO20 and ECO21), recovered from hospitalized patients in distinct wards, exhibited resistance to carbapenems and colistin. Whole-genome sequencing and phenotypic characterization were employed to study resistance patterns, plasmid profiles, transferability of resistance and virulence genes, and siderophore production capabilities. Comparative genome analysis was used to investigate the genetic environment of mcr-1 , bla NDM−7 , and virulence clusters. Results Both E. coli strains exhibited thr presence of both mcr-1 and bla NDM−7 genes, showing high resistance to multiple antibiotics. Genomic analysis revealed the clonal transmission of these strains, possessing identical plasmid profiles (pMCR, pNDM, and pVir) associated with colistin resistance, carbapenem resistance, and virulence factors. Conjugation experiments confirmed the transferability of these plasmids, indicating their potential to disseminate resistance and virulence traits to other strains. Comparative genomic analyses unveiled the distribution of mcr-1 (IncX4-type) and bla NDM (IncX3-type) plasmids across diverse bacterial species, emphasizing their adaptability and threat. The novelty of pVir indicates its potential role in driving the evolution of highly adaptable and pathogenic strains. Conclusions Our findings underscore the co-occurrence of mcr-1 , bla NDM−7 , and siderophore-producing plasmids in E. coli , which poses a significant concern for global health. This research is crucial to unravel the complex mechanisms governing plasmid transfer and recombination and to devise robust strategies to control their spread in healthcare settings.
0

Multicenter Validation of lncRNA and Target mRNA Diagnostic and Prognostic Biomarkers of Acute Ischemic Stroke From Peripheral Blood Leukocytes

Jialing Mu et al.Jul 9, 2024
Background Long noncoding RNA (lncRNA) and mRNA profiles in leukocytes have shown potential as biomarkers for acute ischemic stroke (AIS). This study aimed to identify altered lncRNA and target mRNA profiles in peripheral blood leukocytes as biomarkers and to assess the diagnostic value and association with AIS prognosis. Methods and Results Differentially expressed lncRNAs (DElncRNAs) and differentially expressed target mRNAs (DEmRNAs) were screened by RNA sequencing in the discovery set, which consisted of 10 patients with AIS and 20 controls. Validation sets consisted of a multicenter (311 AIS versus 303 controls) and a nested case–control study (351 AIS versus 352 controls). The discriminative value of DElncRNAs and DEmRNAs added to the traditional risk factors was estimated with the area under the curve. NAMPT‐AS , FARP1‐AS1 , FTH1 , and NAMPT were identified in the multicenter case–control study ( P <0.05). LncRNA NAMPT‐AS was associated with cis‐target mRNA NAMPT and trans‐target mRNA FTH1 in all validation sets ( P <0.001). Similarly, AIS cases exhibited upregulated lncRNA FARP‐AS1 and FTH1 expression ( P <0.001) in the nested case–control study ( P <0.001). Furthermore, lncRNA FARP1‐AS1 expression was upregulated in AIS patients at discharge with an unfavorable outcome ( P <0.001). Positive correlations were found between NAMPT expression level and NIHSS scores of AIS patients ( P <0.05). Adding 2 lncRNAs and 2 target mRNAs to the traditional risk factor model improved area under the curve by 22.8% and 5.2% in the multicenter and the nested case–control studies, respectively. Conclusions lncRNA NAMPT‐AS and FARP1‐AS1 have potential as diagnostic biomarkers for AIS and exhibit good performance when combined with target mRNA NAMPT and FTH1 .
0

Dietary isothiocyanates and anticancer agents: exploring synergism for improved cancer management

Qi Wang et al.Jun 11, 2024
Human studies have shown the anticancer effects of dietary isothiocyanates (ITCs), but there are some inconsistencies, and more evidence supports that such anticancer effect is from higher doses of ITCs. The inconsistencies found in epidemiological studies may be due to many factors, including the biphasic dose-response (so called hormetic effect) of ITCs, which was found to be more profound under hypoxia conditions. In this comprehensive review, we aim to shed light on the intriguing synergistic interactions between dietary ITCs, focusing on sulforaphane (SFN) and various anticancer drugs. Our exploration is motivated by the potential of these combinations to enhance cancer management strategies. While the anticancer properties of ITCs have been recognized, our review delves deeper into understanding the mechanisms and emphasizing the significance of the hormetic effect of ITCs, characterized by lower doses stimulating both normal cells and cancer cells, whereas higher doses are toxic to cancer cells and inhibit their growth. We have examined a spectrum of studies unraveling the multifaceted interaction and combinational effects of ITCs with anticancer agents. Our analysis reveals the potential of these synergies to augment therapeutic efficacy, mitigate chemoresistance, and minimize toxic effects, thereby opening avenues for therapeutic innovation. The review will provide insights into the underlying mechanisms of action, for example, by spotlighting the pivotal role of Nrf2 and antioxidant enzymes in prevention. Finally, we glimpse ongoing research endeavors and contemplate future directions in this dynamic field. We believe that our work contributes valuable perspectives on nutrition and cancer and holds promise for developing novel and optimized therapeutic strategies.
0

Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration

Hui Xu et al.Jun 26, 2024
Inflammation plays a crucial role in the regeneration of fish and avian retinas. However, how inflammation regulates Müller glia (MG) reprogramming remains unclear. Here, we used single-cell RNA sequencing to investigate the cell heterogeneity and interactions of MG and immune cells in the regenerating zebrafish retina. We first showed that two types of quiescent MG (resting MG1 and MG2) reside in the uninjured retina. Following retinal injury, resting MG1 transitioned into an activated state expressing known reprogramming genes, while resting MG2 gave rise to rod progenitors. We further showed that retinal microglia can be categorized into three subtypes (microglia-1, microglia-2, and proliferative) and pseudotime analysis demonstrated dynamic changes in microglial status following retinal injury. Analysis of cell-cell interactions indicated extensive crosstalk between immune cells and MG, with many interactions shared among different immune cell types. Finally, we showed that inflammation activated Jak1-Stat3 signaling in MG, promoting their transition from a resting to an activated state. Our study reveals the cell heterogeneity and crosstalk of immune cells and MG in zebrafish retinal repair, and may provide valuable insights into future mammalian retina regeneration.
Load More