Summary

 Genomic studies of lung adenocarcinoma (LUAD) have advanced our understanding of the disease's biology and accelerated targeted therapy. However, the proteomic characteristics of LUAD remain poorly understood. We carried out a comprehensive proteomics analysis of 103 cases of LUAD in Chinese patients. Integrative analysis of proteome, phosphoproteome, transcriptome, and whole-exome sequencing data revealed cancer-associated characteristics, such as tumor-associated protein variants, distinct proteomics features, and clinical outcomes in patients at an early stage or with EGFR and TP53 mutations. Proteome-based stratification of LUAD revealed three subtypes (S-I, S-II, and S-III) related to different clinical and molecular features. Further, we nominated potential drug targets and validated the plasma protein level of HSP 90β as a potential prognostic biomarker for LUAD in an independent cohort. Our integrative proteomics analysis enables a more comprehensive understanding of the molecular landscape of LUAD and offers an opportunity for more precise diagnosis and treatment.

Directional activation of oxygen-containing groups is a crucial challenge in the catalytic conversion of renewable biomass to high-value products. Herein, we fabricated uniform dispersed NiCo alloy nanoparticles by direct reduction flower-like layer double hydroxides (LDHs) precursors. The as-obtained Ni2Co1AlO exhibited outstanding yield (97.6 %) of tetrahydrofurfuryl alcohol (THFOL) in furfural hydrogenation, which is significantly superior to those of monometallic Ni-based (75 %) and Co-based (0 %) LDH catalysts and even higher than the most noble metal catalysts. The Ni2Co1AlO showed robust stability, e.g., the catalyst can be recycled up to 10 times without loss of its conversion and selectivity, which is attributed to the ultra-dispersed metal cations in layers and the confined effect of metal oxides. Characterizations and theoretical calculations demonstrate that alloying Ni with Co can downshift the d-band center of Ni in NiCo alloys, which facilitates the H* desorption to improve hydrogenation activity. The unique electronic interactions between Ni and Co facilitated the parallel adsorption of furfural while reduced the energy barriers of the furan ring hydrogenation, promoting the production of THFOL. This work provides a promising strategy of tailoring d-band center, which can shed light on the design of heterogeneous catalysts.

The dengue virus (DENV) is primarily transmitted by Aedes aegypti. Investigating genes associated with mosquito susceptibility to DENV2 offers a theoretical foundation for targeted interventions to regulate or block viral replication and transmission within mosquitoes. Based on the transcriptomic analyses of the midgut and salivary glands from Aedes aegypti infected with DENV2, alongside analyses of Aag2 cell infections, 24 genes potentially related to the regulation of Aedes aegypti infection with DENV2 were selected. By establishing transient transfection and overexpression models of Aedes aegypti Aag2 cells, and mosquito target gene interference models, the difference in viral load before and after treatment was compared, and the effects of DEGs on viral replication were evaluated. After overexpressing 24 DEGs in Aag2 cells, 19 DEGs showed a significant difference in DENV2 RNA copies in the cell supernatant (p < 0.05). In adult mosquitoes, knocking down defensin-A, defensin-A-like, and SMCT1 respectively reduced the DENV2 RNA copies, while knocking down UGT2B1 and ND4 respectively increased the DENV2 RNA copies. In this study, to assess the role of genes related to DENV2 replication, and transient transfection and overexpression models in Aag2 cells and mosquito gene knockdown models were established, and five genes, defensin-A, defensin-A-like, SMCT1, UGT2B1, and ND4, were found to have an impact on the replication of DENV2, providing a reference basis for studying the complex mechanism of mosquito–virus interactions.